seq1 = pF1KE2328.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KE2328/gi568815590r_123403376.tfa (gi568815590r:123403376_123641014), 237639 bp

>pF1KE2328 1065
>gi568815590r:123403376_123641014 (Chr8)

(complement)

1-116  (100001-100116)   100% ->
117-229  (106201-106313)   100% ->
230-279  (107775-107824)   100% ->
280-372  (109025-109117)   100% ->
373-466  (126682-126775)   100% ->
467-651  (127633-127817)   100% ->
652-834  (134441-134623)   100% ->
835-978  (136268-136411)   100% ->
979-1065  (137553-137639)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCATTCCTCGGGCAGGACTGGCGGTCCCCCGGGCAGAACTGGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCATTCCTCGGGCAGGACTGGCGGTCCCCCGGGCAGAACTGGGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGGCCGACGGCTGGAAGCGCTTCCTGGATGAGAAGAGCGGCAGTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGGCCGACGGCTGGAAGCGCTTCCTGGATGAGAAGAGCGGCAGTTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAGCGACCTCAGCAG         TTACTGCAACAAGGAGGTATACAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAGCGACCTCAGCAGGTG...TAGTTACTGCAACAAGGAGGTATACAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGAGAATCTTTTCAACAGCCTGAACTATGATGTTGCAGCCAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106226 AAGGAGAATCTTTTCAACAGCCTGAACTATGATGTTGCAGCCAAGAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAGAAGGACATGCTGAATAGCAAAACCAAAACTCAGT         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106276 AAAGAAGGACATGCTGAATAGCAAAACCAAAACTCAGTGTA...TAGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCACCAAGAAAAATGGATCTATGTTCACAAAGGAAGTACTAAAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 107778 TCCACCAAGAAAAATGGATCTATGTTCACAAAGGAAGTACTAAAGAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       CGCCATGGATATTGCACCCTGGGGGAAGCTTTCAACAGACTGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107828 ...CAGCGCCATGGATATTGCACCCTGGGGGAAGCTTTCAACAGACTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTCTCAACTGCCATTCTGGATTCCAGAAGATTTAACTACGTGGTCCGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109069 CTTCTCAACTGCCATTCTGGATTCCAGAAGATTTAACTACGTGGTCCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373         CTGTTGGAGCTGATAGCAAAGTCACAGCTCACATCCCTGAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109119 TA...CAGCTGTTGGAGCTGATAGCAAAGTCACAGCTCACATCCCTGAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCATCGCCCAAAAGAACTTCATGAATATTTTGGAAAAAGTGGTACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126724 GGCATCGCCCAAAAGAACTTCATGAATATTTTGGAAAAAGTGGTACTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AG         TCCTTGAAGACCAGCAAAACATTAGACTAATAAGGGAAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126774 AGGTG...AAGTCCTTGAAGACCAGCAAAACATTAGACTAATAAGGGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TACTCCAGACCCTCTACACATCCTTATGTACACTGGTCCAAAGAGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127672 TACTCCAGACCCTCTACACATCCTTATGTACACTGGTCCAAAGAGTCGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGTCTGTGCTGGTCGGGAACATTAACATGTGGGTGTATCGGATGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127722 AAGTCTGTGCTGGTCGGGAACATTAACATGTGGGTGTATCGGATGGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATTCTCCACTGGCAGCAGCAGCTGAACAACATTCAGATCACCAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 127772 GATTCTCCACTGGCAGCAGCAGCTGAACAACATTCAGATCACCAGGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    652      CCTGCCTTCAAAGGCCTCACCTTCACTGACCTGCCTTTGTGCCTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127822 ..CAGCCTGCCTTCAAAGGCCTCACCTTCACTGACCTGCCTTTGTGCCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAACTGAACATCATGCAGAGGCTGAGCGACGGGCGGGACCTGGTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134486 CAACTGAACATCATGCAGAGGCTGAGCGACGGGCGGGACCTGGTCAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGGCCAGGCTGCCCCCGACCTGCACGTGCTCAGCGAAGACCGGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134536 GGGCCAGGCTGCCCCCGACCTGCACGTGCTCAGCGAAGACCGGCTGCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGAAGAAACTCTGCCAGTACCACTTCTCCGAGCGGCAG         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 134586 GGAAGAAACTCTGCCAGTACCACTTCTCCGAGCGGCAGGTC...TAGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGCAAACGATTAATTCTGTCAGACAAAGGGCAGCTGGATTGGAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136271 CGCAAACGATTAATTCTGTCAGACAAAGGGCAGCTGGATTGGAAGAAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GTATTTCAAACTTGTCCGATGTTACCCAAGGAAAGAGCAGTATGGAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136321 GTATTTCAAACTTGTCCGATGTTACCCAAGGAAAGAGCAGTATGGAGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCCTTCAGCTCTGCAAACACTGTCACATCCTTTCCTGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 136371 CCCTTCAGCTCTGCAAACACTGTCACATCCTTTCCTGGAAGGTA...CAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GGCACTGACCATCCGTGCACTGCCAATAACCCAGAGAGCTGCTCCGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137553 GGCACTGACCATCCGTGCACTGCCAATAACCCAGAGAGCTGCTCCGTTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .
   1029 ACTTTCACCCCAGGACTTTATCAACTTGTTCAAGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137603 ACTTTCACCCCAGGACTTTATCAACTTGTTCAAGTTC