seq1 = pF1KE2331.tfa, 2181 bp
seq2 = pF1KE2331/gi568815591r_36755554.tfa (gi568815591r:36755554_37442690), 687137 bp

>pF1KE2331 2181
>gi568815591r:36755554_37442690 (Chr7)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-119  (126731-126771)   100% ->
120-192  (127769-127841)   100% ->
193-243  (170809-170859)   100% ->
244-413  (183341-183510)   99% ->
414-449  (198300-198335)   100% ->
450-549  (209497-209596)   100% ->
550-701  (217661-217812)   100% ->
702-780  (219998-220076)   100% ->
781-831  (225996-226046)   100% ->
832-954  (229234-229356)   100% ->
955-1086  (231174-231305)   100% ->
1087-1191  (309457-309561)   100% ->
1192-1300  (345964-346072)   100% ==
1436-1601  (547672-547837)   100% ->
1602-1714  (555019-555131)   100% ->
1715-1822  (564574-564681)   100% ->
1823-1905  (572216-572298)   100% ->
1906-1983  (580955-581032)   100% ->
1984-2181  (586940-587137)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCCCAAACTCATGGAAATTGATCAG         AAAAAACCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 CTACCCCAAACTCATGGAAATTGATCAGGTT...CAGAAAAAACCACTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGG         GTGGTCTCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 126744 CTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTA...AAGGTGGTCTCTTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AACCATGAATATTTTGCACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127782 AACCATGAATATTTTGCACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACAGAAAAG         AACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 127832 CACAGAAAAGGTA...CAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTCGATTAACCACATCTCCA         GCTCAGAACGCCCAGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 170840 TTCGATTAACCACATCTCCAGTA...AAGGCTCAGAACGCCCAGCAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGCCAAGCTGGAAGCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183362 CATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGCCAAGCTGGAAGCCCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183412 GGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACCTGGACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||>
 183462 ACCTGGACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTGGAGAGCGGCACTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414         GCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAGCCTTG      
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 183512 TA...CAGGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAGCCTTGGTA...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    450    CTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209494 CAGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGGACCATGGCATAGTGTCCTGGGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209544 TGGACCATGGCATAGTGTCCTGGGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAG         ATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209594 AAGGTA...CAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GATCCTGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217699 GATCCTGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAGATCACCATCGGCCAGCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217749 ATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAGATCACCATCGGCCAGCTCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CCACACCTGCAAGG         GTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 217799 CCACACCTGCAAGGGTA...CAGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TATTGCAGTGATTAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220025 TATTGCAGTGATTAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AG         GAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGCGTTCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220075 AGGTA...CAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGCGTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 ATCATTTTAACA         CATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 226035 ATCATTTTAACAGTG...TAGCATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 CAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTTCTACAAGTGCTCACCTTTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229263 CAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTTCTACAAGTGCTCACCTTTAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 229313 TCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGTG...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    955    GCTCAGAGGGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231171 CAGGCTCAGAGGGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 TGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGGAGAAACGCAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231221 TGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGGAGAAACGCAAGTCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATT         AATCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 231271 TGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTGTA...CAGAATCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 GTCAACCCTGCCATGGACTTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 309463 GTCAACCCTGCCATGGACTTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTACATCCGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 309513 GGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTACATCCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192         ATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 309563 TA...CAGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 CCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGCTGACCAAGATGCTATGTGAGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 346006 CCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGCTGACCAAGATGCTATGTGAGATCTT

   1400     .    :    .
   1284 GAAAGTGGGCGAGTTGC
        |||||||||||||||||
 346056 GAAAGTGGGCGAGTTGC

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1436 AGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 547672 AGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAACCAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1486 CCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 547722 CCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1536 TGAGATCCTGAAAATCCGCCAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 547772 TGAGATCCTGAAAATCCGCCAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1586 AGTCCCGCCCGATTTT         GGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 547822 AGTCCCGCCCGATTTTGTA...CAGGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1627 GAAATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 555044 GAAATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1677 GACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCCGGCGGAGGCAAG         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 555094 GACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCCGGCGGAGGCAAGGTA...CAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1718 AGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 564577 AGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1768 GACTTAGAAGAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 564627 GACTTAGAAGAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1818 CAAAC         TGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGTGACGGGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 564677 CAAACGTA...CAGTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGTGACGGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1859 AGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 572252 AGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906       GAGGTGCTTGAACTCGCTTTCTCCATCTTGTATGACTCAAACTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 572302 ...TAGGAGGTGCTTGAACTCGCTTTCTCCATCTTGTATGACTCAAACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1950 CCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAG         TACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 580999 CCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGGTA...CAGTACTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1991 TCTGGACGGATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 586947 TCTGGACGGATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2041 CTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAGCATGGAAATCAAGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 586997 CTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAGCATGGAAATCAAGCTCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2091 CCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 587047 CCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
   2141 CCAAGGAGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 587097 CCAAGGAGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC