seq1 = pF1KE2293.tfa, 618 bp
seq2 = pF1KE2293/gi568815587r_69673312.tfa (gi568815587r:69673312_69875084), 201773 bp

>pF1KE2293 618
>gi568815587r:69673312_69875084 (Chr11)

(complement)

1-340  (100001-100340)   100% ->
341-444  (100958-101061)   100% ->
445-618  (101600-101773)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGGCCCGGGACGGCCGCGGTAGCGCTGCTCCCGGCGGTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGGCCCGGGACGGCCGCGGTAGCGCTGCTCCCGGCGGTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCTTGCTGGCGCCCTGGGCGGGCCGAGGGGGCGCCGCCGCACCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCTTGCTGGCGCCCTGGGCGGGCCGAGGGGGCGCCGCCGCACCCACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCCAACGGCACGCTGGAGGCCGAGCTGGAGCGCCGCTGGGAGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCCAACGGCACGCTGGAGGCCGAGCTGGAGCGCCGCTGGGAGAGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGCGCTCTCGTTGGCGCGCCTGCCGGTGGCAGCGCAGCCCAAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGCGCTCTCGTTGGCGCGCCTGCCGGTGGCAGCGCAGCCCAAGGAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCGTCCAGAGCGGCGCCGGCGACTACCTGCTGGGCATCAAGCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCGTCCAGAGCGGCGCCGGCGACTACCTGCTGGGCATCAAGCGGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCGGCTCTACTGCAACGTGGGCATCGGCTTCCACCTCCAGGCGCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCGGCTCTACTGCAACGTGGGCATCGGCTTCCACCTCCAGGCGCTCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACGGCCGCATCGGCGGCGCGCACGCGGACACCCGCGACA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100301 GACGGCCGCATCGGCGGCGCGCACGCGGACACCCGCGACAGTG...CAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGCTGGAGCTCTCGCCCGTGGAGCGGGGCGTGGTGAGCATCTTCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100959 CCTGCTGGAGCTCTCGCCCGTGGAGCGGGGCGTGGTGAGCATCTTCGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGCCAGCCGGTTCTTCGTGGCCATGAGCAGCAAGGGCAAGCTCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101009 TGGCCAGCCGGTTCTTCGTGGCCATGAGCAGCAAGGGCAAGCTCTATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCG         CCCTTCTTCACCGATGAGTGCACGTTCAAGGAGATTCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101059 TCGGTG...CAGCCCTTCTTCACCGATGAGTGCACGTTCAAGGAGATTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTTCCCAACAACTACAACGCCTACGAGTCCTACAAGTACCCCGGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101638 CCTTCCCAACAACTACAACGCCTACGAGTCCTACAAGTACCCCGGCATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCATCGCCCTGAGCAAGAATGGGAAGACCAAGAAGGGGAACCGAGTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101688 TCATCGCCCTGAGCAAGAATGGGAAGACCAAGAAGGGGAACCGAGTGTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .
    583 CCCACCATGAAGGTCACCCACTTCCTCCCCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101738 CCCACCATGAAGGTCACCCACTTCCTCCCCAGGCTG