seq1 = pF1KE2350.tfa, 1338 bp
seq2 = pF1KE2350/gi568815591r_73470542.tfa (gi568815591r:73470542_73678549), 208008 bp

>pF1KE2350 1338
>gi568815591r:73470542_73678549 (Chr7)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-261  (104037-104167)   100% ->
262-446  (104428-104612)   100% ->
447-598  (105079-105230)   100% ->
599-725  (105580-105706)   100% ->
726-878  (107209-107361)   100% ->
879-1309  (107578-108009)   99% ->
1310-1338  (108041-108069)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTCTCGCAGATGTCGGAGCTCATGGGGCTGTCGGTGTTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTCTCGCAGATGTCGGAGCTCATGGGGCTGTCGGTGTTGCTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGGCCCTGATGGCGACGGCGGCGGTAGCGCGGGGGTGGCTGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGGCCCTGATGGCGACGGCGGCGGTAGCGCGGGGGTGGCTGCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGGGAGGAGAGGAGCGGCCGGCCCGCCT         GCCAAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 CGGGGGAGGAGAGGAGCGGCCGGCCCGCCTGTA...TAGGCCAAAAAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGGATTTCCACCTGACAAATCTTCGGGATCCAAGAAGCAGAAACAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104048 AATGGATTTCCACCTGACAAATCTTCGGGATCCAAGAAGCAGAAACAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAGCGGATTCGGAAGGAGAAGCCTCAACAACACAACTTCACCCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104098 TCAGCGGATTCGGAAGGAGAAGCCTCAACAACACAACTTCACCCACCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTGGCTGCAGCTCTGAAG         AGCCACAGCGGGAACATATCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104148 TCCTGGCTGCAGCTCTGAAGGTA...TAGAGCCACAGCGGGAACATATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCATGGACTTTAGCAGCAATGGCAAATACCTGGCTACCTGTGCAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104449 TGCATGGACTTTAGCAGCAATGGCAAATACCTGGCTACCTGTGCAGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGCACCATCCGCATCTGGAGCACCAAGGACTTCCTGCAGCGAGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104499 TCGCACCATCCGCATCTGGAGCACCAAGGACTTCCTGCAGCGAGAGCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAGCATGAGAGCCAACGTGGAGCTGGACCACGCCACCCTGGTGCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104549 GCAGCATGAGAGCCAACGTGGAGCTGGACCACGCCACCCTGGTGCGCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCCCTGACTGCAG         AGCCTTCATCGTCTGGCTGGCCAACGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104599 AGCCCTGACTGCAGGTG...TAGAGCCTTCATCGTCTGGCTGGCCAACGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGACACCCTCCGTGTCTTCAAGATGACCAAGCGGGAGGATGGGGGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105106 GGACACCCTCCGTGTCTTCAAGATGACCAAGCGGGAGGATGGGGGCTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCTTCACAGCCACCCCAGAGGACTTCCCTAAAAAGCACAAGGCGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105156 CCTTCACAGCCACCCCAGAGGACTTCCCTAAAAAGCACAAGGCGCCTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCGACATTGGCATTGCTAACACAG         GGAAGTTTATCATGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105206 ATCGACATTGGCATTGCTAACACAGGTA...CAGGGAAGTTTATCATGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCCTCCAGTGACACCACTGTCCTCATCTGGAGCCTGAAGGGTCAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105596 TGCCTCCAGTGACACCACTGTCCTCATCTGGAGCCTGAAGGGTCAAGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGTCTACCATCAACACCAACCAGATGAACAACACACACGCTGCTGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105646 TGTCTACCATCAACACCAACCAGATGAACAACACACACGCTGCTGTATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCCTGTGGCAG         ATTTGTAGCCTCGTGTGGCTTCACCCCAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105696 CCCTGTGGCAGGTG...CAGATTTGTAGCCTCGTGTGGCTTCACCCCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTGAAGGTTTGGGAAGTCTGCTTTGGAAAGAAGGGGGAGTTCCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107239 TGTGAAGGTTTGGGAAGTCTGCTTTGGAAAGAAGGGGGAGTTCCAGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGTGCGAGCCTTCGAACTAAAGGGCCACTCCGCGGCTGTGCACTCGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107289 TGGTGCGAGCCTTCGAACTAAAGGGCCACTCCGCGGCTGTGCACTCGTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCTTTCTCCAACGACTCACGGAG         GATGGCTTCTGTCTCCAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107339 GCTTTCTCCAACGACTCACGGAGGTG...CAGGATGGCTTCTGTCTCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGATGGTACATGGAAACTGTGGGACACAGATGTGGAATACAAGAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107596 GGATGGTACATGGAAACTGTGGGACACAGATGTGGAATACAAGAAGAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGGACCCCTACTTGCTGAAGACAGGCCGCTTTGAAGAGGCGGCGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107646 AGGACCCCTACTTGCTGAAGACAGGCCGCTTTGAAGAGGCGGCGGGTGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCGCCGTGCCGCCTGGCCCTCTCCCCCAACGCCCAGGTCTTGGCCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107696 GCGCCGTGCCGCCTGGCCCTCTCCCCCAACGCCCAGGTCTTGGCCTTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAGTGGCAGTAGTATTCATCTCTACAATACCCGGCGGGGCGAGAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107746 CAGTGGCAGTAGTATTCATCTCTACAATACCCGGCGGGGCGAGAAGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGTGCTTTGAGCGGGTCCATGGCGAGTGTATCGCCAACTTGTCCTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107796 AGTGCTTTGAGCGGGTCCATGGCGAGTGTATCGCCAACTTGTCCTTTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATCACTGGCCGCTTTCTGGCCTCCTGTGGGGACCGGGCGGTGCGGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107846 ATCACTGGCCGCTTTCTGGCCTCCTGTGGGGACCGGGCGGTGCGGCTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCACAACACTCCTGGCCACCGAGCCATGGTGGAGGAGATGCAGGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107896 TCACAACACTCCTGGCCACCGAGCCATGGTGGAGGAGATGCAGGGCCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGAAGCGGGCCTCCAACGAGAGCACCCGCCAGAGGCTGCAGCAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107946 TGAAGCGGGCCTCCAACGAGAGCACCCGCCAGAGGCTGCAGCAGCAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACCCAGGCCCAAG          TGACTCTGGGAGGGCCCGGCGCAGAGG
        |||||||||||||->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107996 ACCCAGGCCCAAGAGAC...AAGTGACTCTGGGAGGGCCCGGCGCAGAGG

   1400 
   1337 AT
        ||
 108068 AT