seq1 = pF1KE2281.tfa, 2529 bp
seq2 = pF1KE2281/gi568815597r_149843860.tfa (gi568815597r:149843860_150077510), 233651 bp

>pF1KE2281 2529
>gi568815597r:149843860_150077510 (Chr1)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-274  (106260-106448)   100% ->
275-502  (109990-110217)   100% ->
503-604  (111633-111734)   100% ->
605-732  (113162-113289)   100% ->
733-845  (117715-117827)   100% ->
846-973  (127290-127417)   100% ->
974-1123  (127733-127882)   100% ->
1124-1238  (128428-128542)   100% ->
1239-1323  (130176-130260)   100% ->
1324-2529  (132446-133651)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCTGGACATGGATGCTGTTCTGTCAGATTTTGTCCGTTCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCTGGACATGGATGCTGTTCTGTCAGATTTTGTCCGTTCCACAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCAGAGCCAGGGCTAGCGCGAGATCTCCTAGAAG         GAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 AGCAGAGCCAGGGCTAGCGCGAGATCTCCTAGAAGGTG...CAGGAAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTGGGATGTGAATGCCGCCCTCAGTGATTTTGAACAGCTACGTCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106266 ATTGGGATGTGAATGCCGCCCTCAGTGATTTTGAACAGCTACGTCAAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATGCTGGAAACCTACCCCCATCCTTTAGTGAGGGGAGTGGTGGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106316 CATGCTGGAAACCTACCCCCATCCTTTAGTGAGGGGAGTGGTGGCTCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACCCCTGAAAAAGGGTTTTCTGACAGAGAGCCTACTCGCCCTCCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106366 GACCCCTGAAAAAGGGTTTTCTGACAGAGAGCCTACTCGCCCTCCCCGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCATCCTCCAGCGGCAGGATGACATCGTTCAAG         AAAAACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106416 CCATCCTCCAGCGGCAGGATGACATCGTTCAAGGTA...CAGAAAAACGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGTCTAGGGGCATCTCCCACGCCAGCTCCAGCATTGTTTCCCTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109998 CTGTCTAGGGGCATCTCCCACGCCAGCTCCAGCATTGTTTCCCTGGCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCCCATGTCTCCTCCAATGGTGGGGGTGGGGGGAGCAATGAGCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110048 GTCCCATGTCTCCTCCAATGGTGGGGGTGGGGGGAGCAATGAGCACCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGAAATGCCCATCTGTGCCTTCCAGCTTCCAGATCTCACTGTATACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110098 TGGAAATGCCCATCTGTGCCTTCCAGCTTCCAGATCTCACTGTATACAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGACTTCCGCAGCTTCATAGAGAGAGACCTCATTGAGCAGTCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110148 GAAGACTTCCGCAGCTTCATAGAGAGAGACCTCATTGAGCAGTCCATGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTTGCCTTGGAACAGGCAG         GGCGTTTGAACTGGTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 110198 GGTTGCCTTGGAACAGGCAGGTC...CAGGGCGTTTGAACTGGTGGGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTGTGGATCCCACCTCTCAGAGGCTGCTTCCTTTGGCAACTACTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111654 GTGTGGATCCCACCTCTCAGAGGCTGCTTCCTTTGGCAACTACTGGAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGAACTGCCTCCTGCATGCAGCCTCCCTTG         GAATGTGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111704 GGGAACTGCCTCCTGCATGCAGCCTCCCTTGGTG...CAGGAATGTGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTCCATGATCGGGACTTGATGCTGCGGAAAGCTTTGTATGCACTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113172 TTTCCATGATCGGGACTTGATGCTGCGGAAAGCTTTGTATGCACTGATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAGGGAGTTGAGAAGGAAGCGTTGAAAAGGCGCTGGAGGTGGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113222 AGAAGGGAGTTGAGAAGGAAGCGTTGAAAAGGCGCTGGAGGTGGCAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACACAGCAGAATAAAGAG         TCAGGGCTGGTATACACAGAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113272 ACACAGCAGAATAAAGAGGTG...CAGTCAGGGCTGGTATACACAGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAATGGCAGAAGGAGTGGAATGAACTGATCAAGCTTGCCTCAAGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117738 TGAATGGCAGAAGGAGTGGAATGAACTGATCAAGCTTGCCTCAAGTGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCCGAATGCATCTAGGTACCAATGGAGCCAACTGTGGTGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 117788 CCCGAATGCATCTAGGTACCAATGGAGCCAACTGTGGTGGGTA...CAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTGGAGAGTTCTGAGGAGCCTGTATATGAGAGCCTTGAAGAGTTTCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127291 GTGGAGAGTTCTGAGGAGCCTGTATATGAGAGCCTTGAAGAGTTTCACGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTTTGTCCTTGCTCATGTGCTTAGGAGGCCCATAGTCGTCGTGGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127341 CTTTGTCCTTGCTCATGTGCTTAGGAGGCCCATAGTCGTCGTGGCAGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCATGCTGAGGGACTCCGGAGGGGAAG         CATTTGCCCCTATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 127391 CCATGCTGAGGGACTCCGGAGGGGAAGGTG...CAGCATTTGCCCCTATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCTTTGGAGGAATCTATCTGCCTTTGGAGGTCCCAGCCAGCCAGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127747 CCCTTTGGAGGAATCTATCTGCCTTTGGAGGTCCCAGCCAGCCAGTGTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCGCTCCCCTCTGGTGCTCGCCTATGATCAGGCCCACTTTTCTGCACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127797 CCGCTCCCCTCTGGTGCTCGCCTATGATCAGGCCCACTTTTCTGCACTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGTCCATGGAGCAGAAGGAGAATACCAAGGAACAAG         CTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 127847 TGTCCATGGAGCAGAAGGAGAATACCAAGGAACAAGGTG...CAGCTGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATCCCACTTACAGATTCAGAGTATAAGCTGCTGCCCTTGCACTTTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128433 ATCCCACTTACAGATTCAGAGTATAAGCTGCTGCCCTTGCACTTTGCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGACCCTGGAAAGGGCTGGGAGTGGGGCAAAGATGATAGTGACAATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128483 GGACCCTGGAAAGGGCTGGGAGTGGGGCAAAGATGATAGTGACAATGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GATTGGCCAG         TGTAATTCTGTCCCTAGAGGTCAAATTGCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 128533 GATTGGCCAGGTA...TAGTGTAATTCTGTCCCTAGAGGTCAAATTGCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTGCTGCATAGCTACATGAATGTGAAGTGGATCCCACTGTCCTCTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130207 CTGCTGCATAGCTACATGAATGTGAAGTGGATCCCACTGTCCTCTGATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACAG         GCTCCTCTGGCCCAGCCTGAGTCCCCCACCGCCTCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130257 ACAGGTG...CAGGCTCCTCTGGCCCAGCCTGAGTCCCCCACCGCCTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CTGGAGATGAGCCCCGGTCCACTCCTGAGTCTGGAGACTCAGACAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132483 CTGGAGATGAGCCCCGGTCCACTCCTGAGTCTGGAGACTCAGACAAGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCAGTTGGCAGCAGTTCCACCAGCAACGAGGGCGGCCGGCGGAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132533 TCAGTTGGCAGCAGTTCCACCAGCAACGAGGGCGGCCGGCGGAAGGAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GTCAAAGCGAGATCGGGAGAAGGACAAGAAGAGAGCAGATTCTGTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132583 GTCAAAGCGAGATCGGGAGAAGGACAAGAAGAGAGCAGATTCTGTGGCTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACAAACTGGGCAGCTTTGGCAAAACCTTGGGCAGCAAGCTCAAGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132633 ACAAACTGGGCAGCTTTGGCAAAACCTTGGGCAGCAAGCTCAAGAAGAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATGGGGGGCCTGATGCACAGCAAGGGTTCAAAGCCTGGAGGGGTGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132683 ATGGGGGGCCTGATGCACAGCAAGGGTTCAAAGCCTGGAGGGGTGGGGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AGGGTTGGGAGGAAGCAGCGGCACTGAGACACTGGAGAAGAAGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132733 AGGGTTGGGAGGAAGCAGCGGCACTGAGACACTGGAGAAGAAGAAGAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ACTCACTGAAGAGCTGGAAGGGTGGCAAGGAGGAGGCAGCTGGGGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132783 ACTCACTGAAGAGCTGGAAGGGTGGCAAGGAGGAGGCAGCTGGGGATGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCTGTGTCTGAGAAGCCCCCAGCTGAGTCTGTTGGTAACGGAGGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132833 CCTGTGTCTGAGAAGCCCCCAGCTGAGTCTGTTGGTAACGGAGGGAGCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GTATAGCCAGGAGGTGATGCAGAGCCTGAGCATTCTGAGGACTGCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132883 GTATAGCCAGGAGGTGATGCAGAGCCTGAGCATTCTGAGGACTGCCATGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 AAGGGGAGGGGAAGTTTATTTTTGTTGGAACCCTGAAGATGGGTCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132933 AAGGGGAGGGGAAGTTTATTTTTGTTGGAACCCTGAAGATGGGTCACCGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CACCAGTATCAGGAGGAAATGATCCAGCGCTACCTTTCTGATGCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132983 CACCAGTATCAGGAGGAAATGATCCAGCGCTACCTTTCTGATGCTGAGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 GAGATTCCTGGCAGAACAGAAGCAGAAGGAGGCAGAGAGGAAGATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133033 GAGATTCCTGGCAGAACAGAAGCAGAAGGAGGCAGAGAGGAAGATCATGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 ATGGAGGAATAGGGGGTGGCCCTCCTCCAGCCAAAAAGCCAGAGCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133083 ATGGAGGAATAGGGGGTGGCCCTCCTCCAGCCAAAAAGCCAGAGCCAGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GCTAGGGAAGAGCAGCCGACCGGTCCCCCAGCAGAGTCCAGGGCAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133133 GCTAGGGAAGAGCAGCCGACCGGTCCCCCAGCAGAGTCCAGGGCAATGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 ATTTTCCACTGGCTACCCTGGGGACTTTACTATCCCTCGGCCGTCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133183 ATTTTCCACTGGCTACCCTGGGGACTTTACTATCCCTCGGCCGTCTGGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 GCGGAGTCCACTGCCAGGAACCCCGGAGGCAGTTGGCAGGGGGTCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133233 GCGGAGTCCACTGCCAGGAACCCCGGAGGCAGTTGGCAGGGGGTCCATGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 GTCGGGGGCCTACCACCATATGCCACCTTCCCCAGACAGTGCCCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133283 GTCGGGGGCCTACCACCATATGCCACCTTCCCCAGACAGTGCCCTCCTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 GCGACCCTACCCCCACCAGGACAGCATCCCTTCTCTGGAGCCAGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133333 GCGACCCTACCCCCACCAGGACAGCATCCCTTCTCTGGAGCCAGGCAGCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 ACTCTAAGGATGGACTTCACAGGGGTGCCTTGTTACCACCCCCCTACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133383 ACTCTAAGGATGGACTTCACAGGGGTGCCTTGTTACCACCCCCCTACCGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 GTGGCTGATTCCTATAGCAATGGCTACAGAGAGCCCCCTGAGCCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133433 GTGGCTGATTCCTATAGCAATGGCTACAGAGAGCCCCCTGAGCCAGATGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 ATGGGCTGGAGGTCTCCGGGGCCTTCCCCCAACTCAGACCAAATGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133483 ATGGGCTGGAGGTCTCCGGGGCCTTCCCCCAACTCAGACCAAATGCAAAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 AACCGAACTGCAGCTTCTATGGACACCCTGAGACAAACAACTTCTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133533 AACCGAACTGCAGCTTCTATGGACACCCTGAGACAAACAACTTCTGTTCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2461 TGTTGTTACAGGGAAGAACTGAGGAGGAGGGAGCGGGAACCGGATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133583 TGTTGTTACAGGGAAGAACTGAGGAGGAGGGAGCGGGAACCGGATGGGGA

   2600     .    :    .
   2511 GCTCCTGGTGCACAGGTTC
        |||||||||||||||||||
 133633 GCTCCTGGTGCACAGGTTC