seq1 = pF1KE2307.tfa, 906 bp
seq2 = pF1KE2307/gi568815580f_24360729.tfa (gi568815580f:24360729_24577559), 216831 bp

>pF1KE2307 906
>gi568815580f:24360729_24577559 (Chr18)

1-193  (100001-100193)   100% ->
194-906  (116119-116831)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGATACTAATAGCACAATCAATTTATCACTAAGCACTCGTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGATACTAATAGCACAATCAATTTATCACTAAGCACTCGTGTTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTAGCATTTTTTATGTCCTTAGTAGCTTTTGCTATAATGCTAGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTAGCATTTTTTATGTCCTTAGTAGCTTTTGCTATAATGCTAGGAAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTTGGTCATTTTAGCTTTTGTGGTGGACAAAAACCTTAGACATCGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTTGGTCATTTTAGCTTTTGTGGTGGACAAAAACCTTAGACATCGAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTTATTTTTTTCTTAACTTGGCCATCTCTGACTTCTTTGTGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100151 AGTTATTTTTTTCTTAACTTGGCCATCTCTGACTTCTTTGTGGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194   TTTCAGAGTCTTGGAAGGATGAAGGTAGTGAATGTGAACCTGGATTTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116117 AGTTTCAGAGTCTTGGAAGGATGAAGGTAGTGAATGTGAACCTGGATTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTCGGAATGGTACATCCTTGCCATCACATCATTCTTGGAATTCGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116167 TTTCGGAATGGTACATCCTTGCCATCACATCATTCTTGGAATTCGTGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAGTCATCTTAGTCGCTTATTTCAACATGAATATTTATTGGAGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116217 CCAGTCATCTTAGTCGCTTATTTCAACATGAATATTTATTGGAGCCTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGCGTGATCATCTCAGTAGGTGCCAAAGCCATCCTGGACTGACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116267 GAAGCGTGATCATCTCAGTAGGTGCCAAAGCCATCCTGGACTGACTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTCTTCCAACATCTGTGGACACTCATTCAGAGGTAGACTATCTTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116317 TCTCTTCCAACATCTGTGGACACTCATTCAGAGGTAGACTATCTTCAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGATCTCTTTCTGCATCGACAGAAGTTCCTGCATCCTTTCATTCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116367 AGATCTCTTTCTGCATCGACAGAAGTTCCTGCATCCTTTCATTCAGAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACAGAGGAGAAAGAGTAGTCTCATGTTTTCCTCAAGAACCAAGATGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116417 ACAGAGGAGAAAGAGTAGTCTCATGTTTTCCTCAAGAACCAAGATGAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCAATACAATTGCTTCCAAAATGGGTTCCTTCTCCCAATCAGATTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116467 GCAATACAATTGCTTCCAAAATGGGTTCCTTCTCCCAATCAGATTCTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTCTTCACCAAAGGGAACATGTTGAACTGCTTAGAGCCAGGAGATTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116517 GCTCTTCACCAAAGGGAACATGTTGAACTGCTTAGAGCCAGGAGATTAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAAGTCACTGGCCATTCTCTTAGGGGTTTTTGCTGTTTGCTGGGCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116567 CAAGTCACTGGCCATTCTCTTAGGGGTTTTTGCTGTTTGCTGGGCTCCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATTCTCTGTTCACAATTGTCCTTTCATTTTATTCCTCAGCAACAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116617 ATTCTCTGTTCACAATTGTCCTTTCATTTTATTCCTCAGCAACAGGTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAATCAGTTTGGTATAGAATTGCATTTTGGCTTCAGTGGTTCAATTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116667 AAATCAGTTTGGTATAGAATTGCATTTTGGCTTCAGTGGTTCAATTCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGTCAATCCTCTTTTGTATCCATTGTGTCACAAGCGCTTTCAAAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116717 TGTCAATCCTCTTTTGTATCCATTGTGTCACAAGCGCTTTCAAAAGGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCTTGAAAATATTTTGTATAAAAAAGCAACCTCTACCATCACAACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116767 TCTTGAAAATATTTTGTATAAAAAAGCAACCTCTACCATCACAACACAGT

    900     .    :    .
    892 CGGTCAGTATCTTCT
        |||||||||||||||
 116817 CGGTCAGTATCTTCT