seq1 = pF1KE2284.tfa, 2331 bp
seq2 = pF1KE2284/gi568815592r_33192105.tfa (gi568815592r:33192105_33398610), 206506 bp

>pF1KE2284 2331
>gi568815592r:33192105_33398610 (Chr6)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-240  (101496-101579)   100% ->
241-419  (101835-102013)   100% ->
420-470  (102147-102197)   100% ->
471-768  (102286-102583)   100% ->
769-1020  (102852-103103)   100% ->
1021-1124  (103189-103292)   100% ->
1125-1209  (103400-103484)   100% ->
1210-1278  (103566-103634)   100% ->
1279-1353  (103849-103923)   100% ->
1354-1386  (104545-104577)   100% ->
1387-1508  (104695-104816)   100% ->
1509-1604  (104912-105007)   98% ->
1605-1716  (105087-105198)   100% ->
1717-2007  (105305-105595)   100% ->
2008-2122  (106067-106181)   100% ->
2123-2331  (106298-106506)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCCGCGGCCCCTGCGGCTGCTTTTGGACACGAGCCCCCCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCCGCGGCCCCTGCGGCTGCTTTTGGACACGAGCCCCCCCGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCGTACTGAGCAGCTTCCGAAGCCGGGACCCCGAAGAGGGTGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTCGTACTGAGCAGCTTCCGAAGCCGGGACCCCGAAGAGGGTGGGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGTGGCCTGGTCGTGGGCGGGGGGCAGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGTGGCCTGGTCGTGGGCGGGGGGCAGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGAG         GCCCCTGTGTCCGTCTGGGATGAGGAGGAGGATGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGAGGTG...CAGGCCCCTGTGTCCGTCTGGGATGAGGAGGAGGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCCGTGTTTACCGTCACAAGCCGCCAATATCGACCTCTTGATCCCTTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101531 TGCCGTGTTTACCGTCACAAGCCGCCAATATCGACCTCTTGATCCCTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         GTCCCTATGCCTCCCCCACGTTCCTCCCGACGGCTCCGAGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101581 TG...CAGGTCCCTATGCCTCCCCCACGTTCCTCCCGACGGCTCCGAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCACTCTGGAGGCCCTGGTCAGACACCTACTGGATACCCGGACATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101877 GGCACTCTGGAGGCCCTGGTCAGACACCTACTGGATACCCGGACATCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACTGATGTGAGCTTCATGTCAGCCTTCCTGGCTACCCACCGGGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101927 GACTGATGTGAGCTTCATGTCAGCCTTCCTGGCTACCCACCGGGCCTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTCCACGCCTGCCTTGCTAGGGCTTATGGCTGACAG         GCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101977 CCTCCACGCCTGCCTTGCTAGGGCTTATGGCTGACAGGTC...CAGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGCCCTTGAATCTCATCCTACCGACGAACTAGAGAGGACAACAGA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102151 GAAGCCCTTGAATCTCATCCTACCGACGAACTAGAGAGGACAACAGAGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    471       GGTAGCCATCTCTGTACTGTCAACCTGGCTGGCCTCTCACCCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 ...CAGGGTAGCCATCTCTGTACTGTCAACCTGGCTGGCCTCTCACCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGATTTTGGCTCTGAGGCCAAGGGTCAGCTTGACCGGCTTGAGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102330 AGGATTTTGGCTCTGAGGCCAAGGGTCAGCTTGACCGGCTTGAGAGCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTACTTCAGACAGGGTATGCAGCAGGGAAGGGTGTTGGGGGGGGCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102380 TTACTTCAGACAGGGTATGCAGCAGGGAAGGGTGTTGGGGGGGGCAGCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGACCTCATCCGCAATCTCCGGTCCCGGGTGGACCCCCAGGCCCCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102430 TGACCTCATCCGCAATCTCCGGTCCCGGGTGGACCCCCAGGCCCCCGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTCCTAAGCCCCTGGCCCTCCCCGGCGATCCCCCTGCTGACCCCACGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 TTCCTAAGCCCCTGGCCCTCCCCGGCGATCCCCCTGCTGACCCCACGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTCCTGGTGTTCCTCGCTGACCACTTGGCCGAACAGCTGACCCTGCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102530 GTCCTGGTGTTCCTCGCTGACCACTTGGCCGAACAGCTGACCCTGCTAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGCG         GAACTTTTTCTCAATTTGATCCCCTCTCAGTGCCTGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 TGCGGTG...CAGGAACTTTTTCTCAATTTGATCCCCTCTCAGTGCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAGGCCTGTGGGGTCACAGAGACCGGCCAGGACATTCTCACCTCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102889 GAGGCCTGTGGGGTCACAGAGACCGGCCAGGACATTCTCACCTCTGCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCTGTCCGAGCTACTGTCACACAGTTTAACAAGGTGGCAGGGGCAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102939 TCTGTCCGAGCTACTGTCACACAGTTTAACAAGGTGGCAGGGGCAGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TAGTTCTGTCCTGGGGGCTACTTCCACTGGAGAGGGACCTGGGGAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102989 TAGTTCTGTCCTGGGGGCTACTTCCACTGGAGAGGGACCTGGGGAGGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCATACGGCCACTCCGTCCCCCACAGAGGGCCCGGCTCCTGGAGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103039 CCATACGGCCACTCCGTCCCCCACAGAGGGCCCGGCTCCTGGAGAAGTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ATCCGCGTGGCAGAG         GAGTGCCGGCTGCTCCGAAACTTCTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103089 ATCCGCGTGGCAGAGGTG...CAGGAGTGCCGGCTGCTCCGAAACTTCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTCAGTTTATGCCGTGGTGTCAGCCCTGCAGTCCAGCCCCATCCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103215 TTCAGTTTATGCCGTGGTGTCAGCCCTGCAGTCCAGCCCCATCCACAGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TTCGGGCAGCCTGGGGGGAAGCAACCAG         GGACAGCCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103265 TTCGGGCAGCCTGGGGGGAAGCAACCAGGTG...CAGGGACAGCCTCAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTCTTTTCCAGCCTCTGCCAGATTTTCTCCGAGGAGGATAATTATTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103413 GTCTTTTCCAGCCTCTGCCAGATTTTCTCCGAGGAGGATAATTATTCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAGTCGGGAGCTGCTCGTGCAG         GAGGTGAAGCTGCAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103463 GAGTCGGGAGCTGCTCGTGCAGGTG...CAGGAGGTGAAGCTGCAGTCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTCTGGAGCCACACTCCAAGAAGGCCCCGAGGTCTGGCTCCCGGGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103585 CTCTGGAGCCACACTCCAAGAAGGCCCCGAGGTCTGGCTCCCGGGGTGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279          GGTGTGGTCCCATACCTTGGCACCTTCCTGAAGGACCTTGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103635 GTG...CAGGGTGTGGTCCCATACCTTGGCACCTTCCTGAAGGACCTTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GATGCTGGATGCAGCCTCCAAGGATGAGTTGGAG         AATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103890 GATGCTGGATGCAGCCTCCAAGGATGAGTTGGAGGTC...CAGAATGGAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACATCAATTTTGACAAGCGGAGGAAG         GAGTTTGCAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104552 ACATCAATTTTGACAAGCGGAGGAAGGTG...CAGGAGTTTGCAGTCCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TCTGAGTTGCGACGGCTCCAGAATGAATGTCGTGGCTATAACCTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104710 TCTGAGTTGCGACGGCTCCAGAATGAATGTCGTGGCTATAACCTCCAACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGACCATGATATCCAGAGGTGGCTACAGGGGCTCCGGCCACTGACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104760 TGACCATGATATCCAGAGGTGGCTACAGGGGCTCCGGCCACTGACAGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CTCAGAG         CCATCGTGTATCCTGTGAGGTGGAGCCACCCGGT
        |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| |||
 104810 CTCAGAGGTG...CAGCCATCGTGTATCCTGTGAGGTGGAGCCACCTGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TCCAGTGACCCTCCTGCCCCACGGGTGCTTCGGCCAACATTGGTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104946 TCCAGTGACCCTCCTGCCCCACGGGTGCTTCGGCCAACATTGGTCATCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCAGTGGACAGA         GGTTTTGGGCTCTGTTGGGGTCCCTACCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104996 GCAGTGGACAGAGTG...CAGGGTTTTGGGCTCTGTTGGGGTCCCTACCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CGCTTGTGTCCTGTGACCGGCCCAGTACTGGGGGAGATGAGGCGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105116 CGCTTGTGTCCTGTGACCGGCCCAGTACTGGGGGAGATGAGGCGCCTACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ACTCCTGCTCCTCTGCTGACTCGGCTGGCCCAG         CACATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105166 ACTCCTGCTCCTCTGCTGACTCGGCTGGCCCAGGTG...TAGCACATGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GTGGCCATCTGTCTCGTCACTAGACTCTGCCTTGGAAAGCAGTCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105313 GTGGCCATCTGTCTCGTCACTAGACTCTGCCTTGGAAAGCAGTCCATCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGCACAGTCCAGCTGACCCCAGCCACCTCTCCCCACCAGCCTCCTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105363 TGCACAGTCCAGCTGACCCCAGCCACCTCTCCCCACCAGCCTCCTCCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 AGGCCTTCTCGAGGTCACCGCCGCTCAGCCTCCTGTGGCTCCCCGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105413 AGGCCTTCTCGAGGTCACCGCCGCTCAGCCTCCTGTGGCTCCCCGCTGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TGGGGGTGCAGAAGAGGCCTCCGGGGGGACTGGATATGGGGGAGAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105463 TGGGGGTGCAGAAGAGGCCTCCGGGGGGACTGGATATGGGGGAGAGGGAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CTGGGCCAGGGGCCTCTGATTGCCGTATCATCCGAGTCCAGATGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105513 CTGGGCCAGGGGCCTCTGATTGCCGTATCATCCGAGTCCAGATGGAGTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GGGGAAGATGGCAGTGTCTATAAGAGCATTTTG         GTGACAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105563 GGGGAAGATGGCAGTGTCTATAAGAGCATTTTGGTG...CAGGTGACAAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CCAGGACAAGGCTCCAAGTGTCATCAGTCGTGTCCTTAAGAAAAACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106075 CCAGGACAAGGCTCCAAGTGTCATCAGTCGTGTCCTTAAGAAAAACAATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GTGACTCTGCAGTGGCTTCAGAGTATGAGCTGGTACAGCTGCTACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106125 GTGACTCTGCAGTGGCTTCAGAGTATGAGCTGGTACAGCTGCTACCAGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GAGCGAG         AGCTGACTATCCCAGCCTCGGCTAATGTATTCTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106175 GAGCGAGGTC...CAGAGCTGACTATCCCAGCCTCGGCTAATGTATTCTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CGCCATGGATGGAGCTTCACACGATTTCCTCCTGCGGCAGCGGCGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106332 CGCCATGGATGGAGCTTCACACGATTTCCTCCTGCGGCAGCGGCGAAGGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 CCTCTACTGCTACACCTGGCGTCACCAGTGGCCCGTCTGCCTCAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106382 CCTCTACTGCTACACCTGGCGTCACCAGTGGCCCGTCTGCCTCAGGAACT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 CCTCCGAGTGAGGGAGGAGGGGGCTCCTTTCCCAGGATCAAGGCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106432 CCTCCGAGTGAGGGAGGAGGGGGCTCCTTTCCCAGGATCAAGGCCACAGG

   2450     .    :    .    :    .
   2307 GAGGAAGATTGCACGGGCACTGTTC
        |||||||||||||||||||||||||
 106482 GAGGAAGATTGCACGGGCACTGTTC