seq1 = pF1KE2222.tfa, 738 bp
seq2 = pF1KE2222/gi568815591r_2135125.tfa (gi568815591r:2135125_2339708), 204584 bp

>pF1KE2222 738
>gi568815591r:2135125_2339708 (Chr7)

(complement)

8-298  (100001-100291)   99% ->
299-738  (104145-104584)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 GGTACTTGAAGCTGGTGTGTGTTTCCTTTCAGCGTCAAGGGTTCCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GGTACTTGAAGCTGGTGTGTGTTTCCTTTCAGCGTCAAGGGTTCCACACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 GTTGGGAGTCGCTGCAAGAATCGGACAGGCGCTGAGCACCTGTGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGGGAGTCGCTGCAAGAATCGGACAGGCGCTGAGCACCTGTGGCTGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 CCGACATCTCAGGGACCCATTTGTGAAGGCTGCGAAGGTGGAGAGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGACATCTCAGGGACCCATTTGTGAAGGCTGCGAAGGTGGAGAGTTACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 GGTGTCGAAGCGCCTTCAAGCTCCTGGAGGTGAACGAGAGGCACCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGTCGAAGCGCCTTCAAGCTCCTGGAGGTGAACGAGAGGCACCAGATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    208 CTGCGGCCCGGCCTTCGGGTGTTAGACTGTGGGGCAGCTCCTGGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGCGGCCCGGCCTTCGGGTGTTAGACTGTGGGGCAGCTCCTGGGGCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    258 GAGCCAGGTGGCGGTGCAGAAGGTCAACGCCGCAGGCACAG         
        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100251 GAGTCAGGTGGCGGTGCAGAAGGTCAACGCCGCAGGCACAGGTG...TAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 ATCCCAGCTCTCCTGTTGGCTTCGTGCTTGGGGTAGATCTTCTTCACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104145 ATCCCAGCTCTCCTGTTGGCTTCGTGCTTGGGGTAGATCTTCTTCACATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349 TTCCCCCTGGAAGGAGCAACTTTTCTGTGCCCTGCTGACGTGACTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104195 TTCCCCCTGGAAGGAGCAACTTTTCTGTGCCCTGCTGACGTGACTGACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    399 GAGAACCTCACAGAGAATCCTCGAGGTGCTTCCTGGCAGGAGAGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104245 GAGAACCTCACAGAGAATCCTCGAGGTGCTTCCTGGCAGGAGAGCAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    449 TGATTCTGAGCGACATGGCGCCCAATGCCACAGGGTTCCGGGACCTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104295 TGATTCTGAGCGACATGGCGCCCAATGCCACAGGGTTCCGGGACCTCGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    499 CATGACAGGCTCATCAGCCTGTGCCTGACCCTTCTCAGCGTGACCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104345 CATGACAGGCTCATCAGCCTGTGCCTGACCCTTCTCAGCGTGACCCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    549 CATCCTGCAACCTGGGGGGACATTCCTTTGTAAAACCTGGGCTGGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104395 CATCCTGCAACCTGGGGGGACATTCCTTTGTAAAACCTGGGCTGGAAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    599 AAAGCCGTCGGTTACAGAGGAGACTGACAGAGGAATTCCAGAATGTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104445 AAAGCCGTCGGTTACAGAGGAGACTGACAGAGGAATTCCAGAATGTAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649 ATCATCAAACCTGAAGCCAGCAGGAAAGAGTCATCAGAAGTGTACTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104495 ATCATCAAACCTGAAGCCAGCAGGAAAGAGTCATCAGAAGTGTACTTCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    699 GGCCACACAGTACCACGGAAGGAAGGGCACTGTGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104545 GGCCACACAGTACCACGGAAGGAAGGGCACTGTGAAGCAG