seq1 = pF1KE2210.tfa, 2637 bp
seq2 = pF1KE2210/gi568815594f_55758324.tfa (gi568815594f:55758324_56004492), 246169 bp

>pF1KE2210 2637
>gi568815594f:55758324_56004492 (Chr4)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-255  (102088-102218)   100% ->
256-415  (105904-106063)   100% ->
416-603  (110013-110200)   100% ->
604-831  (112355-112582)   100% ->
832-964  (112778-112910)   100% ->
965-1074  (113526-113635)   100% ->
1075-1224  (119594-119743)   100% ->
1225-1330  (125500-125605)   100% ->
1331-1494  (131900-132063)   99% ->
1495-1602  (132992-133099)   100% ->
1603-1679  (134312-134388)   100% ->
1680-1908  (135229-135457)   100% ->
1909-2092  (138394-138577)   100% ->
2093-2292  (141362-141561)   100% ->
2293-2487  (144021-144215)   100% ->
2488-2637  (146020-146169)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGCAATCAAGCATGCATTACAAAGAGACATTTTTACACCAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGCAATCAAGCATGCATTACAAAGAGACATTTTTACACCAAATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAACGCCTGCTGAGCATTGTGAATGTCTGCAAAGCAGGAAAAAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAACGCCTGCTGAGCATTGTGAATGTCTGCAAAGCAGGAAAAAAGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAACTGTTTTTTATGTGCCACAG         TGACAACTGAACGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 AGAACTGTTTTTTATGTGCCACAGGTG...CAGTGACAACTGAACGCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGCAGGTTAAGGTGGTCAAAGTCAAGAAATCCGATAAGGGAGATTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102105 GTGCAGGTTAAGGTGGTCAAAGTCAAGAAATCCGATAAGGGAGATTTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAAAGGCAGATTGCATGGGCCCTTCGAGATCTTGCTGTGGTAGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102155 CAAAAGGCAGATTGCATGGGCCCTTCGAGATCTTGCTGTGGTAGATGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGATGCTATCAAA         GAAAATCCTGAATTTGATTTACACTTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102205 AAGATGCTATCAAAGTA...TAGGAAAATCCTGAATTTGATTTACACTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAAAAATATATAAATGGGTTGCCAGCAGCACTGCTGAAAAGAATGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105931 GAAAAAATATATAAATGGGTTGCCAGCAGCACTGCTGAAAAGAATGCATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TATTTCATGCATTTGGAAATTGAATCAGCGATATCTCCGGAAGAAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105981 TATTTCATGCATTTGGAAATTGAATCAGCGATATCTCCGGAAGAAAATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTTTGTCAATGTTAGCTCACAGCTTTTGGAAG         AATCTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106031 ATTTTGTCAATGTTAGCTCACAGCTTTTGGAAGGTA...AAGAATCTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAAGTGGAGAAAATCAGAGTGTGACAGGAGGTGATGAAGAAGTAGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110021 CCAAGTGGAGAAAATCAGAGTGTGACAGGAGGTGATGAAGAAGTAGTAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAATACCAAGAGTTAAATGCAAGAGAAGAACAGGATATCGAAATAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110071 TGAATACCAAGAGTTAAATGCAAGAGAAGAACAGGATATCGAAATAATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGAAGGCTGTGAATATGCAATCTCGAATGCGGAAGCCTTTGCAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110121 TGGAAGGCTGTGAATATGCAATCTCGAATGCGGAAGCCTTTGCAGAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTGTCCAGAGAGCTGCAGGTGCTAGATGGG         GCTAACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110171 TTGTCCAGAGAGCTGCAGGTGCTAGATGGGGTA...TAGGCTAACATCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTCAATCATGGCATCTGAAAAACAAGTCAACATCCTGATGAAATTGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112366 GTCAATCATGGCATCTGAAAAACAAGTCAACATCCTGATGAAATTGCTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGAGGCTCTAAAGGAGGTAGATCAGATTGAATTGAAACTGAGCAGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112416 ATGAGGCTCTAAAGGAGGTAGATCAGATTGAATTGAAACTGAGCAGTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGGAAATGCTCCAAAGTGTAAAAGAACAAATGGATCAGATCTCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112466 GAGGAAATGCTCCAAAGTGTAAAAGAACAAATGGATCAGATCTCTGAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAACCACCTAATTCATCTTAGTAACACTAATAATGTAAAACTCCTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112516 CAACCACCTAATTCATCTTAGTAACACTAATAATGTAAAACTCCTATCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGATAGAGTTCCTTGTG         AACCACATGGACTTGGCCAAAGGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 112566 AGATAGAGTTCCTTGTGGTA...TAGAACCACATGGACTTGGCCAAAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CATATAAAGGCCCTTCAGGAAGGAGATCTTGCTTCTTCCAGAGGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112802 CATATAAAGGCCCTTCAGGAAGGAGATCTTGCTTCTTCCAGAGGCATTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCCTGCACCAATGCTGCTGATGCCCTTCTGCAGTGCATGAATGTAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112852 GGCCTGCACCAATGCTGCTGATGCCCTTCTGCAGTGCATGAATGTAGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTCGACCAG         GCCATGACTTGCTTCTGGCAGTCAAACAGCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112902 TTCGACCAGGTA...CAGGCCATGACTTGCTTCTGGCAGTCAAACAGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGCAGCGATTCAGTGATTTGCGAGAGCTTTTTGCCCGGAGACTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113558 CAGCAGCGATTCAGTGATTTGCGAGAGCTTTTTGCCCGGAGACTGGCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCACCTCAACAATGTTTTTGTTCAACAG         GGTCATGATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 113608 TCACCTCAACAATGTTTTTGTTCAACAGGTA...TAGGGTCATGATCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTTCGACTCTTGCCCAACACTCTGTTGAACTGACTTTACCCAATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119607 GTTCGACTCTTGCCCAACACTCTGTTGAACTGACTTTACCCAATCATCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCATTTCATAGAGATTTGCTCCGATATGCCAAGCTGATGGAGTGGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119657 CCATTTCATAGAGATTTGCTCCGATATGCCAAGCTGATGGAGTGGCTAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAGTACAGATTATGGAAAATATGAAGGACTAACAAAG         AATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 119707 GAGTACAGATTATGGAAAATATGAAGGACTAACAAAGGTA...AAGAATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACATGGATTATTTATCCCGACTATATGAAAGAGAAATCAAAGATTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125504 ACATGGATTATTTATCCCGACTATATGAAAGAGAAATCAAAGATTTCTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAAGTTGCAAAGATCAAGATGACTGGCACAACTAAAGAAAGCAAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125554 GAAGTTGCAAAGATCAAGATGACTGGCACAACTAAAGAAAGCAAGAAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TG         GTCTTCATGGAAGTTCGGGGAAATTAACTGGATCTACTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125604 TGGTA...TAGGTCTTCATGGAAGTTCGGGGAAATTAACTGGATCTACTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTAGTCTAAATAAGCTCAGTGTTCAGAGTTCAGGGAATCGCAGATCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131939 CTAGTCTAAATAAGCTCAGTGTTCAGAGTTCAGGGAATCGCAGATCTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TCATCTTCCCTGTTGGATATGGGAAACATGTCTGCCTCTGATCTCGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131989 TCATCTTCCCTGTTGGATATGGGAAACATGTCTGCCTCTGATCTCGATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGCCGACAGGACCAAATTTGATAAG         ATCTTTGAACAGGTAC
        ||| |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 132039 TGCTGACAGGACCAAATTTGATAAGGTA...CAGATCTTTGAACAGGTAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TAAGTGAACTGGAGCCCCTATGTCTGGCAGAACAGGACTTCATAAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133008 TAAGTGAACTGGAGCCCCTATGTCTGGCAGAACAGGACTTCATAAGTAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TTTTTCAAACTACAGCAACATCAAAGTATGCCTGGAACTATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 133058 TTTTTCAAACTACAGCAACATCAAAGTATGCCTGGAACTATGGTA...CA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1603  GCTGAAGCAGAGGACCTGGATGGAGGAACATTATCACGGCAACATAATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134311 GGCTGAAGCAGAGGACCTGGATGGAGGAACATTATCACGGCAACATAATT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GTGGCACACCACTGCCTGTTTCATCTGA         GAAAGATATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 134361 GTGGCACACCACTGCCTGTTTCATCTGAGTA...CAGGAAAGATATGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CGCCAAATGATGATTAAAATATTTCGCTGCATTGAGCCAGAGCTGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135242 CGCCAAATGATGATTAAAATATTTCGCTGCATTGAGCCAGAGCTGAACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CCTAATTGCATTAGGAGACAAAATTGATAGCTTTAACTCTCTTTATATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135292 CCTAATTGCATTAGGAGACAAAATTGATAGCTTTAACTCTCTTTATATGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TAGTCAAAATGAGTCATCATGTGTGGACTGCACAAAATGTGGACCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135342 TAGTCAAAATGAGTCATCATGTGTGGACTGCACAAAATGTGGACCCTGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TCTTTCCTAAGTACTACATTGGGAAATGTTTTGGTGACTGTCAAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135392 TCTTTCCTAAGTACTACATTGGGAAATGTTTTGGTGACTGTCAAAAGGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CTTTGACAAATGCATT         AGTAACCAAATAAGGCAAATGGAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 135442 CTTTGACAAATGCATTGTA...TAGAGTAACCAAATAAGGCAAATGGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AAGTAAAGATCTCAAAAAAGAGTAAAGTTGGAATTCTTCCATTTGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138419 AAGTAAAGATCTCAAAAAAGAGTAAAGTTGGAATTCTTCCATTTGTTGCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GAATTTGAAGAATTTGCTGGACTTGCAGAATCAATCTTCAAAAATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138469 GAATTTGAAGAATTTGCTGGACTTGCAGAATCAATCTTCAAAAATGCTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GCGTCGTGGAGACCTGGATAAAGCATACACCAAACTTATCAGAGGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138519 GCGTCGTGGAGACCTGGATAAAGCATACACCAAACTTATCAGAGGAGTAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TTGTTAATG         TGGAGAAAGTAGCAAATGAAAGCCAGAAGACC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 138569 TTGTTAATGGTA...TAGTGGAGAAAGTAGCAAATGAAAGCCAGAAGACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CCCAGGGATGTGGTTATGATGGAAAACTTTCACCATATTTTTGCAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141394 CCCAGGGATGTGGTTATGATGGAAAACTTTCACCATATTTTTGCAACTCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TTCTCGATTGAAAATCTCATGTCTAGAAGCAGAAAAAAAAGAAGCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141444 TTCTCGATTGAAAATCTCATGTCTAGAAGCAGAAAAAAAAGAAGCCAAAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 AAAAATACACAGATCACCTTCAGTCTTATGTCATTTACTCTTTAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141494 AAAAATACACAGATCACCTTCAGTCTTATGTCATTTACTCTTTAGGACAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CCTCTTGAAAAACTAAAT         CATTTCTTTGAAGGTGTTGAAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 141544 CCTCTTGAAAAACTAAATGTA...AAGCATTTCTTTGAAGGTGTTGAAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TCGCGTGGCACAGGGCATAAGGGAGGAGGAAGTAAGTTACCAACTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144044 TCGCGTGGCACAGGGCATAAGGGAGGAGGAAGTAAGTTACCAACTTGCAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TTAACAAACAAGAACTTCGTAAAGTCATTAAGGAGTACCCTGGAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144094 TTAACAAACAAGAACTTCGTAAAGTCATTAAGGAGTACCCTGGAAAGGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 GTAAAAAAAGGTCTAGATAACCTCTACAAGAAAGTTGATAAACATTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144144 GTAAAAAAAGGTCTAGATAACCTCTACAAGAAAGTTGATAAACATTTATG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 TGAAGAAGAGAACTTACTTCAG         GTGGTGTGGCACTCCATGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 144194 TGAAGAAGAGAACTTACTTCAGGTA...TAGGTGGTGTGGCACTCCATGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 AAGATGAATTTATACGCCAGTATAAGCACTTTGAAGGTTTGATAGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146039 AAGATGAATTTATACGCCAGTATAAGCACTTTGAAGGTTTGATAGCTCGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 TGTTATCCTGGATCTGGTGTTACAATGGAATTCACTATTCAGGACATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146089 TGTTATCCTGGATCTGGTGTTACAATGGAATTCACTATTCAGGACATTCT

   2750     .    :    .    :    .    :
   2607 GGATTATTGTTCCAGCATTGCACAGTCCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 146139 GGATTATTGTTCCAGCATTGCACAGTCCCAC