seq1 = pF1KE2339.tfa, 870 bp
seq2 = pF1KE2339/gi568815588r_133262871.tfa (gi568815588r:133262871_133473333), 210463 bp

>pF1KE2339 870
>gi568815588r:133262871_133473333 (Chr10)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-286  (102577-102774)   100% ->
287-414  (103303-103430)   100% ->
415-514  (104312-104411)   100% ->
515-619  (106341-106445)   99% ->
620-739  (107239-107358)   100% ->
740-807  (108609-108676)   100% ->
808-870  (110401-110463)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCCTGCGTGTCCTGCTGTCCTGCGTCCGCGGCCCGCTGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCCCTGCGTGTCCTGCTGTCCTGCGTCCGCGGCCCGCTGAGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGGTTCGCTGTCCCGCCTGGCGTCCCTTCGCCTCGG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 CCCGGTTCGCTGTCCCGCCTGGCGTCCCTTCGCCTCGGGTG...CAGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTAACTTTGAGTACATCATCGCAGAAAAAAGAGGGAAGAATAACACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 CTAACTTTGAGTACATCATCGCAGAAAAAAGAGGGAAGAATAACACCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGTTGATCCAACTGAACCGCCCCAAGGCCCTCAATGCACTTTGCGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102630 GGGTTGATCCAACTGAACCGCCCCAAGGCCCTCAATGCACTTTGCGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGATTGACGAGCTCAACCAGGCCCTGAAGACCTTCGAGGAGGACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102680 CCTGATTGACGAGCTCAACCAGGCCCTGAAGACCTTCGAGGAGGACCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGTGGGGGCCATTGTCCTCACCGGCGGGGATAAGGCCTTTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102730 CCGTGGGGGCCATTGTCCTCACCGGCGGGGATAAGGCCTTTGCAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     CTGGAGCTGATATCAAGGAAATGCAGAACCTGAGTTTCCAGGACTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102780 .TAGCTGGAGCTGATATCAAGGAAATGCAGAACCTGAGTTTCCAGGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACTCCAGCAAGTTCTTGAAGCACTGGGACCACCTCACCCAGGTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103349 TTACTCCAGCAAGTTCTTGAAGCACTGGGACCACCTCACCCAGGTCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCCAGTCATCGCTGCTGTCAATGGCTATGCC         TTTGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103399 AGCCAGTCATCGCTGCTGTCAATGGCTATGCCGTG...CAGTTTGGCGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCTGTGAGCTTGCCATGATGTGTGATATCATCTATGCCGGTGAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104321 GGCTGTGAGCTTGCCATGATGTGTGATATCATCTATGCCGGTGAGAAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAGTTTGCACAGCCGGAGATCTTAATAGGAACCATCCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 104371 CCAGTTTGCACAGCCGGAGATCTTAATAGGAACCATCCCAGGTA...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGCGGGCGGCACCCAGAGACTCACCCGTGCTGTTGGGAAGTCGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106341 GTGCGGGCGGCACCCAGAGACTCACCCGTGCTGTTGGGAAGTCGCTGGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGGAGATGGTCCTCACCGGTGACCGGATCTCAGCCCAGGACGCCAAGCA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 106391 ATGGAGATGGTCCTCACTGGTGACCGGATCTCAGCCCAGGACGCCAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGCAG         GTCTTGTCAGCAAGATTTGTCCTGTTGAGACACTGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106441 AGCAGGTA...CAGGTCTTGTCAGCAAGATTTGTCCTGTTGAGACACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAAGAAGCCATCCAGTGTGCAGAAAAAATTGCCAGCAATTCTAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107275 TGGAAGAAGCCATCCAGTGTGCAGAAAAAATTGCCAGCAATTCTAAAATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTAGTAGCGATGGCCAAAGAATCAGTGAATGCAG         CTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107325 GTAGTAGCGATGGCCAAAGAATCAGTGAATGCAGGTA...CAGCTTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AATGACATTAACAGAAGGAAGTAAGTTGGAGAAGAAACTCTTTTATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108616 AATGACATTAACAGAAGGAAGTAAGTTGGAGAAGAAACTCTTTTATTCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCTTTGCCACT         GATGACCGGAAAGAAGGGATGACCGCGTTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 108666 CCTTTGCCACTGTG...CAGGATGACCGGAAAGAAGGGATGACCGCGTTT

    900     .    :    .    :    .    :
    838 GTGGAAAAGAGAAAGGCCAACTTCAAAGACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 110431 GTGGAAAAGAGAAAGGCCAACTTCAAAGACCAG