seq1 = pF1KE2175.tfa, 372 bp
seq2 = pF1KE2175/gi568815581r_3563751.tfa (gi568815581r:3563751_3768526), 204776 bp

>pF1KE2175 372
>gi568815581r:3563751_3768526 (Chr17)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-159  (103729-103848)   99% ->
160-237  (104255-104332)   100% ->
238-372  (104642-104776)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTACATCCCGGGCCAGCCGGTCACCGCCGTGGTG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGTCCTACATCCCGGGCCAGCCGGTCACCGCCGTGGTGGTG...CAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AAGAGTTGAAATTCACAAGCTGCGTCAAGGTGAGAACTTAATCCTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103731 AAGAGTTGAAATTCACAAGCTGCGTCAAGGTGAGAACTTAATCCTGGGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGCATTGGAGGTGGAATCGACCAGGACCCTTCCCAGAATCCCTTCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 103781 TCAGCATTGGAGGTGGAATCGACCAGGATCCTTCCCAGAATCCCTTCTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGACAAGACGGACAAG         GGTATTTATGTCACACGGGTGTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103831 GAAGACAAGACGGACAAGGTG...CAGGGTATTTATGTCACACGGGTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAGGAGGCCCTGCTGAAATCGCTGGGCTGCAGATTGGAGACAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104278 TGAAGGAGGCCCTGCTGAAATCGCTGGGCTGCAGATTGGAGACAAGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCAG         GTGAACGGCTGGGACATGACCATGGTCACACACGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104328 TGCAGGTA...CAGGTGAACGGCTGGGACATGACCATGGTCACACACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGGCCCGCAAGCGGCTCACCAAGCGCTCGGAGGAGGTGGTGCGTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104678 CAGGCCCGCAAGCGGCTCACCAAGCGCTCGGAGGAGGTGGTGCGTCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    324 GGTGACGCGGCAGTCGCTGCAGAAGGCCGTGCAGCAGTCCATGCTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104728 GGTGACGCGGCAGTCGCTGCAGAAGGCCGTGCAGCAGTCCATGCTGTCC