seq1 = pF1KE2247.tfa, 2676 bp
seq2 = pF1KE2247/gi568815584r_68774862.tfa (gi568815584r:68774862_69079056), 304195 bp

>pF1KE2247 2676
>gi568815584r:68774862_69079056 (Chr14)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-220  (153385-153499)   100% ->
221-340  (157932-158051)   100% ->
341-427  (166815-166901)   100% ->
428-515  (169015-169102)   100% ->
516-594  (169661-169739)   100% ->
595-676  (174321-174402)   100% ->
677-762  (176495-176580)   100% ->
763-855  (185310-185402)   100% ->
856-1086  (186774-187004)   100% ->
1087-1234  (188771-188918)   100% ->
1235-1385  (193482-193632)   100% ->
1386-1494  (194174-194282)   100% ->
1495-1635  (194749-194889)   100% ->
1636-1818  (196002-196184)   100% ->
1819-1953  (196465-196599)   100% ->
1954-2133  (198068-198247)   100% ->
2134-2280  (198949-199095)   100% ->
2281-2361  (199988-200068)   100% ->
2362-2520  (201817-201975)   100% ->
2521-2676  (204040-204195)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCATTATGATTCTCAGCAAACCAACGATTACATGCAGCCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCATTATGATTCTCAGCAAACCAACGATTACATGCAGCCAGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACTGGGACCGGGACCTGCTCCTGGACCCGGCCTGGGAGAAGCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACTGGGACCGGGACCTGCTCCTGGACCCGGCCTGGGAGAAGCAGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAAG         ACATTCACGGCATGGTGTAACTCCCACCTCCGGAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAAGGTT...CAGACATTCACGGCATGGTGTAACTCCCACCTCCGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGGGACACAGATCGAGAACATCGAAGAGGACTTCCGGGATGGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153421 GCGGGGACACAGATCGAGAACATCGAAGAGGACTTCCGGGATGGCCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTCATGCTGCTGCTGGAGGTCATCTCAG         GTGAACGCTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 153471 GCTCATGCTGCTGCTGGAGGTCATCTCAGGTG...CAGGTGAACGCTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCAAGCCAGAGCGAGGCAAGATGAGAGTGCACAAGATCTCCAACGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157944 CCAAGCCAGAGCGAGGCAAGATGAGAGTGCACAAGATCTCCAACGTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGCCCTGGATTTCATAGCCAGCAAAGGCGTCAAACTGGTGTCCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157994 AAGGCCCTGGATTTCATAGCCAGCAAAGGCGTCAAACTGGTGTCCATCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCCGAAG         AAATCGTGGATGGGAATGTGAAGATGACCCTGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 158044 AGCCGAAGGTA...TAGAAATCGTGGATGGGAATGTGAAGATGACCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCATGATCTGGACCATCATCCTGCGCTTTGCCATCCAGGACATCTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166848 GCATGATCTGGACCATCATCCTGCGCTTTGCCATCCAGGACATCTCCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAG         AGACTTCAGCCAAGGAAGGGCTGCTCCTGTGGTGTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166898 GAAGGTG...TAGAGACTTCAGCCAAGGAAGGGCTGCTCCTGTGGTGTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGAAAGACAGCCCCTTACAAAAATGTCAACATCCAGAACTTCCACATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169052 GAGAAAGACAGCCCCTTACAAAAATGTCAACATCCAGAACTTCCACATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 G         CTGGAAGGATGGCCTCGGCTTCTGTGCTTTGATCCACCGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169102 GGTG...CAGCTGGAAGGATGGCCTCGGCTTCTGTGCTTTGATCCACCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACCGGCCCGAGCTGATTGACTACGGGAAGCTGCGGAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 169701 CACCGGCCCGAGCTGATTGACTACGGGAAGCTGCGGAAGGTA...TAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGATCCACTCACAAATCTGAATACGGCTTTTGACGTGGCAGAGAAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174323 TGATCCACTCACAAATCTGAATACGGCTTTTGACGTGGCAGAGAAGTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGACATCCCCAAGATGCTGGATGCCGAAG         ACATCGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 174373 TGGACATCCCCAAGATGCTGGATGCCGAAGGTG...CAGACATCGTTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACTGCCCGACCGGATGAGAAAGCCATCATGACTTACGTGTCTAGCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176506 ACTGCCCGACCGGATGAGAAAGCCATCATGACTTACGTGTCTAGCTTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCACGCCTTCTCTGGAGCCCAGAAG         GCGGAGACAGCAGCCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 176556 CCACGCCTTCTCTGGAGCCCAGAAGGTA...CAGGCGGAGACAGCAGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATCGCATCTGCAAGGTGTTGGCCGTCAACCAGGAGAACGAGCAGCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185326 ATCGCATCTGCAAGGTGTTGGCCGTCAACCAGGAGAACGAGCAGCTTATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GAAGACTACGAGAAGCTGGCCAGTGAT         CTGTTGGAGTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 185376 GAAGACTACGAGAAGCTGGCCAGTGATGTG...TAGCTGTTGGAGTGGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CCGCCGCACAATCCCGTGGCTGGAGAACCGGGTGCCCGAGAACACCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186788 CCGCCGCACAATCCCGTGGCTGGAGAACCGGGTGCCCGAGAACACCATGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ATGCCATGCAACAGAAGCTGGAGGACTTCCGGGACTACCGGCGCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186838 ATGCCATGCAACAGAAGCTGGAGGACTTCCGGGACTACCGGCGCCTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGCCGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186888 AAGCCGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAACCGGCCTGCCTTCATGCCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186938 GCTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAACCGGCCTGCCTTCATGCCCTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGGGCAGGATGGTCTCG         GACATCAACAATGCCTGGGGCTGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 186988 AGGGCAGGATGGTCTCGGTG...CAGGACATCAACAATGCCTGGGGCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CTGGAGCAGGTGGAGAAGGGCTATGAGGAGTGGTTGCTGAATGAGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188795 CTGGAGCAGGTGGAGAAGGGCTATGAGGAGTGGTTGCTGAATGAGATCCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GAGGCTGGAGCGACTGGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGCAGAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188845 GAGGCTGGAGCGACTGGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGCAGAAGGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CCATCCACGAGGCCTGGACTGACG         GCAAAGAGGCCATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 188895 CCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGTG...CAGGCAAAGAGGCCATGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CGACAGAAGGACTATGAGACCGCCACCCTCTCGGAGATCAAGGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193499 CGACAGAAGGACTATGAGACCGCCACCCTCTCGGAGATCAAGGCCCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAAGAAGCATGAGGCCTTCGAGAGTGACCTGGCTGCCCACCAGGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193549 CAAGAAGCATGAGGCCTTCGAGAGTGACCTGGCTGCCCACCAGGACCGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TGGAGCAGATTGCCGCCATCGCACAGGAGCTCAA         TGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 193599 TGGAGCAGATTGCCGCCATCGCACAGGAGCTCAAGTA...CAGTGAGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GACTATTATGACTCACCCAGTGTCAACGCCCGTTGCCAAAAGATCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194181 GACTATTATGACTCACCCAGTGTCAACGCCCGTTGCCAAAAGATCTGTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CCAGTGGGACAATCTGGGGGCCCTAACTCAGAAGCGAAGGGAAGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194231 CCAGTGGGACAATCTGGGGGCCCTAACTCAGAAGCGAAGGGAAGCTCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AG         CGGACCGAGAAACTGCTGGAGACCATTGACCAGCTGTAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194281 AGGTG...CAGCGGACCGAGAAACTGCTGGAGACCATTGACCAGCTGTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TTGGAGTATGCCAAGCGGGCTGCACCCTTCAACAACTGGATGGAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194788 TTGGAGTATGCCAAGCGGGCTGCACCCTTCAACAACTGGATGGAGGGGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CATGGAGGACCTGCAGGACACCTTCATTGTGCACACCATTGAGGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194838 CATGGAGGACCTGCAGGACACCTTCATTGTGCACACCATTGAGGAGATCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AG         GGACTGACCACAGCCCATGAGCAGTTCAAGGCCACCCTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194888 AGGTG...CAGGGACTGACCACAGCCCATGAGCAGTTCAAGGCCACCCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CCTGATGCCGACAAGGAGCGCCTGGCCATCCTGGGCATCCACAATGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196041 CCTGATGCCGACAAGGAGCGCCTGGCCATCCTGGGCATCCACAATGAGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GTCCAAGATTGTCCAGACCTACCACGTCAATATGGCGGGCACCAACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196091 GTCCAAGATTGTCCAGACCTACCACGTCAATATGGCGGGCACCAACCCCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ACACAACCATCACGCCTCAGGAGATCAATGGCAAATGGGACCAC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 196141 ACACAACCATCACGCCTCAGGAGATCAATGGCAAATGGGACCACGTG...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1819    GTGCGGCAGCTGGTGCCTCGGAGGGACCAAGCTCTGACGGAGGAGCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196462 CAGGTGCGGCAGCTGGTGCCTCGGAGGGACCAAGCTCTGACGGAGGAGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGCCCGACAGCAGCACAATGAGAGGCTACGCAAGCAGTTTGGAGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196512 TGCCCGACAGCAGCACAATGAGAGGCTACGCAAGCAGTTTGGAGCCCAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CCAATGTCATCGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 196562 CCAATGTCATCGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGTG...CAGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 ATCGGGAGGATCTCCATTGAGATGCATGGGACCCTGGAGGACCAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198071 ATCGGGAGGATCTCCATTGAGATGCATGGGACCCTGGAGGACCAGCTCAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CCACCTGCGGCAGTATGAGAAGAGCATCGTCAACTACAAGCCAAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198121 CCACCTGCGGCAGTATGAGAAGAGCATCGTCAACTACAAGCCAAAGATTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 ATCAGCTGGAGGGCGACCACCAGCTCATCCAGGAGGCGCTCATCTTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198171 ATCAGCTGGAGGGCGACCACCAGCTCATCCAGGAGGCGCTCATCTTCGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 AACAAGCACACCAACTACACCATGGAG         CACATCCGTGTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 198221 AACAAGCACACCAACTACACCATGGAGGTG...CAGCACATCCGTGTGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATCGCCAGGACCATCAATGAGGTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198963 CTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATCGCCAGGACCATCAATGAGGTAGAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ACCAGATCCTGACCCGGGATGCCAAGGGCATCAGCCAGGAGCAGATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199013 ACCAGATCCTGACCCGGGATGCCAAGGGCATCAGCCAGGAGCAGATGAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GAGTTCCGGGCCTCCTTCAACCACTTTGACCGG         GATCACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 199063 GAGTTCCGGGCCTCCTTCAACCACTTTGACCGGGTG...CAGGATCACTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 CGGCACACTGGGTCCCGAGGAGTTCAAAGCCTGCCTCATCAGCTTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199996 CGGCACACTGGGTCCCGAGGAGTTCAAAGCCTGCCTCATCAGCTTGGGTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 ATGATATTGGCAACGACCCCCAG         GGAGAAGCAGAATTTGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 200046 ATGATATTGGCAACGACCCCCAGGTA...CAGGGAGAAGCAGAATTTGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 CGCATCATGAGCATTGTGGACCCCAACCGCCTGGGGGTAGTGACATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201835 CGCATCATGAGCATTGTGGACCCCAACCGCCTGGGGGTAGTGACATTCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GGCCTTCATTGACTTCATGTCCCGCGAGACAGCCGACACAGATACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201885 GGCCTTCATTGACTTCATGTCCCGCGAGACAGCCGACACAGATACAGCAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 ACCAAGTCATGGCTTCCTTCAAGATCCTGGCTGGGGACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 201935 ACCAAGTCATGGCTTCCTTCAAGATCCTGGCTGGGGACAAGGTG...CAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 AACTACATTACCATGGACGAGCTGCGCCGCGAGCTGCCACCCGACCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204040 AACTACATTACCATGGACGAGCTGCGCCGCGAGCTGCCACCCGACCAGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 TGAGTACTGCATCGCGCGGATGGCCCCCTACACCGGCCCCGACTCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204090 TGAGTACTGCATCGCGCGGATGGCCCCCTACACCGGCCCCGACTCCGTGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 CAGGTGCTCTGGACTACATGTCCTTCTCCACGGCGCTGTACGGCGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204140 CAGGTGCTCTGGACTACATGTCCTTCTCCACGGCGCTGTACGGCGAGAGT

   2850     .
   2671 GACCTC
        ||||||
 204190 GACCTC