seq1 = pF1KE2186.tfa, 1755 bp
seq2 = pF1KE2186/gi568815596r_207666985.tfa (gi568815596r:207666985_207868739), 201755 bp

>pF1KE2186 1755
>gi568815596r:207666985_207868739 (Chr2)

(complement)

1-1755  (100001-101755)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGCCTGACCCATCCGCGCCGCCCTCGCTGTTGCTGCTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGGCCTGACCCATCCGCGCCGCCCTCGCTGTTGCTGCTGCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCAGCTGGTGGGCCGGGCGGCCGCCGCGTCCAAGGCCCCGGTGTGCC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCGCAGCTGGTGGGCCGGGCGGCCGCCGCGTCCAAGGCCCCGGTGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAAATCACGGTGCCCATGTGCCGCGGCATCGGCTACAACCTGACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAAATCACGGTGCCCATGTGCCGCGGCATCGGCTACAACCTGACGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGCCCAACCAGTTCAACCACGACACGCAGGACGAGGCGGGCCTGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGCCCAACCAGTTCAACCACGACACGCAGGACGAGGCGGGCCTGGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACCAGTTCTGGCCGCTGGTGGAGATCCAATGCTCGCCGGACCTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCACCAGTTCTGGCCGCTGGTGGAGATCCAATGCTCGCCGGACCTGCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTCCTATGCTCTATGTACACGCCCATCTGTCTGCCCGACTACCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTTCCTATGCTCTATGTACACGCCCATCTGTCTGCCCGACTACCACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCTGCCGCCCTGCCGCTCGGTGTGCGAGCGCGCCAAGGCCGGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGCTGCCGCCCTGCCGCTCGGTGTGCGAGCGCGCCAAGGCCGGCTGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGCTGATGCGCCAGTACGGCTTCGCCTGGCCCGAGCGCATGAGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGCTGATGCGCCAGTACGGCTTCGCCTGGCCCGAGCGCATGAGCTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCGCCTCCCGGTGCTGGGCCGCGACGCCGAGGTCCTCTGCATGGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCGCCTCCCGGTGCTGGGCCGCGACGCCGAGGTCCTCTGCATGGATTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACCGCAGCGAGGCCACCACGGCGCCCCCCAGGCCTTTCCCAGCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACCGCAGCGAGGCCACCACGGCGCCCCCCAGGCCTTTCCCAGCCAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACCCTTCCAGGCCCGCCAGGGGCGCCGGCCTCGGGGGGCGAATGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACCCTTCCAGGCCCGCCAGGGGCGCCGGCCTCGGGGGGCGAATGCCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGGGGGCCCGTTCGTGTGCAAGTGTCGCGAGCCCTTCGTGCCCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGGGGGCCCGTTCGTGTGCAAGTGTCGCGAGCCCTTCGTGCCCATTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGGAGTCACACCCGCTCTACAACAAGGTGCGGACGGGCCAGGTGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGGAGTCACACCCGCTCTACAACAAGGTGCGGACGGGCCAGGTGCCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGCGCGGTACCCTGCTACCAGCCGTCCTTCAGTGCCGACGAGCGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGCGCGGTACCCTGCTACCAGCCGTCCTTCAGTGCCGACGAGCGCACGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCGCCACCTTCTGGATAGGCCTGTGGTCGGTGCTGTGCTTCATCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCGCCACCTTCTGGATAGGCCTGTGGTCGGTGCTGTGCTTCATCTCCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCACCACAGTGGCCACCTTCCTCATCGACATGGAACGCTTCCGCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCACCACAGTGGCCACCTTCCTCATCGACATGGAACGCTTCCGCTATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAGCGCCCCATCATCTTCCTGTCAGCCTGCTACCTGTGCGTGTCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAGCGCCCCATCATCTTCCTGTCAGCCTGCTACCTGTGCGTGTCGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTTCCTGGTGCGTCTGGTCGTGGGCCATGCCAGCGTGGCCTGCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTTCCTGGTGCGTCTGGTCGTGGGCCATGCCAGCGTGGCCTGCAGCCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGCACAACCACATCCACTACGAGACCACGGGCCCTGCACTGTGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGCACAACCACATCCACTACGAGACCACGGGCCCTGCACTGTGCACCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGTCTTCCTCCTGGTCTACTTCTTCGGCATGGCCAGCTCCATCTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGTCTTCCTCCTGGTCTACTTCTTCGGCATGGCCAGCTCCATCTGGTGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCATCCTGTCGCTCACCTGGTTCCTGGCCGCCGGCATGAAGTGGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCATCCTGTCGCTCACCTGGTTCCTGGCCGCCGGCATGAAGTGGGGCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGGCCATCGCGGGCTACGCGCAGTACTTCCACCTGGCTGCGTGGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGGCCATCGCGGGCTACGCGCAGTACTTCCACCTGGCTGCGTGGCTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCCCAGCGTCAAGTCCATCACGGCACTGGCGCTGAGCTCCGTGGACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCCCAGCGTCAAGTCCATCACGGCACTGGCGCTGAGCTCCGTGGACGGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACCCAGTGGCCGGCATCTGCTACGTGGGCAACCAGAACCTGAACTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACCCAGTGGCCGGCATCTGCTACGTGGGCAACCAGAACCTGAACTCGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CGCGGCTTCGTGCTGGGCCCGCTGGTGCTCTACCTGCTGGTGGGCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CGCGGCTTCGTGCTGGGCCCGCTGGTGCTCTACCTGCTGGTGGGCACGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTTCCTGCTGGCGGGCTTCGTGTCGCTCTTCCGCATCCGCAGCGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTTCCTGCTGGCGGGCTTCGTGTCGCTCTTCCGCATCCGCAGCGTCATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCAGGGCGGCACCAAGACGGACAAGCTGGAGAAGCTCATGATCCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCAGGGCGGCACCAAGACGGACAAGCTGGAGAAGCTCATGATCCGCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGCATCTTCACGCTGCTCTACACGGTCCCCGCCAGCATTGTGGTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGCATCTTCACGCTGCTCTACACGGTCCCCGCCAGCATTGTGGTGGCCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTACCTGTACGAGCAGCACTACCGCGAGAGCTGGGAGGCGGCGCTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTACCTGTACGAGCAGCACTACCGCGAGAGCTGGGAGGCGGCGCTCACCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCGCCTGCCCGGGCCACGACACCGGCCAGCCGCGCGCCAAGCCCGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GCGCCTGCCCGGGCCACGACACCGGCCAGCCGCGCGCCAAGCCCGAGTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TGGGTGCTCATGCTCAAGTACTTCATGTGCCTGGTGGTGGGCATCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TGGGTGCTCATGCTCAAGTACTTCATGTGCCTGGTGGTGGGCATCACGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGGCGTCTGGATCTGGTCGGGCAAGACGGTGGAGTCGTGGCGGCGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGGCGTCTGGATCTGGTCGGGCAAGACGGTGGAGTCGTGGCGGCGTTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCAGCCGCTGCTGCTGCCGCCCGCGGCGCGGCCACAAGAGCGGGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCAGCCGCTGCTGCTGCCGCCCGCGGCGCGGCCACAAGAGCGGGGGCGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ATGGCCGCAGGGGACTACCCCGAGGCGAGCGCCGCGCTCACAGGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 ATGGCCGCAGGGGACTACCCCGAGGCGAGCGCCGCGCTCACAGGCAGGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CGGGCCGCCGGGCCCCGCCGCCACCTACCACAAGCAGGTGTCCCTGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CGGGCCGCCGGGCCCCGCCGCCACCTACCACAAGCAGGTGTCCCTGTCGC

   1750     .
   1751 ACGTG
        |||||
 101751 ACGTG