seq1 = pF1KE2333.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KE2333/gi568815579r_35398719.tfa (gi568815579r:35398719_35613402), 214684 bp

>pF1KE2333 1425
>gi568815579r:35398719_35613402 (Chr19)

(complement)

1-426  (99928-100353)   100% ->
427-627  (100613-100813)   100% ->
628-684  (100926-100982)   100% ->
685-735  (101590-101640)   100% ->
736-915  (101810-101992)   97% ->
916-984  (103151-103219)   100% ->
985-1035  (103442-103492)   100% ->
1036-1083  (107417-107464)   100% ->
1084-1131  (107638-107685)   100% ->
1132-1188  (110517-110573)   100% ->
1189-1236  (111220-111267)   100% ->
1237-1284  (112823-112870)   97% ->
1285-1356  (113374-113445)   100% ->
1357-1380  (114506-114529)   100% ->
1381-1425  (114640-114684)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTCCAGGGGCCCCTGGCCTGCCTCCTGCTGGCCCTCTGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99928 ATGAAGTTCCAGGGGCCCCTGGCCTGCCTCCTGCTGGCCCTCTGCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTGGGGAGGCTGGCCCCCTGCAGAGCGGAGAGGAAAGCACTGGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99978 CAGTGGGGAGGCTGGCCCCCTGCAGAGCGGAGAGGAAAGCACTGGGACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATATTGGGGAGGCCCTTGGACATGGCCTGGGAGACGCCCTGAGCGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 ATATTGGGGAGGCCCTTGGACATGGCCTGGGAGACGCCCTGAGCGAAGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGGAAAGGCCATTGGCAAAGAGGCCGGAGGGGCAGCTGGCTCTAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 GTGGGAAAGGCCATTGGCAAAGAGGCCGGAGGGGCAGCTGGCTCTAAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGTGAGGCCCTTGGCCAAGGGACCAGAGAAGCAGTTGGCACTGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 CAGTGAGGCCCTTGGCCAAGGGACCAGAGAAGCAGTTGGCACTGGAGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCAGGTTCCAGGCTTTGGCGTAGCAGATGCTTTGGGCAACAGGGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100178 GGCAGGTTCCAGGCTTTGGCGTAGCAGATGCTTTGGGCAACAGGGTCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAGCAGCCCATGCTCTGGGAAACACTGGGCACGAGATTGGCAGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100228 GAAGCAGCCCATGCTCTGGGAAACACTGGGCACGAGATTGGCAGACAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAAGATGTCATTCGACACGGAGCAGATGCTGTCCGCGGCTCCTGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100278 AGAAGATGTCATTCGACACGGAGCAGATGCTGTCCGCGGCTCCTGGCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGTGCCTGGCCACAATGGTGCTTGG         GAAACTTCTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100328 GGGTGCCTGGCCACAATGGTGCTTGGGTG...CAGGAAACTTCTGGAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CATGGCATCTTTGGCTCTCAAGGTGGCCTTGGAGGCCAGGGCCAGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100628 CATGGCATCTTTGGCTCTCAAGGTGGCCTTGGAGGCCAGGGCCAGGGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCCTGGAGGTCTGGGGACTCCGTGGGTCCACGGATACCCCGGAAACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100678 TCCTGGAGGTCTGGGGACTCCGTGGGTCCACGGATACCCCGGAAACTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGGCAGCTTTGGAATGAATCCTCAGGGAGCTCCCTGGGGTCAAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100728 CAGGCAGCTTTGGAATGAATCCTCAGGGAGCTCCCTGGGGTCAAGGAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AATGGAGGGCCACCAAACTTTGGGACCAACACTCAG         GGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100778 AATGGAGGGCCACCAAACTTTGGGACCAACACTCAGGTA...CAGGGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGTGGCCCAGCCTGGCTATGGTTCAGTGAGAGCCAGCAACCAGAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100931 TGTGGCCCAGCCTGGCTATGGTTCAGTGAGAGCCAGCAACCAGAATGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GG         TGCACGAATCCCCCACCATCTGGCTCAGGTGGAGGCTCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100981 GGGTA...CAGTGCACGAATCCCCCACCATCTGGCTCAGGTGGAGGCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGCAACTCTGGG         GGAGGCAGCGGCTCACAGTCGGGCAGCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101629 AGCAACTCTGGGGTG...CAGGGAGGCAGCGGCTCACAGTCGGGCAGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGGCAGTGGCAGCAATGGTGACAACAACAATGGCAGCAGCA   GTGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||
 101839 TGGCAGTGGCAGCAATGGTGACAACAACAATGGCAGCAGCAGTGGTGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    812 GCAGCAGTGGCAGCAGCAGTGGCAGCAGCAGTGGCGGCAGCAGTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 101889 GCAGCAGTGGCAGCAGCAGTGGCGGCAGCAGTGGCGGCAGCAGTGGTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862 AGCAGTGGCAACAGTGGTGGCAGCAGAGGTGACAGCGGCAGTGAGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101939 AGCAGTGGCAACAGTGGTGGCAGCAGAGGTGACAGCGGCAGTGAGTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    912 CTGG         GGATCCAGCACCGGCTCCTCCTCCGGCAACCACGGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101989 CTGGGTG...CAGGGATCCAGCACCGGCTCCTCCTCCGGCAACCACGGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    953 GGAGCGGCGGAGGAAATGGACATAAACCCGGG         TGTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103188 GGAGCGGCGGAGGAAATGGACATAAACCCGGGGTG...CAGTGTGAAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994 CCAGGGAATGAAGCCCGCGGGAGCGGGGAATCTGGGATTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103451 CCAGGGAATGAAGCCCGCGGGAGCGGGGAATCTGGGATTCAGGTG...TA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1036  AACTCTGAGACGTCTCCTGGGATGTTTAACTTTGACACTTTCTGGAAG 
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 107416 GAACTCTGAGACGTCTCCTGGGATGTTTAACTTTGACACTTTCTGGAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084         AATTTTAAATCCAAGCTGGGTTTCATCAACTGGGATGCCATA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107466 TG...TAGAATTTTAAATCCAAGCTGGGTTTCATCAACTGGGATGCCATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1126 AACAAG         AACCAGGTCCCGCCCCCCAGCACCCGAGCCCTCCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107680 AACAAGGTA...CAGAACCAGGTCCCGCCCCCCAGCACCCGAGCCCTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1167 CTACTTCAGCCGACTCTGGGAG         GATTTCAAACAGAACACTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110552 CTACTTCAGCCGACTCTGGGAGGTA...CAGGATTTCAAACAGAACACTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1208 CTTTCCTCAACTGGAAAGCAATTATTGAG         GGTGCGGACGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 111239 CTTTCCTCAACTGGAAAGCAATTATTGAGGTA...CAGGGTGCGGACGCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1249 TCATCACTGCAGAAACGTGCAGGCAGAGCCGATCAG         AACTA
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||>>>...>>>|||||
 112835 TCATCACTGCAGAAACGTGCAGGCAGAGACGATCAGGTG...CAGAACTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1290 CAATTACAACCAGCATGCGTATCCCACTGCCTATGGTGGGAAGTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113379 CAATTACAACCAGCATGCGTATCCCACTGCCTATGGTGGGAAGTACTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1340 TCAAGACCCCTGCAAAG         GGGGGAGTCTCACCTTCTTCCTCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 113429 TCAAGACCCCTGCAAAGGTG...CAGGGGGGAGTCTCACCTTCTTCCTCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1381          GCTTCCCGGGTGCAACCTGGCCTGCTGCAGTGGGTGAAGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114530 GTG...CAGGCTTCCCGGGTGCAACCTGGCCTGCTGCAGTGGGTGAAGTT

   1550 
   1422 TTGG
        ||||
 114681 TTGG