seq1 = pF1KE2166.tfa, 1059 bp
seq2 = pF1KE2166/gi568815576r_42592893.tfa (gi568815576r:42592893_42793951), 201059 bp

>pF1KE2166 1059
>gi568815576r:42592893_42793951 (Chr22)

(complement)

1-1059  (100001-101059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAAGCCCCCCGACCTCCTGCTGCGGCTGCTCCGGGGCGCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAAGCCCCCCGACCTCCTGCTGCGGCTGCTCCGGGGCGCCCCAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCGGGTCTGCACCCTGTTCATCATCGGCTTCAAGTTCACGTTTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCGGGTCTGCACCCTGTTCATCATCGGCTTCAAGTTCACGTTTTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCATCATGATCTACTGGCACGTTGTGGGAGAGCCCAAGGAGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCATCATGATCTACTGGCACGTTGTGGGAGAGCCCAAGGAGAAAGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTCTATAACCTGCCAGCAGAGATCCCCTGCCCCACCTTGACACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTCTATAACCTGCCAGCAGAGATCCCCTGCCCCACCTTGACACCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCCCACCCTCCCACGGCCCCACTCCAGGCAACATCTTCTTCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCCCACCCTCCCACGGCCCCACTCCAGGCAACATCTTCTTCCTGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTCAGACCGGACCAACCCCAACTTCCTGTTCATGTGCTCGGTGGAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTCAGACCGGACCAACCCCAACTTCCTGTTCATGTGCTCGGTGGAGTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCGCCAGAACTCACCCCGAATCCCACGTGCTGGTCCTGATGAAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCGCCAGAACTCACCCCGAATCCCACGTGCTGGTCCTGATGAAAGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCCGGGTGGCAACGCCTCTCTGCCCCGGCACCTGGGCATCTCACTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCCGGGTGGCAACGCCTCTCTGCCCCGGCACCTGGGCATCTCACTTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTGCTTCCCGAATGTCCAGATGCTCCCGCTGGACCTGCGGGAGCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTGCTTCCCGAATGTCCAGATGCTCCCGCTGGACCTGCGGGAGCTGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGGACACACCCCTGGCCGACTGGTACGCGGCCGTGCAGGGGCGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGGGACACACCCCTGGCCGACTGGTACGCGGCCGTGCAGGGGCGCTGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCCTACCTGCTGCCCGTGCTCTCCGACGCCTCCAGGATCGCACTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCCTACCTGCTGCCCGTGCTCTCCGACGCCTCCAGGATCGCACTCATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGAAGTTCGGCGGCATCTACCTGGACACGGACTTCATTGTTCTCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGAAGTTCGGCGGCATCTACCTGGACACGGACTTCATTGTTCTCAAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGCGGAACCTGACCAACGTGCTGGGCACCCAGTCCCGCTACGTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGCGGAACCTGACCAACGTGCTGGGCACCCAGTCCCGCTACGTCCTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGCGCGTTCCTGGCCTTCGAGCGCCGGCACGAGTTCATGGCGCTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGCGCGTTCCTGGCCTTCGAGCGCCGGCACGAGTTCATGGCGCTGTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCGGGACTTCGTGGACCACTACAACGGCTGGATCTGGGGTCACCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCGGGACTTCGTGGACCACTACAACGGCTGGATCTGGGGTCACCAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCGCAGCTGCTCACGCGGGTCTTCAAGAAGTGGTGTTCCATCCGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCGCAGCTGCTCACGCGGGTCTTCAAGAAGTGGTGTTCCATCCGCAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCGAGAGCCGCGCCTGCCGCGGCGTCACCACCCTGCCCCCTGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCGAGAGCCGCGCCTGCCGCGGCGTCACCACCCTGCCCCCTGAGGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTACCCCATCCCCTGGCAGGACTGGAAGAAGTACTTTGAGGACATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTACCCCATCCCCTGGCAGGACTGGAAGAAGTACTTTGAGGACATCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCGAGGAGCTGCCGCGGCTGCTCAGTGCCACCTATGCTGTCCACGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCGAGGAGCTGCCGCGGCTGCTCAGTGCCACCTATGCTGTCCACGTGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAACAAGAAGAGCCAGGGCACGCGGTTCGAGGCCACGTCCAGGGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAACAAGAAGAGCCAGGGCACGCGGTTCGAGGCCACGTCCAGGGCACTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGCCCAGCTGCATGCCCGCTACTGCCCCACGACGCACGAGGCCATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGGCCCAGCTGCATGCCCGCTACTGCCCCACGACGCACGAGGCCATGAAA

   1050     .
   1051 ATGTACTTG
        |||||||||
 101051 ATGTACTTG