seq1 = pF1KE2265.tfa, 1344 bp
seq2 = pF1KE2265/gi568815590f_124350928.tfa (gi568815590f:124350928_124552271), 201344 bp

>pF1KE2265 1344
>gi568815590f:124350928_124552271 (Chr8)

1-1344  (100001-101344)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAGAGAATGTGGTTGTTAGCAACATGGAGAGAGAAAGTGGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAGAGAATGTGGTTGTTAGCAACATGGAGAGAGAAAGTGGGAAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGCTGTTGTCGCAGTTGTGACTGAGCCTCGGTTTACCCAGCGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100051 CGTGGCTGTTGTCGCAGTTGTGACTGAGCCTTGGTTTACCCAGCGATACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGAATATCTCCAGAGGCAGAAACTCTTTGATACACAGCACCGTGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGAATATCTCCAGAGGCAGAAACTCTTTGATACACAGCACCGTGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGATGCCGGATGGCTCGGTGGCGCTACCGGTGCTGGGAGAGACGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGATGCCGGATGGCTCGGTGGCGCTACCGGTGCTGGGAGAGACGCTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAGCAGCACCTGCAGGAGCTGAGGAATCGTGTTGCCCCAGGCAGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAGCAGCACCTGCAGGAGCTGAGGAATCGTGTTGCCCCAGGCAGTCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTATGCTCACGCAGCTCCCGGATCCTGTTCCTTCGAAGAGGGCCCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTATGCTCACGCAGCTCCCGGATCCTGTTCCTTCGAAGAGGGCCCAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGTTCACCTGCCCAAAAATTGTGTCTTGAGGTGAGTCGCTGGGTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGTTCACCTGCCCAAAAATTGTGTCTTGAGGTGAGTCGCTGGGTGGAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCGGGGAGTCAAGTGGTCAGCCGAGTTGGAGGCTGATTTGCCCCGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCGGGGAGTCAAGTGGTCAGCCGAGTTGGAGGCTGATTTGCCCCGATCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCAACGGCATGGTAATCTCTTGTTGCTGAGTGAAGACTGTTTCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCAACGGCATGGTAATCTCTTGTTGCTGAGTGAAGACTGTTTCCAAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGCAGTGGAAAAATCTGGGACCGGAACTCTGGGAGACCGTTGCCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGCAGTGGAAAAATCTGGGACCGGAACTCTGGGAGACCGTTGCCTTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTTGGCGTCCAGCGTTTGGCAAAACGAGGGCGGGTATCACCGGATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTTGGCGTCCAGCGTTTGGCAAAACGAGGGCGGGTATCACCGGATGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCGAACTCCAGCAGTGACACTGCTGCTGGGTGACCATGGCTGGGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCGAACTCCAGCAGTGACACTGCTGCTGGGTGACCATGGCTGGGTAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CATGTGGATAATGGTATCCGTTATAAGTTTGACGTGACCCAGTGTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CATGTGGATAATGGTATCCGTTATAAGTTTGACGTGACCCAGTGTATGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTTTGGAAACATCACTGAGAAGCTTCGAGTGGCATCGTTGTCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCTTTGGAAACATCACTGAGAAGCTTCGAGTGGCATCGTTGTCCTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGGAGAAGTGCTGGTGGATCTCTATGCAGGGATTGGTTATTTTACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGGAGAAGTGCTGGTGGATCTCTATGCAGGGATTGGTTATTTTACATTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTTTCCTAGTTCATGCTGGTGCTGCCTTCGTCCATGCTTGTGAGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTTTCCTAGTTCATGCTGGTGCTGCCTTCGTCCATGCTTGTGAGTGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCCCCATGCTGTAGTTGCTCTGAGAAATAACCTTGAGATCAATGGAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCCCCATGCTGTAGTTGCTCTGAGAAATAACCTTGAGATCAATGGAGTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGATCGGTGCCAAATACACTTTGGAGATAACAGAAAACTGAAGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGATCGGTGCCAAATACACTTTGGAGATAACAGAAAACTGAAGCTCTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AATATTGCAGATAGGGTGATCCTGGGGCTGATTCCCAGCTCTGAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATATTGCAGATAGGGTGATCCTGGGGCTGATTCCCAGCTCTGAAGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTGGCCCATTGCCTGCCAAGTGTTAAGGCAGGATGCTGGAGGCATTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTGGCCCATTGCCTGCCAAGTGTTAAGGCAGGATGCTGGAGGCATTTTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATATCCACCAAAATGTGGAATCTTTCCCAGGGAAGAATCTTCAGGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATATCCACCAAAATGTGGAATCTTTCCCAGGGAAGAATCTTCAGGCTCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGAGTCAGCAAAGTAGAGAAAGAGCATTGGCTGTATCCTCAGCAAATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGAGTCAGCAAAGTAGAGAAAGAGCATTGGCTGTATCCTCAGCAAATTAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACCAACCAATGGAAAAATGGAGCTACCAGGGATTCTAGGGGAAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CACCAACCAATGGAAAAATGGAGCTACCAGGGATTCTAGGGGAAAAATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGTCACCAGCCACCAAGCCAGAGTGGCAAAGGTGGGCAGAATCTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGTCACCAGCCACCAAGCCAGAGTGGCAAAGGTGGGCAGAATCTGCAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACTCGAATCGCCACTCTTCTTCAGCAGGTGCATGGGAAACCATGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACTCGAATCGCCACTCTTCTTCAGCAGGTGCATGGGAAACCATGGAAGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACAAATTCTGCACATCCAACCAGTGAAATCCTATGCTCCCCATGTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACAAATTCTGCACATCCAACCAGTGAAATCCTATGCTCCCCATGTGGATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACATAGTCCTGGATCTGGAATGCTGCCCCTGTCCTTCAGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACATAGTCCTGGATCTGGAATGCTGCCCCTGTCCTTCAGTTGGC