seq1 = pF1KE2229.tfa, 735 bp
seq2 = pF1KE2229/gi568815591r_73734746.tfa (gi568815591r:73734746_73942140), 207395 bp

>pF1KE2229 735
>gi568815591r:73734746_73942140 (Chr7)

(complement)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-252  (100943-101071)   100% ->
253-388  (101592-101727)   99% ->
389-478  (102021-102110)   100% ->
479-735  (107139-107395)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGGAGGAGGGTGGGAGCCTGCCCGAGGTGCGGGCGCGGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGGAGGAGGGTGGGAGCCTGCCCGAGGTGCGGGCGCGGGTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCGCATGGCATCCCCGACCTGGCCCAAAAGCTCCATTTCTATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGCGCATGGCATCCCCGACCTGGCCCAAAAGCTCCATTTCTATGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGGGCTCCGGACTACGACCAG         GATGTGGCCACCCTGCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 GCTGGGCTCCGGACTACGACCAGGTA...CAGGATGTGGCCACCCTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCGTGCGCCCCGCCTCGCAGTGGACTGCCTCACACAAGCCCTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100961 TACCGTGCGCCCCGCCTCGCAGTGGACTGCCTCACACAAGCCCTTCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCGCCCCACAGTGCCCTGATCCTGGACGTGGCCTGTGGCACAGGCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101011 CCCGCCCCACAGTGCCCTGATCCTGGACGTGGCCTGTGGCACAGGCCTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGCTGCCGAG         CTGCGGGCTCCAGGCTTCCTCCAGCTGCAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101061 TGGCTGCCGAGGTG...CAGCTGCGGGCTCCAGGCTTCCTCCAGCTGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGGTGGATGGGAGCCCAGGGATGCTGGAACAGGCCCGGGCCCCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101622 GGGGTGGATGGGAGCCCAGGGATGCTGGAACAGGCCCAGGCCCCCGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTATCAGCGCCTCAGCCTCTGCACCCTGGGCCAGGAGCCTCTGCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101672 CTATCAGCGCCTCAGCCTCTGCACCCTGGGCCAGGAGCCTCTGCCCAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGGAAG         GGACCTTCGACGCGGTGCTGATAGTCGGTGCCCTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101722 CGGAAGGTA...CAGGGACCTTCGACGCGGTGCTGATAGTCGGTGCCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTGACGGCCAGGTGCCCTGCAATGCGATACCTGAGCTACATGTCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102056 AGTGACGGCCAGGTGCCCTGCAATGCGATACCTGAGCTACATGTCACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCAG         GTGGGCTGGTGTGTCTGACCACCAGGACCAACTGGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 102106 GCCAGGTG...CAGGTGGGCTGGTGTGTCTGACCACCAGGACCAACTCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAACCTTCAATACAAGGAGGCTCTGGAGGCCACCCTGGACAGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107175 CCAACCTTCAATACAAGGAGGCTCTGGAGGCCACCCTGGACAGGCTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGGCTGGGATGTGGGAAGGCCTGGTGGCCTGGCCTGTGGACCGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107225 CAGGCTGGGATGTGGGAAGGCCTGGTGGCCTGGCCTGTGGACCGCCTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GACCGCTGGGAGCTGGCTACCTCCGAGCTGGTGGTGGTATCCGGCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 107275 GACCGCTGGGAGCTGGCTACCTCCGAGCTGGAGGTGGTATCCGGCATCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCCAAGGATGGCTTCATCTCCGGCATTGTCTACCTGTACCGAAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107325 TGCCAAGGATGGCTTCATCTCCGGCATTGTCTACCTGTACCGAAAGTGGA

    750     .    :    .    :
    715 AGGCGACCCAGGTTGAGGAAG
        |||||||||||||||||||||
 107375 AGGCGACCCAGGTTGAGGAAG