seq1 = pF1KE2267.tfa, 2844 bp
seq2 = pF1KE2267/gi568815590r_58484109.tfa (gi568815590r:58484109_58759346), 275238 bp

>pF1KE2267 2844
>gi568815590r:58484109_58759346 (Chr8)

(complement)

1-152  (100001-100152)   100% ->
153-242  (116274-116363)   100% ->
243-321  (123801-123879)   100% ->
322-389  (123975-124042)   100% ->
390-426  (124122-124158)   100% ->
427-477  (127801-127851)   100% ->
478-549  (135567-135638)   100% ->
550-597  (135923-135970)   100% ->
598-650  (136075-136127)   100% ->
651-780  (149614-149743)   100% ->
781-852  (151507-151578)   100% ->
853-961  (153312-153420)   100% ->
962-1138  (155961-156137)   100% ->
1139-1218  (157210-157289)   100% ->
1219-1309  (157812-157902)   100% ->
1310-1373  (157999-158062)   100% ->
1374-1425  (159326-159377)   100% ->
1426-1546  (159477-159597)   99% ->
1547-1678  (159984-160115)   100% ->
1679-1721  (161445-161487)   100% ->
1722-1885  (161797-161960)   100% ->
1886-1985  (163688-163787)   100% ->
1986-2044  (165057-165115)   100% ->
2045-2112  (168413-168480)   100% ->
2113-2180  (169273-169340)   100% ->
2181-2304  (169772-169895)   100% ->
2305-2388  (171646-171729)   100% ->
2389-2539  (172739-172889)   100% ->
2540-2642  (173347-173449)   100% ->
2643-2752  (173586-173695)   100% ->
2753-2844  (175147-175238)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGGCCAGGCCAGATTCCACCGCGGAGCCGAGGCATGCCGAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGGCCAGGCCAGATTCCACCGCGGAGCCGAGGCATGCCGAGCTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCAGTGCAGGTCCCGGCGGCCGCGGGCAGCTCACCCGGAAGGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCAGTGCAGGTCCCGGCGGCCGCGGGCAGCTCACCCGGAAGGCCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGGTCCGGGCGTGGATCCCGGCACGCGAGCCCGGGCGTTCGCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGGTCCGGGCGTGGATCCCGGCACGCGAGCCCGGGCGTTCGCAGGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GG         ATTTTCCTTGCTGCTGCTTAACTTGGAGGAGTACTACTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGTG...CAGATTTTCCTTGCTGCTGCTTAACTTGGAGGAGTACTACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAACAGCATAGAGCCAATCACATTTTGCACAAGGGCAGTCACCATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116313 TGAACAGCATAGAGCCAATCACATTTTGCACAAGGGCAGTCACCATGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 G         GAAAATCAGAGGCTCCTTAAAAATATGTTCAAAATCGGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116363 GGTA...TAGGAAAATCAGAGGCTCCTTAAAAATATGTTCAAAATCGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTTTTGAACCAGATTCAATATCCCAGCCCATCATCAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 123841 ATTTTTGAACCAGATTCAATATCCCAGCCCATCATCAAGGTA...CAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCTTTGAGAGACTGTATAAAAATAGGAAAGCATGGAGAAAATGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123977 TCCTTTGAGAGACTGTATAAAAATAGGAAAGCATGGAGAAAATGGAGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAGACACTTCACAAA         GGCAAAATCTGGGGGTATTTCACTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 124027 ATAGACACTTCACAAAGTA...TAGGGCAAAATCTGGGGGTATTTCACTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTTTCAGTCAG         GTATATTTCATTAAAGAACATAATGTTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 124147 ATTTTCAGTCAGGTA...CAGGTATATTTCATTAAAGAACATAATGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGCACCATATAAAATAGAAAGG         GGCAAAATGGAATATGTTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 127830 TGCACCATATAAAATAGAAAGGGTA...TAGGGCAAAATGGAATATGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTGAATTGGATGTTCCCGGGAAAGTGGAAGATGTTGTGGAGACGTTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135586 TTGAATTGGATGTTCCCGGGAAAGTGGAAGATGTTGTGGAGACGTTGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CAG         CTTCACAGAGCATCCTGCCTTGACAAATTGGGTGACCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135636 CAGGTA...TAGCTTCACAGAGCATCCTGCCTTGACAAATTGGGTGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 AACCGCCATG         ATAACAGCTATTTTGCAGTCTCGTTTAGCTA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 135961 AACCGCCATGGTA...TAGATAACAGCTATTTTGCAGTCTCGTTTAGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 GAACATCATTTGACAAAAACAG         GTTCCAAAACATTTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 136106 GAACATCATTTGACAAAAACAGGTA...CAGGTTCCAAAACATTTCTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 AAGCTGCACATGGAATGCAAAGCAGAAATGGTGACGCCTCTGGTGACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149633 AAGCTGCACATGGAATGCAAAGCAGAAATGGTGACGCCTCTGGTGACTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TCCTGGACACGTGTGCATCACGGACACAAACCTGTATTTTCAGCCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149683 TCCTGGACACGTGTGCATCACGGACACAAACCTGTATTTTCAGCCCCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 ACGGCTACCCG         AAACCTGTGGTCCAGATAACACTCCAAGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 149733 ACGGCTACCCGGTG...AAGAAACCTGTGGTCCAGATAACACTCCAAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 GTCCGCCGCATCTACAAAAGGAGGCACGGCCTCATGCCTCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 151537 GTCCGCCGCATCTACAAAAGGAGGCACGGCCTCATGCCTCTGGTG...TA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    853  GGCTTGGAAGTATTTTGCACAGAAGATGATCTGTGTTCCGACATCTACC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153311 GGGCTTGGAAGTATTTTGCACAGAAGATGATCTGTGTTCCGACATCTACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 TAAAGTTCTATGAACCTCAAGATAGAGATGATCTCTATTTTTACATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153361 TAAAGTTCTATGAACCTCAAGATAGAGATGATCTCTATTTTTACATTGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 ACATACCTAG         AGCACCATGTGGCGGAGCACACTGCTGAGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 153411 ACATACCTAGGTT...CAGAGCACCATGTGGCGGAGCACACTGCTGAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 CTACATGCTGCAGTGGCAGCGTGGACACCTTTCCAACTATCAGTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155992 CTACATGCTGCAGTGGCAGCGTGGACACCTTTCCAACTATCAGTACCTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 TTCACCTCAACAACCTGGCCGACCGCAGCTGCAACGACCTCTCCCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156042 TTCACCTCAACAACCTGGCCGACCGCAGCTGCAACGACCTCTCCCAGTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 CCTGTGTTTCCATGGATAATACATGATTATTCCAGCTCAGAACTAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 156092 CCTGTGTTTCCATGGATAATACATGATTATTCCAGCTCAGAACTAGGTA.

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1139      ATTTGTCAAATCCAGGAACCTTCCGGGATCTCAGTAAGCCAGTAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156142 ..TAGATTTGTCAAATCCAGGAACCTTCCGGGATCTCAGTAAGCCAGTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 GGGCCCTAAATAAGGAACGGCTGGAGAGACTACTG         ACACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 157255 GGGCCCTAAATAAGGAACGGCTGGAGAGACTACTGGTA...TAGACACGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225 TACCAGGAAATGCCTGAACCAAAGTTCATGTATGGGAGTCACTACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157818 TACCAGGAAATGCCTGAACCAAAGTTCATGTATGGGAGTCACTACTCTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 CCCGGGTTATGTACTTTTTTATCTTGTTAGGATTG         CACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 157868 CCCGGGTTATGTACTTTTTTATCTTGTTAGGATTGGTA...TAGCACCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1316 AGTATATGCTGTGCCTGCAGAATGGAAGATTTGATAATGCAGATAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158005 AGTATATGCTGTGCCTGCAGAATGGAAGATTTGATAATGCAGATAGAATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 TTCAACAG         TATTGCAGAAACTTGGAAAAACTGTCTGGATGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 158055 TTCAACAGGTT...TAGTATTGCAGAAACTTGGAAAAACTGTCTGGATGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1407 TGCAACGGATTTTAAAGAG         TTAATTCCAGAATTCTATGGTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 159359 TGCAACGGATTTTAAAGAGGTA...CAGTTAATTCCAGAATTCTATGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1448 ATGATGTGAGCTTTCTAGTCAATAGCCTGAAGTTGGATTTGGGAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159499 ATGATGTGAGCTTTCTAGTCAATAGCCTGAAGTTGGATTTGGGAAAGAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1498 CAAGGAGGACAGATGGTTGACGATGTGGAGCTTCCCCCTTGGGCTTCCA 
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||>
 159549 CAAGGAGGACAGATGGTTGACGACGTGGAGCTTCCCCCTTGGGCTTCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547         GTCCCGAGGACTTTCTCCAGAAGAGCAAAGATGCATTGGAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159599 TG...TAGGTCCCGAGGACTTTCTCCAGAAGAGCAAAGATGCATTGGAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1589 GCAATTATGTGTCTGAACACCTTCACGAGTGGATTGATCTAATATTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160026 GCAATTATGTGTCTGAACACCTTCACGAGTGGATTGATCTAATATTTGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 TACAAACAAAAAGGGAGTGATGCAGTTGGGGCCCATAATG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 160076 TACAAACAAAAAGGGAGTGATGCAGTTGGGGCCCATAATGGTA...CAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1680 ATTTCATCCCCTGACCTATGAAGGAGGTGTAGACTTGAACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 161446 ATTTCATCCCCTGACCTATGAAGGAGGTGTAGACTTGAACAGGTA...AA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1722  CATCCAGGATCCTGATGAGAAGGTAGCCATGCTTACGCAAATCTTGGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161796 GCATCCAGGATCCTGATGAGAAGGTAGCCATGCTTACGCAAATCTTGGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1771 TTTGGGCAGACACCAAAACAACTATTTGTGACACCACATCCTCGAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161846 TTTGGGCAGACACCAAAACAACTATTTGTGACACCACATCCTCGAAGGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1821 CACCCCAAAGTTTAAAAGTTTGTCCCAGACCTCCAGTTATAATGCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161896 CACCCCAAAGTTTAAAAGTTTGTCCCAGACCTCCAGTTATAATGCTTCTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1871 TGGCAGATTCCCCAG         GTGAAGAGTCTTTTGAAGACCTGACC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 161946 TGGCAGATTCCCCAGGTA...CAGGTGAAGAGTCTTTTGAAGACCTGACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1912 GAAGAAAGCAAAACACTGGCCTGGAATAACATCACCAAACTGCAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163714 GAAGAAAGCAAAACACTGGCCTGGAATAACATCACCAAACTGCAGTTACA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1962 CGAGCACTATAAAATCCACAAAGA         AGCAGTTACTGGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 163764 CGAGCACTATAAAATCCACAAAGAGTA...CAGAGCAGTTACTGGAATCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2003 CGGTCTCTCGCAATGGATCTTCAGTATTCACAACATCCCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 165074 CGGTCTCTCGCAATGGATCTTCAGTATTCACAACATCCCAAGGTC...TA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2045  ATTCCACCTTGAAGATGTTTTCTAAAGAATCAAAAATGCTACAAAGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168412 GATTCCACCTTGAAGATGTTTTCTAAAGAATCAAAAATGCTACAAAGAAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2094 TATATCATTTTCAAATATG         GCTTTATCGTCTTGTTTACTTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 168462 TATATCATTTTCAAATATGGTG...CAGGCTTTATCGTCTTGTTTACTTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2135 TACCAGGAGATGCCACTGTCATAACTTCTTCATGGGATAATAATGT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 169295 TACCAGGAGATGCCACTGTCATAACTTCTTCATGGGATAATAATGTGTA.

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2181      CTATTTTTATTCCATAGCATTTGGAAGACGCCAGGACACGTTAAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169345 ..TAGCTATTTTTATTCCATAGCATTTGGAAGACGCCAGGACACGTTAAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2226 GGGACATGATGATGCTGTTAGTAAGATCTGTTGGCATGACAACAGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169817 GGGACATGATGATGCTGTTAGTAAGATCTGTTGGCATGACAACAGGCTAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2276 ATTCTGCATCGTGGGACTCTACAGTGAAG         GTGTGGTCTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 169867 ATTCTGCATCGTGGGACTCTACAGTGAAGGTT...TAGGTGTGGTCTGGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2317 GTTCCTGCAGAGATGCCAGGCACCAAAAGACACCACTTTGACTTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171658 GTTCCTGCAGAGATGCCAGGCACCAAAAGACACCACTTTGACTTGCTGGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2367 CGAGCTGGAACATGATGTCAGT         GTAGATACAATCAGTTTAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 171708 CGAGCTGGAACATGATGTCAGTGTG...TAGGTAGATACAATCAGTTTAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2408 ATGCTGCAAGCACACTGTTAGTTTCCGGCACCAAAGAAGGCACAGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172758 ATGCTGCAAGCACACTGTTAGTTTCCGGCACCAAAGAAGGCACAGTGAAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2458 ATTTGGGACCTCACAACGGCCACCTTAATGCACCAGATTCCATGCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172808 ATTTGGGACCTCACAACGGCCACCTTAATGCACCAGATTCCATGCCATTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2508 AGGGATTGTATGTGACACTGCTTTTAGCCCAG         ATAGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 172858 AGGGATTGTATGTGACACTGCTTTTAGCCCAGGTA...CAGATAGTCGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2549 ATGTCCTCAGCACAGGAACAGATGGCTGTCTTAATGTCATTGATGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173356 ATGTCCTCAGCACAGGAACAGATGGCTGTCTTAATGTCATTGATGTGCAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2599 ACAGGAATGCTCATCTCCTCCATGACATCAGATGAGCCCCAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 173406 ACAGGAATGCTCATCTCCTCCATGACATCAGATGAGCCCCAGAGGTA...

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2643    GTGCTTTGTCTGGGATGGAAATTCCGTTTTATCTGGCAGTCAGTCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173583 CAGGTGCTTTGTCTGGGATGGAAATTCCGTTTTATCTGGCAGTCAGTCTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2690 GTGAACTGCTCGTTTGGGACCTCCTTGGAGCAAAAATCAGTGAGAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173633 GTGAACTGCTCGTTTGGGACCTCCTTGGAGCAAAAATCAGTGAGAGAATA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2740 CAGGGCCACACAG         GTGCTGTGACATGTATATGGATGAATGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 173683 CAGGGCCACACAGGTA...CAGGTGCTGTGACATGTATATGGATGAATGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2781 ACAGTGTAGCAGTATCATCACAGGAGGGGAAGACAGACAAATTATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175175 ACAGTGTAGCAGTATCATCACAGGAGGGGAAGACAGACAAATTATATTCT

   3100     .    :
   2831 GGAAATTGCAGTAT
        ||||||||||||||
 175225 GGAAATTGCAGTAT