seq1 = pF1KE2345.tfa, 1077 bp
seq2 = pF1KE2345/gi568815579r_5731491.tfa (gi568815579r:5731491_5932567), 201077 bp

>pF1KE2345 1077
>gi568815579r:5731491_5932567 (Chr19)

(complement)

1-1077  (100001-101077)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCCCTGGGCCCGGCCAAGCCACAGTGGTCGTGGCGCTGCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCCCTGGGCCCGGCCAAGCCACAGTGGTCGTGGCGCTGCTGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCACGCTGCTGTTTCAGCTGCTGATGGCTGTGTGTTTCTTCTCCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCACGCTGCTGTTTCAGCTGCTGATGGCTGTGTGTTTCTTCTCCTATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCGTGTGTCTCAAGACGATCCCACTGTGTACCCTAATGGGTCCCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCGTGTGTCTCAAGACGATCCCACTGTGTACCCTAATGGGTCCCGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAGACAGCACAGGGACCCCCGCCCACTCCATCCCCCTGATCCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCAGACAGCACAGGGACCCCCGCCCACTCCATCCCCCTGATCCTGCTGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACGTGGCCTTTTAACAAACCCATAGCTCTGCCCCGCTGCTCAGAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACGTGGCCTTTTAACAAACCCATAGCTCTGCCCCGCTGCTCAGAGATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCTGGCACGGCTGACTGCAACATCACTGCCGACCGCAAGGTGTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCTGGCACGGCTGACTGCAACATCACTGCCGACCGCAAGGTGTATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGCAGACGCGGTCATCGTGCACCACCGAGAGGTCATGTACAACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGCAGACGCGGTCATCGTGCACCACCGAGAGGTCATGTACAACCCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCCAGCTCCCACGCTCCCCGAGGCGGCAGGGGCAGCGATGGATCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCCCAGCTCCCACGCTCCCCGAGGCGGCAGGGGCAGCGATGGATCTGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAGCATGGAGTCCCCAAGCCACTGCTGGCAGCTGAAAGCCATGGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAGCATGGAGTCCCCAAGCCACTGCTGGCAGCTGAAAGCCATGGACGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACTTCAATCTCACCATGTCCTACCGCAGCGACTCCGACATCTTCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACTTCAATCTCACCATGTCCTACCGCAGCGACTCCGACATCTTCACGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACGGCTGGCTGGAGCCGTGGTCCGGCCAGCCTGCCCACCCACCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTACGGCTGGCTGGAGCCGTGGTCCGGCCAGCCTGCCCACCCACCGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTCTCGGCCAAGACCGAGCTGGTGGCCTGGGCAGTGTCCAACTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTCTCGGCCAAGACCGAGCTGGTGGCCTGGGCAGTGTCCAACTGGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCAAACTCCGCCAGGGTGCGCTACTACCAGAGCCTGCAGGCCCATCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCAAACTCCGCCAGGGTGCGCTACTACCAGAGCCTGCAGGCCCATCTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGGACGTGTACGGACGCTCCCACAAGCCCCTGCCCCAGGGAACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGGACGTGTACGGACGCTCCCACAAGCCCCTGCCCCAGGGAACCATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGAGACGCTGTCCCGGTACAAGTTCTATCTGGCCTTCGAGAACTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGAGACGCTGTCCCGGTACAAGTTCTATCTGGCCTTCGAGAACTCCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CACCCCGACTACATCACCGAGAAGCTGTGGAGGAACGCCCTGGAGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CACCCCGACTACATCACCGAGAAGCTGTGGAGGAACGCCCTGGAGGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCGTGCCCGTGGTGCTGGGCCCCAGCAGAAGCAACTACGAGAGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCGTGCCCGTGGTGCTGGGCCCCAGCAGAAGCAACTACGAGAGGTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCCACCCGACGCCTTCATCCACGTGGACGACTTCCAGAGCCCCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCCACCCGACGCCTTCATCCACGTGGACGACTTCCAGAGCCCCAAGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGGCCCGGTACCTGCAGGAGCTGGACAAGGACCACGCCCGCTACCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGGCCCGGTACCTGCAGGAGCTGGACAAGGACCACGCCCGCTACCTGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTACTTTCGCTGGCGGGAGACGCTGCGGCCTCGCTCCTTCAGCTGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTACTTTCGCTGGCGGGAGACGCTGCGGCCTCGCTCCTTCAGCTGGGCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCGCTTTCTGCAAGGCCTGCTGGAAACTGCAGGAGGAATCCAGGTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCGCTTTCTGCAAGGCCTGCTGGAAACTGCAGGAGGAATCCAGGTACCAG

   1050     .    :    .    :    .
   1051 ACACGCGGCATAGCGGCTTGGTTCACC
        |||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACACGCGGCATAGCGGCTTGGTTCACC