seq1 = pF1KE2191.tfa, 1101 bp
seq2 = pF1KE2191/gi568815591f_92428814.tfa (gi568815591f:92428814_92636934), 208121 bp

>pF1KE2191 1101
>gi568815591f:92428814_92636934 (Chr7)

1-111  (100001-100111)   100% ->
112-302  (100663-100853)   100% ->
303-448  (103591-103736)   100% ->
449-1017  (105589-106157)   100% ->
1018-1101  (108038-108121)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCGAGCGGCGGGGAGCTAGGGAGTTTATTTGATCACCACGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCGAGCGGCGGGGAGCTAGGGAGTTTATTTGATCACCACGTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGGCGGTATGCGACACACGGGCCAAATATCGAGAGGGACGACGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGGCGGTATGCGACACACGGGCCAAATATCGAGAGGGACGACGGCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCTGTGAAG         GTATATACAATCAATTTGGAATCTCAGTAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCTGTGAAGGTA...CAGGTATATACAATCAATTTGGAATCTCAGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTATTAATACAAGGAGTTCCTGCTGTGGGAGTCATGAAGGAATTAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100693 TTATTAATACAAGGAGTTCCTGCTGTGGGAGTCATGAAGGAATTAGTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGATTCGCTTTATATGGTGCAATTGAACAGTACAATGCTCTAGATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 GCGATTCGCTTTATATGGTGCAATTGAACAGTACAATGCTCTAGATGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCCAGCAGAAGACTTTACTGAAGTTTATCTTATTAAATTTATGAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100793 ACCCAGCAGAAGACTTTACTGAAGTTTATCTTATTAAATTTATGAACTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAAAGTGCAAG         GACAGCCAAGAGAAAAATGGATGAACAGAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100843 CAAAGTGCAAGGTA...CAGGACAGCCAAGAGAAAAATGGATGAACAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTCTTCGGTGGATTGCTTCATGTGTGCTATGCTCCAGAATTTGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103621 TTTCTTCGGTGGATTGCTTCATGTGTGCTATGCTCCAGAATTTGAAACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGAAGAAACTAGAAAAAAACTACAAATGCGGAAGGCATATGTAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103671 TTGAAGAAACTAGAAAAAAACTACAAATGCGGAAGGCATATGTAGTAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTACTGAAAATAAAG         ACCATTACGTGACAAAGAAGAAATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103721 ACTACTGAAAATAAAGGTA...AAGACCATTACGTGACAAAGAAGAAATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTTACAGAGCATAAAGACACAGAGGATTTTAGACAAGACTTCCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105614 GGTTACAGAGCATAAAGACACAGAGGATTTTAGACAAGACTTCCACTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGATGTCTGGATTTTGTAAAGCTGCTTTGAACACTTCTGCAGGGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105664 AGATGTCTGGATTTTGTAAAGCTGCTTTGAACACTTCTGCAGGGAACTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATCCTTATCTTCCGTATTCCTGTGAATTGCCTTTATGTTATTTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105714 AATCCTTATCTTCCGTATTCCTGTGAATTGCCTTTATGTTATTTCTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAAATGTATGTGTTCATCCGGGGGACCTGTAGACAGAGCACCAGACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105764 AAAATGTATGTGTTCATCCGGGGGACCTGTAGACAGAGCACCAGACTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTAAGGATGGTAGAAACCATCATAAAACAATGGGGCATTATAACCACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105814 CTAAGGATGGTAGAAACCATCATAAAACAATGGGGCATTATAACCACAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACTCTTTGCGGAAAACACAGATAAACTCTTTGAAAAACTCAGTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105864 GACTCTTTGCGGAAAACACAGATAAACTCTTTGAAAAACTCAGTGGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCTGGTGCACAAAAGGCTATTACGTCTTCAGAGGCAGTTGACAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105914 CCCTGGTGCACAAAAGGCTATTACGTCTTCAGAGGCAGTTGACAGATTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCCTAGGACAACACAACTGCAGGAGCGCAAAAGAAGAAGAGAAGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105964 TGCCTAGGACAACACAACTGCAGGAGCGCAAAAGAAGAAGAGAAGATGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CGTAAACTTGGAACTTTTCTTCAAACAAACCCAACTGGTAATGAGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106014 CGTAAACTTGGAACTTTTCTTCAAACAAACCCAACTGGTAATGAGATTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GATTGGACCTCTGTTACCAGACATCTCTAAAGTGGATATGCACGATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106064 GATTGGACCTCTGTTACCAGACATCTCTAAAGTGGATATGCACGATGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CATTGAATACAACGGCGAATTTAATTCGGCATAAACTTAAAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106114 CATTGAATACAACGGCGAATTTAATTCGGCATAAACTTAAAGAGGTA...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1018    GTAATTTCATCTGTGCCAAAGCCTCCAGAGGACAAGCCAGAAGATGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108035 TAGGTAATTTCATCTGTGCCAAAGCCTCCAGAGGACAAGCCAGAAGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .
   1065 ACATACAAGTCATCCATTAAAACAAAGAAGAAGAATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108085 ACATACAAGTCATCCATTAAAACAAAGAAGAAGAATA