seq1 = pF1KE2270.tfa, 438 bp
seq2 = pF1KE2270/gi568815578r_23533919.tfa (gi568815578r:23533919_23737862), 203944 bp

>pF1KE2270 438
>gi568815578r:23533919_23737862 (Chr20)

(complement)

1-243  (100001-100243)   99% ->
244-357  (102496-102609)   100% ->
358-438  (103864-103944)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGGCCCCTGCGCGCCCCGCTGCTCCTGCTGGCCATCCTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGGCCCCTGCGCGCCCCGCTGCTCCTGCTGGCCATCCTGGCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGGCCGTGAGCCCCGCGGCCGGCTCCAGTCCCGGCAAGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGGCCGTGAGCCCCGCGGCCGGCTCCAGTCCCGGCAAGCCGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGGTGGGAGGCCCCATGGACGCCAGCGTGGAGGAGGAGGGTGTGCGG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTAGTGGGAGGCCCCATGGACGCCAGCGTGGAGGAGGAGGGTGTGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTGCACTGGACTTTGCCGTCGGCGAGTACAACAAAGCCAGCAACGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTGCACTGGACTTTGCCGTCGGCGAGTACAACAAAGCCAGCAACGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTACCACAGCCGCGCGCTGCAGGTGGTGCGCGCCCGCAAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100201 GTACCACAGCCGCGCGCTGCAGGTGGTGCGCGCCCGCAAGCAGGTG...T

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   ATCGTAGCTGGGGTGAACTACTTCTTGGACGTGGAGCTGGGCCGAACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102494 AGATCGTAGCTGGGGTGAACTACTTCTTGGACGTGGAGCTGGGCCGAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACGTGTACCAAGACCCAGCCCAACTTGGACAACTGCCCCTTCCATGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102544 ACGTGTACCAAGACCCAGCCCAACTTGGACAACTGCCCCTTCCATGACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCACATCTGAAAAGG         AAAGCATTCTGCTCTTTCCAGATCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102594 GCCACATCTGAAAAGGGTA...CAGAAAGCATTCTGCTCTTTCCAGATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACGCTGTGCCTTGGCAGGGCACAATGACCTTGTCGAAATCCACCTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103889 ACGCTGTGCCTTGGCAGGGCACAATGACCTTGTCGAAATCCACCTGTCAG

    450     .
    433 GACGCC
        ||||||
 103939 GACGCC