seq1 = pF1KE2199.tfa, 279 bp
seq2 = pF1KE2199/gi568815581r_36095289.tfa (gi568815581r:36095289_36296673), 201385 bp

>pF1KE2199 279
>gi568815581r:36095289_36296673 (Chr17)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-191  (100762-100876)   100% ->
192-279  (101298-101385)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGTCTCCACTGCTGCCCTTGCCGTCCTCCTCTGCACCATGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGTCTCCACTGCTGCCCTTGCCGTCCTCCTCTGCACCATGGCTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCAACCAGGTCCTCTCTGCACCAC         TTGCTGCTGACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CTGCAACCAGGTCCTCTCTGCACCACGTG...CAGTTGCTGCTGACACGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGACCGCCTGCTGCTTCAGCTACACCTCCCGACAGATTCCACAGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100777 CGACCGCCTGCTGCTTCAGCTACACCTCCCGACAGATTCCACAGAATTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATAGCTGACTACTTTGAGACGAGCAGCCAGTGCTCCAAGCCCAGTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100827 ATAGCTGACTACTTTGAGACGAGCAGCCAGTGCTCCAAGCCCAGTGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          CTTCCTAACCAAGAGAGGCCGGCAGGTCTGTGCTGACCCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100877 GTA...CAGCTTCCTAACCAAGAGAGGCCGGCAGGTCTGTGCTGACCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    233 GTGAGGAGTGGGTCCAGAAATACGTCAGCGACCTGGAGCTGAGTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101339 GTGAGGAGTGGGTCCAGAAATACGTCAGTGACCTGGAGCTGAGTGCC