seq1 = pF1KE2194.tfa, 765 bp
seq2 = pF1KE2194/gi568815581r_1245450.tfa (gi568815581r:1245450_1500110), 254661 bp

>pF1KE2194 765
>gi568815581r:1245450_1500110 (Chr17)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-264  (135053-135252)   100% ->
265-371  (138103-138209)   100% ->
372-578  (138813-139019)   100% ->
579-715  (145764-145900)   100% ->
716-765  (154612-154661)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGATCGAGAGGATCTGGTGTACCAGGCGAAGCTGGCCGAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGATCGAGAGGATCTGGTGTACCAGGCGAAGCTGGCCGAGCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGCGATACGACG         AAATGGTGGAGTCAATGAAGAAAGTAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGCGATACGACGGTG...CAGAAATGGTGGAGTCAATGAAGAAAGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGGGATGGATGTGGAGCTGACAGTTGAAGAAAGAAACCTCCTATCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135080 CAGGGATGGATGTGGAGCTGACAGTTGAAGAAAGAAACCTCCTATCTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCATATAAGAATGTGATTGGAGCTAGAAGAGCCTCCTGGAGAATAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135130 GCATATAAGAATGTGATTGGAGCTAGAAGAGCCTCCTGGAGAATAATCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCATTGAACAGAAAGAAGAAAACAAGGGAGGAGAAGACAAGCTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135180 CAGCATTGAACAGAAAGAAGAAAACAAGGGAGGAGAAGACAAGCTAAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGATTCGGGAATATCGGCAAATG         GTTGAGACTGAGCTAAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 135230 TGATTCGGGAATATCGGCAAATGGTG...TAGGTTGAGACTGAGCTAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAATCTGTTGTGACATTCTGGATGTACTGGACAAACACCTCATTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138121 TTAATCTGTTGTGACATTCTGGATGTACTGGACAAACACCTCATTCCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCTAACACTGGCGAGTCCAAGGTTTTCTATTATAAAAT         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 138171 AGCTAACACTGGCGAGTCCAAGGTTTTCTATTATAAAATGTA...TAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGGGGACTACCACAGGTATCTGGCAGAATTTGCCACAGGAAACGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138815 AAGGGGACTACCACAGGTATCTGGCAGAATTTGCCACAGGAAACGACAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGAGGCTGCGGAGAACAGCCTAGTGGCTTATAAAGCTGCTAGTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138865 AAGGAGGCTGCGGAGAACAGCCTAGTGGCTTATAAAGCTGCTAGTGATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCAATGACAGAACTTCCACCAACGCATCCTATTCGCTTAGGTCTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138915 TGCAATGACAGAACTTCCACCAACGCATCCTATTCGCTTAGGTCTTGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCAATTTTTCCGTATTCTACTACGAAATTCTTAATTCCCCTGACCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138965 TCAATTTTTCCGTATTCTACTACGAAATTCTTAATTCCCCTGACCGTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGCAG         GTTGGCAAAAGCAGCTTTTGATGATGCAATTGCAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139015 TGCAGGTA...TAGGTTGGCAAAAGCAGCTTTTGATGATGCAATTGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTGGATACGCTGAGTGAAGAAAGCTATAAGGACTCTACACTTATCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145800 ACTGGATACGCTGAGTGAAGAAAGCTATAAGGACTCTACACTTATCATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGTTGTTACGTGATAATCTGACACTATGGACTTCAGACATGCAGGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145850 AGTTGTTACGTGATAATCTGACACTATGGACTTCAGACATGCAGGGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 G         GTGAAGAGCAGAATAAAGAAGCGCTGCAGGACGTGGAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145900 GGTA...CAGGTGAAGAGCAGAATAAAGAAGCGCTGCAGGACGTGGAAGA

    800     .    :
    756 CGAAAATCAG
        ||||||||||
 154652 CGAAAATCAG