seq1 = pF1KE2343.tfa, 1959 bp
seq2 = pF1KE2343/gi568815586r_51720455.tfa (gi568815586r:51720455_51922413), 201959 bp

>pF1KE2343 1959
>gi568815586r:51720455_51922413 (Chr12)

(complement)

1-1959  (100001-101959)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACTGGACACCAGAACACGCCCAGCCCCTCAACCAGTGGCCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACTGGACACCAGAACACGCCCAGCCCCTCAACCAGTGGCCAGAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACCTGGACGTCTCCTCCACCACCCCGTCGCCGGCCCACAAGTTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACCTGGACGTCTCCTCCACCACCCCGTCGCCGGCCCACAAGTTGGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCCCTGGGGGTCGCCAACGCTGCCACTACGCTTGGGCACACGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCCCTGGGGGTCGCCAACGCTGCCACTACGCTTGGGCACACGACGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTCAGCCCTCACTGCCTCCAACCTCCTAAAGCGCTATGCAGAGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTCAGCCCTCACTGCCTCCAACCTCCTAAAGCGCTATGCAGAGAAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCTGGGGTCTTGGATTCTCCCTACGAGCGTCCGGCCCTGGGCGGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCTGGGGTCTTGGATTCTCCCTACGAGCGTCCGGCCCTGGGCGGGTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGACGCCTCCTTCCTCAACGGCGCCAAAGGGGATCCCGAGCCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGACGCCTCCTTCCTCAACGGCGCCAAAGGGGATCCCGAGCCCTGGCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGCCGGAGCCACCCTACCCCTTGGCCTCACTCCACGAAGGCCTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGCCGGAGCCACCCTACCCCTTGGCCTCACTCCACGAAGGCCTCCCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AACCAAATCGGGCGGTGGCGGCGGTTCCGGGGCCCTGGGGGGCTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AACCAAATCGGGCGGTGGCGGCGGTTCCGGGGCCCTGGGGGGCTCCCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTTAGCCGGGAACCTCCCTGAACCCCTCTACGCCGGCAATGCGTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTTAGCCGGGAACCTCCCTGAACCCCTCTACGCCGGCAATGCGTGCGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCCCATCGGCGGCGCCCGAGTACGCGGCCGGCTACGGCGGGGGGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCCCATCGGCGGCGCCCGAGTACGCGGCCGGCTACGGCGGGGGGTACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCGCCGGGTTACTGCGCGCAGACGGGCGCCGCGCTGCCCCCGCCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCGCCGGGTTACTGCGCGCAGACGGGCGCCGCGCTGCCCCCGCCGCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGGCCGCGCTCCTGCAGCCCCCACCGCCTCCGGGGTACGGGCCCTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGGCCGCGCTCCTGCAGCCCCCACCGCCTCCGGGGTACGGGCCCTCAGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCGCTGTACAACTATCCCGCAGGGGGCTACGCAGCGCAGCCCGGCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCGCTGTACAACTATCCCGCAGGGGGCTACGCAGCGCAGCCCGGCTATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGCGCTCCCGCCGCCCCCAGGCCCACCCCCGGCCCCCTACCTGACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGCGCTCCCGCCGCCCCCAGGCCCACCCCCGGCCCCCTACCTGACCCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCTGCCCGCGCCCACGCCCCTGCCCGCGCCGGCACCGCCCACCGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCTGCCCGCGCCCACGCCCCTGCCCGCGCCGGCACCGCCCACCGCCTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCTTCCCCACGGCCGCGCCGGGTGCCGAATCCGGGCTGTCGCTGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCTTCCCCACGGCCGCGCCGGGTGCCGAATCCGGGCTGTCGCTGAAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGGCCGCCGACGAGGGGCCCGAGGGCCGCTACCGCAAGTACGCGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAGGCCGCCGACGAGGGGCCCGAGGGCCGCTACCGCAAGTACGCGTACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCCCGCCAAGGCCCCCGTGGCTGACGGAGCCTCCTACCCCGCCGCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCCCGCCAAGGCCCCCGTGGCTGACGGAGCCTCCTACCCCGCCGCGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACGGCGAATGTCGGGGCAACGGGTTCCGGGCCAAGCCGCCAGGAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACGGCGAATGTCGGGGCAACGGGTTCCGGGCCAAGCCGCCAGGAGCCGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGGAGGCGTCGGGCAAGTACGGTGGCGGCGTCCCCCTCAAGGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGGAGGCGTCGGGCAAGTACGGTGGCGGCGTCCCCCTCAAGGTCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCTCCCCCGTCTACGGCCCGCAACTGGAGCCCTTTGAAAAGTTCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCTCCCCCGTCTACGGCCCGCAACTGGAGCCCTTTGAAAAGTTCCCGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CGGGCCCCGGCTCCTCGTGGGGGGTTCGCCGTGCCGTCGGGGGAGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CGGGCCCCGGCTCCTCGTGGGGGGTTCGCCGTGCCGTCGGGGGAGACTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAAAGGCGTGGACCCTGGGGCCCTGGAGCTGGTGACGAGCAAGATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAAAGGCGTGGACCCTGGGGCCCTGGAGCTGGTGACGAGCAAGATGGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACTGCGGGCCCCCGGTGCAGTGGGCGGATGTGGCGGGCCAGGGCGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACTGCGGGCCCCCGGTGCAGTGGGCGGATGTGGCGGGCCAGGGCGCGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGGCGGCGCTGGAGGAGGAGCTGGTGTGGCCCCTGCTCAGGCCGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGGCGGCGCTGGAGGAGGAGCTGGTGTGGCCCCTGCTCAGGCCGCCCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTACCCGGGCAGCCTGCGCCCGCCGCGGACCGTCCTGCTCTTTGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTACCCGGGCAGCCTGCGCCCGCCGCGGACCGTCCTGCTCTTTGGGCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GGGGCGCGGGCAAAGCGCTGCTGGGCCGCTGCCTCGCCACGCAGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GGGGCGCGGGCAAAGCGCTGCTGGGCCGCTGCCTCGCCACGCAGCTGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCACGCTGTTGCGCCTGCGCGGCGCGACCCTGGCTGCGCCCGGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCCACGCTGTTGCGCCTGCGCGGCGCGACCCTGGCTGCGCCCGGCGCCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGAGGGCGCGCGCCTCCTCCAGGCCGCCTTCGCGGCCGCGCGCTGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CGAGGGCGCGCGCCTCCTCCAGGCCGCCTTCGCGGCCGCGCGCTGCCGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CACCCTCCGTACTCCTCATCAGCGAGCTAGAGGCGCTGCTCCCCGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CACCCTCCGTACTCCTCATCAGCGAGCTAGAGGCGCTGCTCCCCGCCCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GACGACGGCGCGGCGGCAGGGGGCGCGCTGCAGGTGCCGCTCCTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GACGACGGCGCGGCGGCAGGGGGCGCGCTGCAGGTGCCGCTCCTGGCCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CCTGGACGGGGGCTGCGGCGCGGGGGCTGACGGCGTGCTGGTTGTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CCTGGACGGGGGCTGCGGCGCGGGGGCTGACGGCGTGCTGGTTGTGGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCACCTCGCGGCCCGCGGCTCTGGACGAGGCGACCCGCCGGCGCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCACCTCGCGGCCCGCGGCTCTGGACGAGGCGACCCGCCGGCGCTTCTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CTCCGCTTCTACGTGGCGCTGCCCGACAGCCCGGCCCGCGGGCAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CTCCGCTTCTACGTGGCGCTGCCCGACAGCCCGGCCCGCGGGCAGATCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GCAGCGGGCGCTGGCCCAGCAGGGCTGCGCGCTCAGTGAGCGGGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GCAGCGGGCGCTGGCCCAGCAGGGCTGCGCGCTCAGTGAGCGGGAACTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CGGCGCTGGTGCAGGGCACGCAGGGCTTCTCTGGGGGCGAGCTGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CGGCGCTGGTGCAGGGCACGCAGGGCTTCTCTGGGGGCGAGCTGGGGCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CTGTGCCAGCAGGCGGCGGCCGGGGCGGGCCTCCCGGGGCTGCAGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CTGTGCCAGCAGGCGGCGGCCGGGGCGGGCCTCCCGGGGCTGCAGCGCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CCTCTCCTACAAGGACCTGGAGGCGGCGCTGGCCAAGGTGGGCCCTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CCTCTCCTACAAGGACCTGGAGGCGGCGCTGGCCAAGGTGGGCCCTAGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CCTCTGCCAAGGAACTGGACTCGTTCGTGGAGTGGGACAAAATGTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCTCTGCCAAGGAACTGGACTCGTTCGTGGAGTGGGACAAAATGTACGGC

   1950     .
   1951 TCCGGACAC
        |||||||||
 101951 TCCGGACAC