seq1 = pF1KE2296.tfa, 3495 bp
seq2 = pF1KE2296/gi568815594f_105133943.tfa (gi568815594f:105133943_105337437), 203495 bp

>pF1KE2296 3495
>gi568815594f:105133943_105337437 (Chr4)

1-3495  (100001-103495)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACAGGATAGAACCAACCATGTTGAGGGCAACAGACTAAGTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACAGGATAGAACCAACCATGTTGAGGGCAACAGACTAAGTCCATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGATACCATCACCTCCCATTTGCCAGACAGAACCTCTGGCTACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGATACCATCACCTCCCATTTGCCAGACAGAACCTCTGGCTACAAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAGAATGGAAGCCCACTGCCTGAGAGAGCTCATCCAGAAGTAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCAGAATGGAAGCCCACTGCCTGAGAGAGCTCATCCAGAAGTAAATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACACCAAGTGGCACTCTTTCAAAAGTTATTATGGAATACCCTGTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACACCAAGTGGCACTCTTTCAAAAGTTATTATGGAATACCCTGTATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGAAGCCAGAATAGTCGTGTGAGTCCTGACTTTACACAAGAAAGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGAAGCCAGAATAGTCGTGTGAGTCCTGACTTTACACAAGAAAGTAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGTATTCCAAGTGTTTGCAAAATGGAGGAATAAAACGCACAGTTAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGTATTCCAAGTGTTTGCAAAATGGAGGAATAAAACGCACAGTTAGTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTTCTCTCTCTGGGCTCCTTCAGATCAAGAAATTGAAACAAGACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTTCTCTCTCTGGGCTCCTTCAGATCAAGAAATTGAAACAAGACCAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTAATGGAGAAAGACGTAACTTCGGGGTAAGCCAAGAAAGAAATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTAATGGAGAAAGACGTAACTTCGGGGTAAGCCAAGAAAGAAATCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGAAAGCAGTCAACCAAATGTCTCCGATTTGAGTGATAAGAAAGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGAAAGCAGTCAACCAAATGTCTCCGATTTGAGTGATAAGAAAGAATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGAGTTCTGTAGCCCAAGAAAATGCAGTTAAAGATTTCACCAGTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGAGTTCTGTAGCCCAAGAAAATGCAGTTAAAGATTTCACCAGTTTTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AACACATAACTGCAGTGGGCCTGAAAATCCAGAGCTTCAGATTCTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AACACATAACTGCAGTGGGCCTGAAAATCCAGAGCTTCAGATTCTGAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCAGGAGGGGAAAAGTGCTAATTACCATGACAAGAACATTGTATTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCAGGAGGGGAAAAGTGCTAATTACCATGACAAGAACATTGTATTACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGTGGAACACACACATGGTGAACTCCTGGAAAAAACACTGTCTCAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGTGGAACACACACATGGTGAACTCCTGGAAAAAACACTGTCTCAATATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATCCAGATTGTGTTTCCATTGCGGTGCAGAAAACCACATCTCACATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATCCAGATTGTGTTTCCATTGCGGTGCAGAAAACCACATCTCACATAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCATTAACAGTCAGGCTACTAATGAGTTGTCCTGTGAGATCACTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCATTAACAGTCAGGCTACTAATGAGTTGTCCTGTGAGATCACTCACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATCGCATACCTCAGGGCAGATCAATTCCGCACAGACCTCTAACTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATCGCATACCTCAGGGCAGATCAATTCCGCACAGACCTCTAACTCTGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCCTCCAAAGCCAGCTGCAGTGGTGAGTGAGGCCTGTGATGCTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCCTCCAAAGCCAGCTGCAGTGGTGAGTGAGGCCTGTGATGCTGATGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCTGATAATGCCAGTAAACTAGCTGCAATGCTAAATACCTGTTCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCTGATAATGCCAGTAAACTAGCTGCAATGCTAAATACCTGTTCCTTTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAAACCAGAACAACTACAACAACAAAAATCAGTTTTTGAGATATGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAACCAGAACAACTACAACAACAAAAATCAGTTTTTGAGATATGCCCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CTCCTGCAGAAAATAACATCCAGGGAACCACAAAGCTAGCGTCTGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CTCCTGCAGAAAATAACATCCAGGGAACCACAAAGCTAGCGTCTGGTGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAATTCTGTTCAGGTTCCAGCAGCAATTTGCAAGCTCCTGGTGGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAATTCTGTTCAGGTTCCAGCAGCAATTTGCAAGCTCCTGGTGGCAGCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGAACGGTATTTAAAACAAAATGAAATGAATGGTGCTTACTTCAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGAACGGTATTTAAAACAAAATGAAATGAATGGTGCTTACTTCAAGCAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCTCAGTGTTCACTAAGGATTCCTTTTCTGCCACTACCACACCACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCTCAGTGTTCACTAAGGATTCCTTTTCTGCCACTACCACACCACCACCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCATCACAATTGCTTCTTTCTCCCCCTCCTCCTCTTCCACAGGTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCATCACAATTGCTTCTTTCTCCCCCTCCTCCTCTTCCACAGGTTCCTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCTTCCTTCAGAAGGAAAAAGCACTCTGAATGGTGGAGTTTTAGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCTTCCTTCAGAAGGAAAAAGCACTCTGAATGGTGGAGTTTTAGAAGAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCACCACTACCCCAACCAAAGTAACACAACACTTTTAAGGGAAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACCACCACTACCCCAACCAAAGTAACACAACACTTTTAAGGGAAGTGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATAGAGGGTAAACCTGAGGCACCACCTTCCCAGAGTCCTAATCCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATAGAGGGTAAACCTGAGGCACCACCTTCCCAGAGTCCTAATCCATCTAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 ACATGTATGCAGCCCTTCTCCGATGCTTTCTGAAAGGCCTCAGAATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 ACATGTATGCAGCCCTTCTCCGATGCTTTCTGAAAGGCCTCAGAATAATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTGTGAACAGGAATGACATACAGACTGCAGGGACAATGACTGTTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTGTGAACAGGAATGACATACAGACTGCAGGGACAATGACTGTTCCATTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TGTTCTGAGAAAACAAGACCAATGTCAGAACACCTCAAGCATAACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TGTTCTGAGAAAACAAGACCAATGTCAGAACACCTCAAGCATAACCCACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AATTTTTGGTAGCAGTGGAGAGCTACAGGACAACTGCCAGCAGTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AATTTTTGGTAGCAGTGGAGAGCTACAGGACAACTGCCAGCAGTTGATGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GAAACAAAGAGCAAGAGATTCTGAAGGGTCGAGACAAGGAGCAAACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GAAACAAAGAGCAAGAGATTCTGAAGGGTCGAGACAAGGAGCAAACACGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GATCTTGTGCCCCCAACACAGCACTATCTGAAACCAGGATGGATTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GATCTTGTGCCCCCAACACAGCACTATCTGAAACCAGGATGGATTGAATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GAAGGCCCCTCGTTTTCACCAAGCGGAATCCCATCTAAAACGTAATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GAAGGCCCCTCGTTTTCACCAAGCGGAATCCCATCTAAAACGTAATGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CATCACTGCCATCAATTCTTCAGTATCAACCCAATCTCTCCAATCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CATCACTGCCATCAATTCTTCAGTATCAACCCAATCTCTCCAATCAAATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ACCTCCAAACAATACACTGGAAATTCCAACATGCCTGGGGGGCTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ACCTCCAAACAATACACTGGAAATTCCAACATGCCTGGGGGGCTCCCAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GCAAGCTTACACCCAGAAAACAACACAGCTGGAGCACAAGTCACAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GCAAGCTTACACCCAGAAAACAACACAGCTGGAGCACAAGTCACAAATGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ACCAAGTTGAAATGAATCAAGGGCAGTCCCAAGGTACAGTGGACCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ACCAAGTTGAAATGAATCAAGGGCAGTCCCAAGGTACAGTGGACCAACAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CTCCAGTTCCAAAAACCCTCACACCAGGTGCACTTCTCCAAAACAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CTCCAGTTCCAAAAACCCTCACACCAGGTGCACTTCTCCAAAACAGACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TTTACCAAAAGCTCATGTGCAGTCACTGTGTGGCACTAGATTTCATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 TTTACCAAAAGCTCATGTGCAGTCACTGTGTGGCACTAGATTTCATTTTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AACAAAGAGCAGATTCCCAAACTGAAAAACTTATGTCCCCAGTGTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AACAAAGAGCAGATTCCCAAACTGAAAAACTTATGTCCCCAGTGTTGAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CAGCACTTGAATCAACAGGCTTCAGAGACTGAGCCATTTTCAAACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CAGCACTTGAATCAACAGGCTTCAGAGACTGAGCCATTTTCAAACTCACA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CCTTTTGCAACATAAGCCTCATAAACAGGCAGCACAAACACAACCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CCTTTTGCAACATAAGCCTCATAAACAGGCAGCACAAACACAACCATCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 AGAGTTCACATCTCCCTCAAAACCAGCAACAGCAGCAAAAATTACAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 AGAGTTCACATCTCCCTCAAAACCAGCAACAGCAGCAAAAATTACAAATA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 AAGAATAAAGAGGAAATACTCCAGACTTTTCCTCACCCCCAAAGCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 AAGAATAAAGAGGAAATACTCCAGACTTTTCCTCACCCCCAAAGCAACAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 TGATCAGCAAAGAGAAGGATCATTCTTTGGCCAGACTAAAGTGGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 TGATCAGCAAAGAGAAGGATCATTCTTTGGCCAGACTAAAGTGGAAGAAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 GTTTTCATGGTGAAAATCAGTATTCAAAATCAAGCGAGTTCGAGACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 GTTTTCATGGTGAAAATCAGTATTCAAAATCAAGCGAGTTCGAGACTCAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 AATGTCCAAATGGGACTGGAGGAAGTACAGAATATAAATCGTAGAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 AATGTCCAAATGGGACTGGAGGAAGTACAGAATATAAATCGTAGAAATTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 CCCTTATAGTCAGACCATGAAATCAAGTGCATGCAAAATACAGGTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 CCCTTATAGTCAGACCATGAAATCAAGTGCATGCAAAATACAGGTTTCTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 GTTCAAACAATACACACCTAGTTTCAGAGAATAAAGAACAGACTACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 GTTCAAACAATACACACCTAGTTTCAGAGAATAAAGAACAGACTACACAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 CCTGAACTTTTTGCAGGAAACAAGACCCAAAACTTGCATCACATGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 CCTGAACTTTTTGCAGGAAACAAGACCCAAAACTTGCATCACATGCAATA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 TTTTCCAAATAATGTGATCCCAAAGCAAGATCTTCTTCACAGGTGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 TTTTCCAAATAATGTGATCCCAAAGCAAGATCTTCTTCACAGGTGCTTTC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 AAGAACAGGAGCAGAAGTCACAACAAGCTTCAGTTCTACAGGGATATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 AAGAACAGGAGCAGAAGTCACAACAAGCTTCAGTTCTACAGGGATATAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701 AATAGAAACCAAGATATGTCTGGTCAACAAGCTGCGCAACTTGCTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 AATAGAAACCAAGATATGTCTGGTCAACAAGCTGCGCAACTTGCTCAGCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2751 AAGGTACTTGATACATAACCATGCAAATGTTTTTCCTGTGCCTGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 AAGGTACTTGATACATAACCATGCAAATGTTTTTCCTGTGCCTGACCAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2801 GAGGAAGTCACACTCAGACCCCTCCCCAGAAGGACACTCAAAAGCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 GAGGAAGTCACACTCAGACCCCTCCCCAGAAGGACACTCAAAAGCATGCT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2851 GCTCTAAGGTGGCATCTCTTACAGAAGCAAGAACAGCAGCAAACACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102851 GCTCTAAGGTGGCATCTCTTACAGAAGCAAGAACAGCAGCAAACACAGCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2901 ACCCCAAACTGAGTCTTGCCATAGTCAGATGCACAGGCCAATTAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102901 ACCCCAAACTGAGTCTTGCCATAGTCAGATGCACAGGCCAATTAAGGTGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2951 AACCTGGATGCAAGCCACATGCCTGTATGCACACAGCACCACCAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102951 AACCTGGATGCAAGCCACATGCCTGTATGCACACAGCACCACCAGAAAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3001 AAAACATGGAAAAAGGTAACTAAGCAAGAGAATCCACCTGCAAGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103001 AAAACATGGAAAAAGGTAACTAAGCAAGAGAATCCACCTGCAAGCTGTGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3051 TAATGTGCAGCAAAAGAGCATCATTGAGACCATGGAGCAGCATCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103051 TAATGTGCAGCAAAAGAGCATCATTGAGACCATGGAGCAGCATCTGAAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3101 AGTTTCACGCCAAGTCGTTATTTGACCATAAGGCTCTTACTCTCAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103101 AGTTTCACGCCAAGTCGTTATTTGACCATAAGGCTCTTACTCTCAAATCA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3151 CAGAAGCAAGTAAAAGTTGAAATGTCAGGGCCAGTCACAGTTTTGACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103151 CAGAAGCAAGTAAAAGTTGAAATGTCAGGGCCAGTCACAGTTTTGACTAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3201 ACAAACCACTGCTGCAGAACTTGATAGCCACACCCCAGCTTTAGAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103201 ACAAACCACTGCTGCAGAACTTGATAGCCACACCCCAGCTTTAGAGCAGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3251 AAACAACTTCTTCAGAAAAGACACCAACCAAAAGAACAGCTGCTTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103251 AAACAACTTCTTCAGAAAAGACACCAACCAAAAGAACAGCTGCTTCTGTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3301 CTCAATAATTTTATAGAGTCACCTTCCAAATTACTAGATACTCCTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103301 CTCAATAATTTTATAGAGTCACCTTCCAAATTACTAGATACTCCTATAAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3351 AAATTTATTGGATACACCTGTCAAGACTCAATATGATTTCCCATCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103351 AAATTTATTGGATACACCTGTCAAGACTCAATATGATTTCCCATCTTGCA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3401 GATGTGTAGGTAAGTGCCAGAAATGTACTGAGACACATGGCGTTTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103401 GATGTGTAGGTAAGTGCCAGAAATGTACTGAGACACATGGCGTTTATCCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3451 GAATTAGCAAATTTATCTTCAGATATGGGATTTTCCTTCTTTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103451 GAATTAGCAAATTTATCTTCAGATATGGGATTTTCCTTCTTTTTT