seq1 = pF1KE2225.tfa, 1416 bp
seq2 = pF1KE2225/gi568815580r_2439003.tfa (gi568815580r:2439003_2667216), 228214 bp

>pF1KE2225 1416
>gi568815580r:2439003_2667216 (Chr18)

(complement)

1-396  (100001-100396)   100% ->
397-459  (103358-103420)   100% ->
460-829  (112179-112548)   100% ->
830-899  (114453-114522)   100% ->
900-1074  (119688-119862)   99% ->
1075-1181  (122458-122564)   100% ->
1182-1273  (122931-123022)   100% ->
1274-1416  (128072-128214)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTGGTACACCAGTTGTCAGCTGGGTGGTTACTGGATCATCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTGGTACACCAGTTGTCAGCTGGGTGGTTACTGGATCATCTTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTTATCAACAAGATAAACTATCAACTTCACCAGCATCATGAACCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTTATCAACAAGATAAACTATCAACTTCACCAGCATCATGAACCTTGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCGTAAAAAGGAGTTCACTACTTCTGTTCACTTTGAGTCTCTTCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCGTAAAAAGGAGTTCACTACTTCTGTTCACTTTGAGTCTCTTCAAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATTCTGTGTCCTCCTCTGGAGTCTGTGCTGCATTTATTGCTTCTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATTCTGTGTCCTCCTCTGGAGTCTGTGCTGCATTTATTGCTTCTGACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCCACTAAGCCAGAGAATGATGATGGAGGAAATTATGAAATGTTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCCACTAAGCCAGAGAATGATGATGGAGGAAATTATGAAATGTTCACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAAAATTTGTTTTTCGACCTGAACTGTTTGATGTCACCAAACCTTATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAAAATTTGTTTTTCGACCTGAACTGTTTGATGTCACCAAACCTTATATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTCCAGCTGTTCATAAAGAATGCCAGCAAAGTAATGAAAAGGAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTCCAGCTGTTCATAAAGAATGCCAGCAAAGTAATGAAAAGGAAGATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGAATGGTGTTAAAAAAGAAATCTCCATTTCTATTATTGGGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100351 GATGAATGGTGTTAAAAAAGAAATCTCCATTTCTATTATTGGGAAGGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397      AAGCGTAAAAGATGTGTTGTTTTCAATCAAGGTGAATTGGATGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ..TAGAAGCGTAAAAGATGTGTTGTTTTCAATCAAGGTGAATTGGATGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATGGAATACCATACAAAG         ATCAGGGAGCTGATTTTGGATGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103403 ATGGAATACCATACAAAGGTA...CAGATCAGGGAGCTGATTTTGGATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATCTTTACAGTTGATCCAGGAAGGTCTCAAAAGTGGTTTTCTTTATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112202 ATCTTTACAGTTGATCCAGGAAGGTCTCAAAAGTGGTTTTCTTTATCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTTTTGAAAAACAGGACAAGGGTAGTAAGCCCATTACTTTACCACTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112252 TTTTTGAAAAACAGGACAAGGGTAGTAAGCCCATTACTTTACCACTTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCTGCAGTTTGTCAGAATTATGTGAAATGGCAAAGCATTTGCCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112302 GCCTGCAGTTTGTCAGAATTATGTGAAATGGCAAAGCATTTGCCTTCTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAATGAAATGGAACATCAGACATTACAATTGGTGGAAGAGGATACATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112352 GAATGAAATGGAACATCAGACATTACAATTGGTGGAAGAGGATACATCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTACAGAACAGGATTTATTTTTGCGAGTTGTTGAAAACAACTCTAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112402 TTACAGAACAGGATTTATTTTTGCGAGTTGTTGAAAACAACTCTAGCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACAAAAGTGATTACTTTAATGGGACAGAAATACCTGCTACCACCGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112452 ACAAAAGTGATTACTTTAATGGGACAGAAATACCTGCTACCACCGAAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CAGTTTTCTTTTATCTGACATTTCTTGTATGCAACCACTTCTAAACT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 112502 CAGTTTTCTTTTATCTGACATTTCTTGTATGCAACCACTTCTAAACTGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    830       ATAGGAAAACATTTGATGTAATTGTGATAGATCCACCATGGCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112552 ...CAGATAGGAAAACATTTGATGTAATTGTGATAGATCCACCATGGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AACAAATCAGTTAAAAGAAGTAATAG         GTACAGTTATTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 114497 AACAAATCAGTTAAAAGAAGTAATAGGTA...TAGGTACAGTTATTTGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 ACCCCTGCAAATAAAGCAAATACCTATCCCTAAATTGGCTGCTCCAAACT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119703 ACCCCTGCAAATACAGCAAATACCTATCCCTAAATTGGCTGCTCCAAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GTCTTCTTGTTACTTGGGTGACCAATAGACAGAAGCACCTACGTTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119753 GTCTTCTTGTTACTTGGGTGACCAATAGACAGAAGCACCTACGTTTTATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AAGGAAGAACTTTATCCCTCTTGGTCTGTGGAGGTAGTTGCTGAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119803 AAGGAAGAACTTTATCCCTCTTGGTCTGTGGAGGTAGTTGCTGAGTGGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CTGGGTAAAA         ATAACCAATTCAGGAGAATTTGTGTTCCCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 119853 CTGGGTAAAAGTA...CAGATAACCAATTCAGGAGAATTTGTGTTCCCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TAGATTCTCCACACAAAAAGCCCTACGAAGGTCTTATACTGGGGAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122489 TAGATTCTCCACACAAAAAGCCCTACGAAGGTCTTATACTGGGGAGGGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CAAGAAAAAACTGCTCTACCATTGAG         GAATGCAGATGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122539 CAAGAAAAAACTGCTCTACCATTGAGGTA...TAGGAATGCAGATGTAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CGTGCTCCCCATTCCAGACCACAAATTAATTGTCAGCGTGCCCTGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122946 CGTGCTCCCCATTCCAGACCACAAATTAATTGTCAGCGTGCCCTGTACTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TTCACTCACATAAGCCACCGCTTGCTG         AGGTTTTAAAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 122996 TTCACTCACATAAGCCACCGCTTGCTGGTA...CAGAGGTTTTAAAAGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TACATCAAGCCAGATGGGGAATATTTGGAGTTGTTTGCTCGAAATTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128086 TACATCAAGCCAGATGGGGAATATTTGGAGTTGTTTGCTCGAAATTTACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GCCAGGTTGGACTAGTTGGGGCAATGAAGTTCTCAAATTTCAGCATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128136 GCCAGGTTGGACTAGTTGGGGCAATGAAGTTCTCAAATTTCAGCATGTGG

   1450     .    :    .    :    .
   1388 ATTATTTTATTGCTGTGGAGTCTGGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 128186 ATTATTTTATTGCTGTGGAGTCTGGAAGC