seq1 = pF1KE2261.tfa, 2178 bp
seq2 = pF1KE2261/gi568815586r_48593036.tfa (gi568815586r:48593036_48816675), 223640 bp

>pF1KE2261 2178
>gi568815586r:48593036_48816675 (Chr12)

(complement)

1-161  (100001-100161)   100% ->
162-243  (102152-102233)   100% ->
244-372  (110780-110908)   100% ->
373-433  (115603-115663)   100% ->
434-496  (116836-116898)   100% ->
497-542  (118493-118538)   100% ->
543-706  (120514-120677)   100% ->
707-777  (120847-120917)   100% ->
778-2178  (122240-123640)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGGAGAGAGGAAGAACAACAACAAACGGTGGTATTTCACTCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGGAGAGAGGAAGAACAACAACAAACGGTGGTATTTCACTCGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGCTGGAAAATAGCCCATCCCGTCGTTTTGGCGTGGACCCAGATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGCTGGAAAATAGCCCATCCCGTCGTTTTGGCGTGGACCCAGATAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACTTTCTTATCGCCAGCAGGCGGCCAATCTGCTTCAGGACATGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AACTTTCTTATCGCCAGCAGGCGGCCAATCTGCTTCAGGACATGGGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTCTTAACGT         CTCACAATTGACTATCAACACTGCTATAGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTCTTAACGTGTA...CAGCTCACAATTGACTATCAACACTGCTATAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATACATGCATCGATTCTACATGATTCAGTCCTTCACACAGTTCCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102182 ATACATGCATCGATTCTACATGATTCAGTCCTTCACACAGTTCCCTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AT         TCTGTGGCTCCAGCAGCCTTGTTTCTAGCAGCTAAAGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102232 ATGTA...CAGTCTGTGGCTCCAGCAGCCTTGTTTCTAGCAGCTAAAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAGCAGCCCAAAAAATTGGAACATGTCATCAAGGTAGCACATACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110819 GAGGAGCAGCCCAAAAAATTGGAACATGTCATCAAGGTAGCACATACTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTCCATCCTCAGGAATCCCTTCCTGATACTAGAAGTGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 110869 TCTCCATCCTCAGGAATCCCTTCCTGATACTAGAAGTGAGGTA...TAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTATTTGCAACAAGTTCAAGATCTGGTCATTTTAGAAAGCATAATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115604 CTTATTTGCAACAAGTTCAAGATCTGGTCATTTTAGAAAGCATAATTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGACTTTAG         GCTTTGAACTAACAATTGATCACCCACATAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 115654 CAGACTTTAGGTA...AAGGCTTTGAACTAACAATTGATCACCCACATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCATGTAGTAAAGTGCACTCAACTTGTTCGAG         CAAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116867 TCATGTAGTAAAGTGCACTCAACTTGTTCGAGGTA...TAGCAAGCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACTTAGCACAGACTTCTTACTTCATGGCAACCAACAG         CCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118502 ACTTAGCACAGACTTCTTACTTCATGGCAACCAACAGGTT...CAGCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CATTTGACCACATTTAGCCTGCAGTACACACCTCCTGTGGTGGCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120518 CATTTGACCACATTTAGCCTGCAGTACACACCTCCTGTGGTGGCCTGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTGCATTCACCTGGCTTGCAAGTGGTCCAATTGGGAGATCCCAGTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120568 CTGCATTCACCTGGCTTGCAAGTGGTCCAATTGGGAGATCCCAGTCTCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGACGGGAAGCACTGGTGGGAGTATGTTGACGCCACTGTGACCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120618 CTGACGGGAAGCACTGGTGGGAGTATGTTGACGCCACTGTGACCTTGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTTTTAGATG         AACTGACACATGAGTTTCTACAGATTTTGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 120668 CTTTTAGATGGTA...TAGAACTGACACATGAGTTTCTACAGATTTTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAAAACTCCCAACAGGCTCAAACGCATTTGGAATTGGAGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 120878 GAAAACTCCCAACAGGCTCAAACGCATTTGGAATTGGAGGGTA...CAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CATGCGAGGCTGCCAAGAAAACAAAAGCAGATGACCGAGGAACAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122241 CATGCGAGGCTGCCAAGAAAACAAAAGCAGATGACCGAGGAACAGATGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAGACTTCAGAGCAGACAATCCTCAATATGATTTCCCAGAGCTCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122291 AAGACTTCAGAGCAGACAATCCTCAATATGATTTCCCAGAGCTCTTCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CACAACCATTGCAGGTTTAATGAGCATGTCAACTTCTACCACAAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122341 CACAACCATTGCAGGTTTAATGAGCATGTCAACTTCTACCACAAGTGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGCCTTCCCTGCCAGTCTCCGAAGAGTCATCCAGCAACTTAACCAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122391 TGCCTTCCCTGCCAGTCTCCGAAGAGTCATCCAGCAACTTAACCAGTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGATGTTGCCGGGCAAGCGTTGGCTGTCCTCCCAACCTTCTTTCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122441 GAGATGTTGCCGGGCAAGCGTTGGCTGTCCTCCCAACCTTCTTTCAAACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGAACCTACTCAGGGTCATCGGACTAGTGAGAATTTAGCACTTACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122491 AGAACCTACTCAGGGTCATCGGACTAGTGAGAATTTAGCACTTACAGGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTGATCATTCCTTACCACAGGATGGTTCAAATGCATTTATTTCCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122541 TTGATCATTCCTTACCACAGGATGGTTCAAATGCATTTATTTCCCAGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CAGAATAGTAAGAGTGTGCCATCAGCTAAAGTGTCACTGAAAGAATACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122591 CAGAATAGTAAGAGTGTGCCATCAGCTAAAGTGTCACTGAAAGAATACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CGCGAAGCATGCAGAAGAATTGGCTGCCCAGAAGAGGCAACTGGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122641 CGCGAAGCATGCAGAAGAATTGGCTGCCCAGAAGAGGCAACTGGAGAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGAAGCCAATGTGAAGTCACAATATGCATATGCTGCCCAGAATCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122691 TGGAAGCCAATGTGAAGTCACAATATGCATATGCTGCCCAGAATCTCCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TCTCATCATGATAGCCATTCTTCAGTCATTCTAAAAATGCCCATAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122741 TCTCATCATGATAGCCATTCTTCAGTCATTCTAAAAATGCCCATAGAGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TTCAGAAAACCCGGAGCGGCCTTTTCTGGAAAAGGCTGACAAAACAGCTC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122791 TTCAGAAAACCCCGAGCGGCCTTTTCTGGAAAAGGCTGACAAAACAGCTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCAAAATGAGAATCCCAGTGGCAGGTGGAGATAAAGCTGCGTCTTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122841 TCAAAATGAGAATCCCAGTGGCAGGTGGAGATAAAGCTGCGTCTTCAAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CCAGAGGAGATAAAAATGCGCATAAAAGTCCATGCTGCAGCTGATAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122891 CCAGAGGAGATAAAAATGCGCATAAAAGTCCATGCTGCAGCTGATAAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CAATTCTGTAGAGGACAGTGTTACAAAGAGCCGAGAGCACAAAGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122941 CAATTCTGTAGAGGACAGTGTTACAAAGAGCCGAGAGCACAAAGAAAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 ACAAGACTCACCCATCTAATCATCATCATCATCATAATCACCACTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122991 ACAAGACTCACCCATCTAATCATCATCATCATCATAATCACCACTCACAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AAGCACTCTCATTCCCAACTTCCAGTTGGTACTGGGAACAAACGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123041 AAGCACTCTCATTCCCAACTTCCAGTTGGTACTGGGAACAAACGTCCTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TGATCCAAAACATAGTAGCCAGACAAGCAACTTAGCACATAAAACCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123091 TGATCCAAAACATAGTAGCCAGACAAGCAACTTAGCACATAAAACCTATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 GCTTGTCTAGTTCTTTTTCCTCTTCCAGTTCTACTCGTAAAAGGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123141 GCTTGTCTAGTTCTTTTTCCTCTTCCAGTTCTACTCGTAAAAGGGGACCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TCTGAAGAGACTGGAGGGGCTGTGTTTGATCATCCAGCCAAGATTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123191 TCTGAAGAGACTGGAGGGGCTGTGTTTGATCATCCAGCCAAGATTGCCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GAGTACTAAATCCTCTTCCCTAAATTTCTCCTTCCCTTCACTTCCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123241 GAGTACTAAATCCTCTTCCCTAAATTTCTCCTTCCCTTCACTTCCTACAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TGGGTCAGATGCCTGGGCATAGCTCAGACACAAGTGGCCTTTCCTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123291 TGGGTCAGATGCCTGGGCATAGCTCAGACACAAGTGGCCTTTCCTTTTCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CAGCCCAGCTGTAAAACTCGTGTCCCTCATTCGAAACTGGATAAAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123341 CAGCCCAGCTGTAAAACTCGTGTCCCTCATTCGAAACTGGATAAAGGGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CACTGGGGCCAATGGTCACAACACGACCCAGACAATAGACTATCAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123391 CACTGGGGCCAATGGTCACAACACGACCCAGACAATAGACTATCAAGACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 CTGTGAATATGCTTCACTCCCTGCTCAGTGCCCAGGGTGTTCAGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123441 CTGTGAATATGCTTCACTCCCTGCTCAGTGCCCAGGGTGTTCAGCCCACT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 CAGCCTACTGCATTTGAATTTGTTCGTCCTTATAGTGACTATCTGAATCC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123491 CAGCCCACTGCATTTGAATTTGTTCGTCCTTATAGTGACTATCTGAATCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 TCGGTCTGGTGGAATCTCCTCGAGATCTGGCAATACAGACAAACCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123541 TCGGTCTGGTGGAATCTCCTCGAGATCTGGCAATACAGACAAACCCCGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 CACCACCTCTGCCATCAGAACCTCCTCCACCACTTCCACCCCTTCCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123591 CACCACCTCTGCCATCAGAACCTCCTCCACCACTTCCACCCCTTCCTAAG