seq1 = pF1KE2183.tfa, 1791 bp
seq2 = pF1KE2183/gi568815595r_138395018.tfa (gi568815595r:138395018_138672927), 277910 bp

>pF1KE2183 1791
>gi568815595r:138395018_138672927 (Chr3)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-160  (101572-101662)   100% ->
161-284  (101771-101894)   100% ->
285-465  (102430-102610)   100% ->
466-635  (135581-135750)   100% ->
636-692  (140358-140414)   100% ->
693-780  (143466-143553)   100% ->
781-869  (143641-143729)   100% ->
870-944  (147364-147438)   98% ->
945-1050  (164384-164489)   100% ->
1051-1221  (167463-167633)   100% ->
1222-1368  (172047-172193)   100% ->
1369-1537  (172361-172529)   100% ->
1538-1652  (172704-172818)   100% ->
1653-1732  (174818-174897)   100% ->
1733-1791  (177852-177910)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCCGGTAGCCCCTAAACCCCAGGATTCCAGTCAACCATCAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTCCGGTAGCCCCTAAACCCCAGGATTCCAGTCAACCATCAGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCATGACTGAAAAACAG         CAGGAAGAAGCAGAATGGGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 ACTCATGACTGAAAAACAGGTA...TAGCAGGAAGAAGCAGAATGGGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCATAAATGTGCTATTGATGATGCATGGCTTAAAACCTTTGTCTCTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101594 GCATAAATGTGCTATTGATGATGCATGGCTTAAAACCTTTGTCTCTAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAGAACAGATCTCAAAG         ATCTCATCATTTTTGACAAACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101644 AAAAGAACAGATCTCAAAGGTA...TAGATCTCATCATTTTTGACAAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTCATCACAAAGGATGAGACAGAATTTGAAATTGTTGGTGGAAGAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101793 GTCATCACAAAGGATGAGACAGAATTTGAAATTGTTGGTGGAAGAAACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATGTCAACAGAACATGATACAGGAGCTTATAGAAACTAATCAACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101843 CATGTCAACAGAACATGATACAGGAGCTTATAGAAACTAATCAACAGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AG         AAATGAACTTCAGCTAGAGCAAAGCCGAGCAGCCAATCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101893 AGGTG...TAGAAATGAACTTCAGCTAGAGCAAAGCCGAGCAGCCAATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAACAACGAGCTAATGACTTGGAACAAATTATGGAAAGTGTGAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102469 AGAACAACGAGCTAATGACTTGGAACAAATTATGGAAAGTGTGAAATCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAATTGGTGAATTGGAGGATGAATCACTAAGTAGGGCTTGCCACCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102519 AAATTGGTGAATTGGAGGATGAATCACTAAGTAGGGCTTGCCACCAACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATAAAATAAAAGATCTTCAAAAGGAGCAGAAAACTTTACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 102569 AATAAAATAAAAGATCTTCAAAAGGAGCAGAAAACTTTACAGGTA...TA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466  GTGAAGTGCCAGCATTATAAGAAAAAACGAACGGAGCAAGAAGAAACTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135580 GGTGAAGTGCCAGCATTATAAGAAAAAACGAACGGAGCAAGAAGAAACTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGCTTCTTTGCAAATGGAAGTCTGTAGATTAAAAAAGGAGGAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135630 TTGCTTCTTTGCAAATGGAAGTCTGTAGATTAAAAAAGGAGGAAGAAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGCATTGTCACTCAAAACAGAGTGTTTGCCTATCTGTGCAAAAGAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135680 CGCATTGTCACTCAAAACAGAGTGTTTGCCTATCTGTGCAAAAGAGTTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCATACCGTCTTGGATAGACA         GTTGCTTTGTCTAATTGATT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 135730 TCATACCGTCTTGGATAGACAGTA...TAGGTTGCTTTGTCTAATTGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACTATGAATCTAAAATTAGAAAAATTCATACACAAAG         GCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 140378 ACTATGAATCTAAAATTAGAAAAATTCATACACAAAGGTA...TAGGCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATAAAGAAGATGAAAGTCAGTCAGAAGAAGAAAACGACTACAGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143470 TATAAAGAAGATGAAAGTCAGTCAGAAGAAGAAAACGACTACAGAAATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGATGCCTCACCAACTTATAAAGGCCTTTTAATG         TCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 143520 GGATGCCTCACCAACTTATAAAGGCCTTTTAATGGTA...CAGTCATTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGAATCAACTCAAGGAATCAAAATCTAAGATTGATGCACTTTCAAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143648 AGAATCAACTCAAGGAATCAAAATCTAAGATTGATGCACTTTCAAGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAGCTGAACCTCCAAAAAGATTTGGAAACCAG         GCCTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| ||
 143698 AAGCTGAACCTCCAAAAAGATTTGGAAACCAGGTG...CAGGCCTACGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GCATGAATTAAGACTTTATAAACAGCAGGTGAAGAAGCTGGAAAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147373 GCATGAATTAAGACTTTATAAACAGCAGGTGAAGAAGCTGGAAAAAGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTAAGAAAAACGTCAA         ATTACAGGAGCTTATTAATCATAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 147423 TTAAGAAAAACGTCAAGTA...TAGATTACAGGAGCTTATTAATCATAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGGCTGAGGACACAGAGAAGAAAGATGAGCCCAGCAAATATAATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164409 AAGGCTGAGGACACAGAGAAGAAAGATGAGCCCAGCAAATATAATCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ACAGGCCCTAATTGACCAGAGATACTTTCAG         GTGCTGTGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 164459 ACAGGCCCTAATTGACCAGAGATACTTTCAGGTA...AAGGTGCTGTGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GCATCAATTCAATTATCCACAATCCAAGAGCTCCAGTAATAATTTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167473 GCATCAATTCAATTATCCACAATCCAAGAGCTCCAGTAATAATTTATAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CAGACCAAAGGGGGAGTCCAAAATTTTAATAAAGATCTTGTTCAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167523 CAGACCAAAGGGGGAGTCCAAAATTTTAATAAAGATCTTGTTCAAGATTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGGATTTGAGCATCTTGTTCCTGTAATAGAAATGTGGGCAGATCAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167573 TGGATTTGAGCATCTTGTTCCTGTAATAGAAATGTGGGCAGATCAACTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CATCCTTAAAG         GATTTGTATAAGTCCTTGAAAACACTATCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 167623 CATCCTTAAAGGTA...AAGGATTTGTATAAGTCCTTGAAAACACTATCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GCAGAACTGGTACCTTGGCTTAATTTGAAGAAGCAGGATGAAAATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172077 GCAGAACTGGTACCTTGGCTTAATTTGAAGAAGCAGGATGAAAATGAAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TATCAAAGTTGAAGATTTGTTGTTTATAGTAGATACTATGCTGGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172127 TATCAAAGTTGAAGATTTGTTGTTTATAGTAGATACTATGCTGGAAGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTGAAAATAAGGAAAAG         GACAGCAATATGCCACACTTTCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 172177 TTGAAAATAAGGAAAAGGTA...CAGGACAGCAATATGCCACACTTTCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ACTTTGCAAGCTATTGTTTCTCACTTCCAAAAGTTATTTGATGTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172385 ACTTTGCAAGCTATTGTTTCTCACTTCCAAAAGTTATTTGATGTGCCTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TTTAAATGGAGTCTATCCCCGAATGAATGAAGTTTATACTAGGCTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172435 TTTAAATGGAGTCTATCCCCGAATGAATGAAGTTTATACTAGGCTTGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAATGAACAATGCTGTGAGAAACCTCCAAGAACTCTTAGAATTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 172485 AAATGAACAATGCTGTGAGAAACCTCCAAGAACTCTTAGAATTAGGTG..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538     ATAGTTCATCCTCATTGTGTGTGCTAGTAAGCACTGTTGGAAAACT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172535 .CAGATAGTTCATCCTCATTGTGTGTGCTAGTAAGCACTGTTGGAAAACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CTGTAGGCTGATTAATGAAGATGTGAATGAGCAGGTTATGCAGGTATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172750 CTGTAGGCTGATTAATGAAGATGTGAATGAGCAGGTTATGCAGGTATTAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 GACCTGAAGACCTCCAGAG         CATTATCTACAAATTGGAAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 172800 GACCTGAAGACCTCCAGAGGTA...CAGCATTATCTACAAATTGGAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CACGAGGAATTTTTCCCAGCATTTCAGGCATTTACTAATGATCTACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174840 CACGAGGAATTTTTCCCAGCATTTCAGGCATTTACTAATGATCTACTTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 AATCTTAG         AAATTGATGACTTGGATGCCATTGTACCTGCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 174890 AATCTTAGGTA...CAGAAATTGATGACTTGGATGCCATTGTACCTGCAG

   1900     .    :    .    :    .
   1766 TAAAGAAATTAAAAGTACTTTCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 177885 TAAAGAAATTAAAAGTACTTTCATAC