seq1 = pF1KE2340.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KE2340/gi568815582r_30324236.tfa (gi568815582r:30324236_30529980), 205745 bp

>pF1KE2340 510
>gi568815582r:30324236_30529980 (Chr16)

(complement)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-212  (100814-100924)   100% ->
213-510  (105448-105745)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTGGCCGGTGGGGAGATTCGTGGGGACACGGGGGGAGAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTGGCCGGTGGGGAGATTCGTGGGGACACGGGGGGAGAGGACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGCTCCCGGCCGGTTCAGCTTCAGCCCGGAGCCCACGCTCGAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGCTCCCGGCCGGTTCAGCTTCAGCCCGGAGCCCACGCTCGAGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 T         CCGCCGCCTCCATGCTGAGTTTGCTGCGGAACGAGACTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTA...CAGCCGCCGCCTCCATGCTGAGTTTGCTGCGGAACGAGACTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAACAGTTCCATCAGCCTCGGAATCTCCTCCTGGCCTTGGTTGGGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 GAACAGTTCCATCAGCCTCGGAATCTCCTCCTGGCCTTGGTTGGGGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGGGAGCTGGCAGAACTCTT         TCAGTGGAAAACCGATGGGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100904 GGGGGAGCTGGCAGAACTCTTGTG...TAGTCAGTGGAAAACCGATGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACCTGGCCCCCAAGGCTGGTCCCCCAGGGAACGGGCAGCCCTTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105468 AACCTGGCCCCCAAGGCTGGTCCCCCAGGGAACGGGCAGCCCTTCAAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCTTAGTGACGTCCTCATCTACCTGGTGGCATTAGCAGCCCGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105518 GAGCTTAGTGACGTCCTCATCTACCTGGTGGCATTAGCAGCCCGCTGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGGATCTGCCGCTAGCAGTGCTCTCCAAAATGGACATCAACCGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105568 TGTGGATCTGCCGCTAGCAGTGCTCTCCAAAATGGACATCAACCGGCGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCTACCCAGCCCATCTGGCCCGCAGCTCTTCCCGCAAGTATACAGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105618 GCTACCCAGCCCATCTGGCCCGCAGCTCTTCCCGCAAGTATACAGAATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCCATGGGGCCATCTCTGAAGACCAGGCTGTGGGGCCTGCGGACATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105668 CCCCATGGGGCCATCTCTGAAGACCAGGCTGTGGGGCCTGCGGACATTCC

    500     .    :    .    :    .
    483 CTGTGACTCCACAGGCCAGACCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 105718 CTGTGACTCCACAGGCCAGACCTCAACC