seq1 = pF1KE2250.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KE2250/gi568815581r_4182838.tfa (gi568815581r:4182838_4466316), 283479 bp

>pF1KE2250 510
>gi568815581r:4182838_4466316 (Chr17)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-149  (159194-159296)   100% ->
150-247  (169503-169600)   100% ->
248-426  (176909-177087)   100% ->
427-510  (183396-183479)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGAGCTGCAGTCGGCACTGCTACTGCGAAGACAGCTGGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGACGGAGCTGCAGTCGGCACTGCTACTGCGAAGACAGCTGGCAGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      AACTCAACAAAAATCCAGTGGAAGGCTTTTCTGCAGGTTTAATAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGAACTCAACAAAAATCCAGTGGAAGGCTTTTCTGCAGGTTTAATAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGACAATGATCTCTACCGATGGGAAGTCCTTATTATTGGCCCTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159239 ATGACAATGATCTCTACCGATGGGAAGTCCTTATTATTGGCCCTCCAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACACTTTA         TGAAGGTGGTGTTTTTAAGGCTCATCTTACTTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 159289 ACACTTTAGTA...CAGTGAAGGTGGTGTTTTTAAGGCTCATCTTACTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCAAAAGATTATCCCCTCCGACCTCCTAAAATGAAATTCATTACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169536 CCCAAAAGATTATCCCCTCCGACCTCCTAAAATGAAATTCATTACAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTGGCACCCAAATG         TTGATAAAAATGGTGATGTGTGCATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 169586 TCTGGCACCCAAATGGTA...CAGTTGATAAAAATGGTGATGTGTGCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCTATTCTTCATGAGCCTGGGGAAGATAAGTATGGTTATGAAAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176935 TCTATTCTTCATGAGCCTGGGGAAGATAAGTATGGTTATGAAAAGCCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAACGCTGGCTCCCTATCCACACTGTGGAAACCATCATGATTAGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176985 GGAACGCTGGCTCCCTATCCACACTGTGGAAACCATCATGATTAGTGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTTCTATGCTGGCAGACCCTAATGGAGACTCACCTGCTAATGTTGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177035 TTTCTATGCTGGCAGACCCTAATGGAGACTCACCTGCTAATGTTGATGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCG         AAAGAATGGAGGGAAGATAGAAATGGAGAATTTAAAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177085 GCGGTA...CAGAAAGAATGGAGGGAAGATAGAAATGGAGAATTTAAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    465 AAAAGTTGCCCGCTGTGTAAGAAAAAGCCAAGAGACTGCTTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183434 AAAAGTTGCCCGCTGTGTAAGAAAAAGCCAAGAGACTGCTTTTGAG