seq1 = pF1KE2290.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KE2290/gi568815584f_52214549.tfa (gi568815584f:52214549_52427451), 212903 bp

>pF1KE2290 1074
>gi568815584f:52214549_52427451 (Chr14)

1-843  (100001-100843)   100% ->
844-1074  (112673-112903)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAATGCCTCCAATGACTCCCAGTCTGAGGACTGCGAGACGCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAATGCCTCCAATGACTCCCAGTCTGAGGACTGCGAGACGCGACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGCTTCCCCCAGGCGAAAGCCCAGCCATCAGCTCCGTCATGTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGCTTCCCCCAGGCGAAAGCCCAGCCATCAGCTCCGTCATGTTCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGGGTGCTGGGGAACCTCATAGCACTGGCGCTGCTGGCGCGCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGGGTGCTGGGGAACCTCATAGCACTGGCGCTGCTGGCGCGCCGCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGGGGACGTGGGGTGCAGCGCCGGCCGCAGGAGCTCCCTCTCCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGGGGGACGTGGGGTGCAGCGCCGGCCGCAGGAGCTCCCTCTCCTTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCACGTGCTGGTGACCGAGCTGGTGTTCACCGACCTGCTCGGGACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCACGTGCTGGTGACCGAGCTGGTGTTCACCGACCTGCTCGGGACCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCAGCCCAGTGGTACTGGCTTCGTACGCGCGGAACCAGACCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATCAGCCCAGTGGTACTGGCTTCGTACGCGCGGAACCAGACCCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCACTGGCGCCCGAGAGCCGCGCGTGCACCTACTTCGCTTTCGCCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCACTGGCGCCCGAGAGCCGCGCGTGCACCTACTTCGCTTTCGCCATGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCTTCAGCCTGGCCACGATGCTCATGCTCTTCGCCATGGCCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCTTCAGCCTGGCCACGATGCTCATGCTCTTCGCCATGGCCCTGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTACCTCTCGATCGGGCACCCCTACTTCTACCAGCGCCGCGTCTCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTACCTCTCGATCGGGCACCCCTACTTCTACCAGCGCCGCGTCTCGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCGGGGGCCTGGCCGTGCTGCCTGTCATCTATGCAGTCTCCCTGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCGGGGGCCTGGCCGTGCTGCCTGTCATCTATGCAGTCTCCCTGCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCTCGCTGCCGCTGCTGGACTATGGGCAGTACGTCCAGTACTGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCTCGCTGCCGCTGCTGGACTATGGGCAGTACGTCCAGTACTGCCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGACCTGGTGCTTCATCCGGCACGGGCGGACCGCTTACCTGCAGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGACCTGGTGCTTCATCCGGCACGGGCGGACCGCTTACCTGCAGCTGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCACCCTGCTGCTGCTTCTCATTGTCTCGGTGCTCGCCTGCAACTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCACCCTGCTGCTGCTTCTCATTGTCTCGGTGCTCGCCTGCAACTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTCATTCTCAACCTCATCCGCATGCACCGCCGAAGCCGGAGAAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTCATTCTCAACCTCATCCGCATGCACCGCCGAAGCCGGAGAAGCCGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCGGACCTTCCCTGGGCAGTGGCCGGGGCGGCCCCGGGGCCCGCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCGGACCTTCCCTGGGCAGTGGCCGGGGCGGCCCCGGGGCCCGCAGGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGGAAAGGGTGTCCATGGCGGAGGAGACGGACCACCTCATTCTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGGAAAGGGTGTCCATGGCGGAGGAGACGGACCACCTCATTCTCCTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATCATGACCATCACCTTCGCCGTCTGCTCCTTGCCTTTCACG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100801 TATCATGACCATCACCTTCGCCGTCTGCTCCTTGCCTTTCACGGTA...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844   ATTTTTGCATATATGAATGAAACCTCTTCCCGAAAGGAAAAATGGGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112671 AGATTTTTGCATATATGAATGAAACCTCTTCCCGAAAGGAAAAATGGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTCCAAGCTCTTAGGTTTTTATCAATTAATTCAATAATTGACCCTTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112721 CTCCAAGCTCTTAGGTTTTTATCAATTAATTCAATAATTGACCCTTGGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTTGCCATCCTTAGGCCTCCTGTTCTGAGACTAATGCGTTCAGTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112771 CTTTGCCATCCTTAGGCCTCCTGTTCTGAGACTAATGCGTTCAGTCCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTTGTCGGATTTCATTAAGAACACAAGATGCAACACAAACTTCCTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112821 GTTGTCGGATTTCATTAAGAACACAAGATGCAACACAAACTTCCTGTTCT

   1050     .    :    .    :    .    :
   1042 ACACAGTCAGATGCCAGTAAACAGGCTGACCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 112871 ACACAGTCAGATGCCAGTAAACAGGCTGACCTT