seq1 = pF1KE2306.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KE2306/gi568815579r_45309678.tfa (gi568815579r:45309678_45523374), 213697 bp

>pF1KE2306 891
>gi568815579r:45309678_45523374 (Chr19)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-321  (101982-102197)   100% ->
322-425  (102948-103051)   99% ->
426-525  (104178-104277)   100% ->
526-602  (106478-106554)   100% ->
603-702  (108415-108514)   100% ->
703-774  (109341-109412)   100% ->
775-843  (109630-109698)   100% ->
844-891  (113650-113697)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCTGGGAAGGACAAAGAGGGGGTGCCCCAGCCCTCAGGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCTGGGAAGGACAAAGAGGGGGTGCCCCAGCCCTCAGGGCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCAAGGAAGAAATTTGTGATACCCCTCGACGAGGATGAGGTCCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCAAGGAAGAAATTTGTGATACCCCTCGACGAGGATGAGGTCCCTCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGTG         GCCAAGCCCTTATTCCGATCTACACAGAGCCTTCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGTGGTA...CAGGCCAAGCCCTTATTCCGATCTACACAGAGCCTTCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGTGGACACCTCGGCCCAGGCGGCCCCTCAGACCTACGCCGAATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102018 ACTGTGGACACCTCGGCCCAGGCGGCCCCTCAGACCTACGCCGAATATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCTCACAGCCTCTGGAAGGGGCTGGGGCCACGTGCCCCACAGGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102068 CATCTCACAGCCTCTGGAAGGGGCTGGGGCCACGTGCCCCACAGGGTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCCCCTGGCAGGAGAGACGCCCAACCAGGCCCTGAAACCCGGGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102118 AGCCCCTGGCAGGAGAGACGCCCAACCAGGCCCTGAAACCCGGGGCAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCAACAGCATCATTGTGAGCCCTCGGCAG         AGGGGCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102168 TCCAACAGCATCATTGTGAGCCCTCGGCAGGTG...CAGAGGGGCAATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGTACTGAAGTTCGTGCGCAACGTGCCCTGGGAATTTGGCGACGTAATTC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 102959 CGTACTGAAGTTCGTGCGCAATGTGCCCTGGGAATTTGGCGACGTAATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCGACTATGTGCTGGGCCAGAGCACCTGTGCCCTGTTCCTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103009 CCGACTATGTGCTGGGCCAGAGCACCTGTGCCCTGTTCCTCAGGTG...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    426   CCTCCGCTACCACAACCTGCACCCAGACTACATCCATGGGCGGCTGCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104176 AGCCTCCGCTACCACAACCTGCACCCAGACTACATCCATGGGCGGCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGCCTGGGGAAGAACTTCGCCTTGCGGGTCCTGCTTGTCCAGGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104226 GAGCCTGGGGAAGAACTTCGCCTTGCGGGTCCTGCTTGTCCAGGTGGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TG         AAAGATCCCCAGCAGGCCCTCAAGGAGCTGGCTAAGATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104276 TGGTA...CAGAAAGATCCCCAGCAGGCCCTCAAGGAGCTGGCTAAGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGTATCCTGGCCGACTGCACATTGATCCTCGCCTGGAG         CCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106517 TGTATCCTGGCCGACTGCACATTGATCCTCGCCTGGAGGTG...CAGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGAGGAAGCTGGGCGGTACCTGGAGACCTACAAGGCCTATGAGCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108418 CGAGGAAGCTGGGCGGTACCTGGAGACCTACAAGGCCTATGAGCAGAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAGCGGACCTCCTGATGGAGAAGCTAGAGCAGGACTTCGTCTCCCGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 108468 CAGCGGACCTCCTGATGGAGAAGCTAGAGCAGGACTTCGTCTCCCGGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       GTGACTGAATGTCTGACCACCGTGAAGTCAGTCAACAAAACGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108518 ...CAGGTGACTGAATGTCTGACCACCGTGAAGTCAGTCAACAAAACGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAGTCAGACCCTCCTGACCACATTTGGA         TCTCTGGAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109385 CAGTCAGACCCTCCTGACCACATTTGGAGTA...CAGTCTCTGGAACAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCATCGCCGCATCAAGAGAAGATCTGGCCTTATGCCCAGGCCTGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109643 TCATCGCCGCATCAAGAGAAGATCTGGCCTTATGCCCAGGCCTGGGCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAGAAA         GCCCGGAGGCTGTTTGATGTCCTGCACGAGCCCTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109693 CAGAAAGTA...CAGGCCCGGAGGCTGTTTGATGTCCTGCACGAGCCCTT

    950     .    :
    879 CTTGAAAGTACCC
        |||||||||||||
 113685 CTTGAAAGTACCC