seq1 = pF1KE2241.tfa, 1527 bp
seq2 = pF1KE2241/gi568815586r_124682686.tfa (gi568815586r:124682686_124963641), 280956 bp

>pF1KE2241 1527
>gi568815586r:124682686_124963641 (Chr12)

(complement)

1-126  (99922-100047)   100% ->
127-284  (145935-146092)   100% ->
285-426  (148528-148669)   100% ->
427-630  (149237-149440)   100% ->
631-726  (151677-151772)   100% ->
727-842  (153353-153468)   100% ->
843-1009  (155715-155881)   100% ->
1010-1128  (163400-163518)   99% ->
1129-1202  (168374-168447)   100% ->
1203-1254  (176185-176236)   100% ->
1255-1401  (177139-177285)   100% ->
1402-1527  (180831-180956)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGCTCCGCCAAAGCGCGCTGGGCTGCCGGGGCGCTGGGCGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99922 ATGGGCTGCTCCGCCAAAGCGCGCTGGGCTGCCGGGGCGCTGGGCGTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGCTACTGTGCGCTGTGCTGGGCGCTGTCATGATCGTGATGGTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99972 GGGGCTACTGTGCGCTGTGCTGGGCGCTGTCATGATCGTGATGGTGCCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTCATCAAGCAGCAGGTCCTTAAG         AACGTGCGCATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100022 CGCTCATCAAGCAGCAGGTCCTTAAGGTG...CAGAACGTGCGCATCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCAGTAGCCTGTCCTTCAACATGTGGAAGGAGATCCCTATCCCCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145950 CCCAGTAGCCTGTCCTTCAACATGTGGAAGGAGATCCCTATCCCCTTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTCTCCGTCTACTTCTTTGACGTCATGAACCCCAGCGAGATCCTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146000 TCTCTCCGTCTACTTCTTTGACGTCATGAACCCCAGCGAGATCCTGAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGAGAAGCCGCAGGTGCGGGAGCGCGGGCCCTACGTGTACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 146050 GCGAGAAGCCGCAGGTGCGGGAGCGCGGGCCCTACGTGTACAGGTG...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    285   GGAGTTCAGGCACAAAAGCAACATCACCTTCAACAACAACGACACCGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148526 AGGGAGTTCAGGCACAAAAGCAACATCACCTTCAACAACAACGACACCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCCTTCCTCGAGTACCGCACCTTCCAGTTCCAGCCCTCCAAGTCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148576 GTCCTTCCTCGAGTACCGCACCTTCCAGTTCCAGCCCTCCAAGTCCCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCTCGGAGAGCGACTACATCGTCATGCCCAACATCCTGGTCTTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 148626 GCTCGGAGAGCGACTACATCGTCATGCCCAACATCCTGGTCTTGGTG...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    427    GGTGCGGCGGTGATGATGGAGAATAAGCCCATGACCCTGAAGCTCAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149234 CAGGGTGCGGCGGTGATGATGGAGAATAAGCCCATGACCCTGAAGCTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATGACCTTGGCATTCACCACCCTCGGCGAACGTGCCTTCATGAACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149284 CATGACCTTGGCATTCACCACCCTCGGCGAACGTGCCTTCATGAACCGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGTGGGTGAGATCATGTGGGGCTACAAGGACCCCCTTGTGAATCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149334 CTGTGGGTGAGATCATGTGGGGCTACAAGGACCCCCTTGTGAATCTCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACAAGTACTTTCCAGGCATGTTCCCCTTCAAGGACAAGTTCGGATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149384 AACAAGTACTTTCCAGGCATGTTCCCCTTCAAGGACAAGTTCGGATTATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGCTGAG         CTCAACAACTCCGACTCTGGGCTCTTCACGGTGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149434 TGCTGAGGTA...TAGCTCAACAACTCCGACTCTGGGCTCTTCACGGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCACGGGGGTCCAGAACATCAGCAGGATCCACCTCGTGGACAAGTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151711 TCACGGGGGTCCAGAACATCAGCAGGATCCACCTCGTGGACAAGTGGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGGCTGAGCAAG         GTTGACTTCTGGCATTCCGATCAGTGCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 151761 GGGCTGAGCAAGGTG...CAGGTTGACTTCTGGCATTCCGATCAGTGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATGATCAATGGAACTTCTGGGCAAATGTGGCCGCCCTTCATGACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153382 CATGATCAATGGAACTTCTGGGCAAATGTGGCCGCCCTTCATGACTCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGTCCTCGCTGGAGTTCTACAGCCCGGAGGCCTGCCG         ATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 153432 AGTCCTCGCTGGAGTTCTACAGCCCGGAGGCCTGCCGGTA...CAGATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATGAAGCTAATGTACAAGGAGTCAGGGGTGTTTGAAGGCATCCCCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155719 ATGAAGCTAATGTACAAGGAGTCAGGGGTGTTTGAAGGCATCCCCACCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCGCTTCGTGGCTCCCAAAACCCTGTTTGCCAACGGGTCCATCTACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155769 TCGCTTCGTGGCTCCCAAAACCCTGTTTGCCAACGGGTCCATCTACCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCAACGAAGGCTTCTGCCCGTGCCTGGAGTCTGGAATTCAGAACGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155819 CCAACGAAGGCTTCTGCCCGTGCCTGGAGTCTGGAATTCAGAACGTCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACCTGCAGGTTCA         GTGCCCCCTTGTTTCTCTCCCATCCTCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 155869 ACCTGCAGGTTCAGTA...TAGGTGCCCCCTTGTTTCTCTCCCATCCTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTTCCTCAACGCCGACCCGGTTCTGGCAGAAGCGGTGACTGGCCTGCACC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163428 CTTCCTCAACGCTGACCCGGTTCTGGCAGAAGCGGTGACTGGCCTGCACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTAACCAGGAGGCACACTCCTTGTTCCTGGACATCCACCCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 163478 CTAACCAGGAGGCACACTCCTTGTTCCTGGACATCCACCCGGTG...CAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GTCACGGGAATCCCCATGAACTGCTCTGTGAAACTGCAGCTGAGCCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168374 GTCACGGGAATCCCCATGAACTGCTCTGTGAAACTGCAGCTGAGCCTCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CATGAAATCTGTCGCAGGCATTGG         ACAAACTGGGAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 168424 CATGAAATCTGTCGCAGGCATTGGGTG...CAGACAAACTGGGAAGATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGCCTGTGGTCCTGCCGCTGCTCTGGTTTGCAGAG         AGCGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 176202 AGCCTGTGGTCCTGCCGCTGCTCTGGTTTGCAGAGGTA...CAGAGCGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCCATGGAGGGGGAGACTCTTCACACATTCTACACTCAGCTGGTGTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177145 GCCATGGAGGGGGAGACTCTTCACACATTCTACACTCAGCTGGTGTTGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCCCAAGGTGATGCACTATGCCCAGTACGTCCTCCTGGCGCTGGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177195 GCCCAAGGTGATGCACTATGCCCAGTACGTCCTCCTGGCGCTGGGCTGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCCTGCTGCTGGTCCCTGTCATCTGCCAAATCCGGAGCCAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 177245 TCCTGCTGCTGGTCCCTGTCATCTGCCAAATCCGGAGCCAAGTA...TAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAGAAATGCTATTTATTTTGGAGTAGTAGTAAAAAGGGCTCAAAGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180831 GAGAAATGCTATTTATTTTGGAGTAGTAGTAAAAAGGGCTCAAAGGATAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGAGGCCATTCAGGCCTATTCTGAATCCCTGATGACATCAGCTCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180881 GGAGGCCATTCAGGCCTATTCTGAATCCCTGATGACATCAGCTCCCAAGG

   1600     .    :    .    :    .
   1502 GCTCTGTGCTGCAGGAAGCAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 180931 GCTCTGTGCTGCAGGAAGCAAAACTG