seq1 = pF1KE2160.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KE2160/gi568815577r_30115251.tfa (gi568815577r:30115251_30315925), 200675 bp

>pF1KE2160 675
>gi568815577r:30115251_30315925 (Chr21)

(complement)

1-675  (100001-100675)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACCCATGCCTTAGAAATCGCTGGGCTGTTTCTTGGTGGTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACCCATGCCTTAGAAATCGCTGGGCTGTTTCTTGGTGGTGTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATGGTGGGCACAGTGGCTGTCACTGTCATGCCTCAGTGGAGAGTGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATGGTGGGCACAGTGGCTGTCACTGTCATGCCTCAGTGGAGAGTGTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCATTGAAAACAACATCGTGGTTTTTGAAAACTTCTGGGAAGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTCATTGAAAACAACATCGTGGTTTTTGAAAACTTCTGGGAAGGACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATGAATTGCGTGAGGCAGGCTAACATCAGGATGCAGTGCAAAATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATGAATTGCGTGAGGCAGGCTAACATCAGGATGCAGTGCAAAATCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATTCCCTGCTGGCTCTTTCTCCGGACCTACAGGCAGCCAGAGGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGATTCCCTGCTGGCTCTTTCTCCGGACCTACAGGCAGCCAGAGGACTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGTGCTGCTTCCGTGATGTCCTTCTTGGCTTTCATGATGGCCATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGTGCTGCTTCCGTGATGTCCTTCTTGGCTTTCATGATGGCCATCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCATGAAATGCACCAGGTGCACGGGGGACAATGAGAAGGTGAAGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCATGAAATGCACCAGGTGCACGGGGGACAATGAGAAGGTGAAGGCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATTCTGCTGACGGCTGGAATCATCTTCATCATCACGGGCATGGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATTCTGCTGACGGCTGGAATCATCTTCATCATCACGGGCATGGTGGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCCCTGTGAGCTGGGTTGCCAATGCCATCATCAGAGATTTCTATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCCCTGTGAGCTGGGTTGCCAATGCCATCATCAGAGATTTCTATAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCAATAGTGAATGTTGCCCAAAAACGTGAGCTTGGAGAAGCTCTCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCAATAGTGAATGTTGCCCAAAAACGTGAGCTTGGAGAAGCTCTCTACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGATGGACCACGGCACTGGTGCTGATTGTTGGAGGAGCTCTGTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGATGGACCACGGCACTGGTGCTGATTGTTGGAGGAGCTCTGTTCTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGTTTTTTGTTGCAACGAAAAGAGCAGTAGCTACAGATACTCGATACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGTTTTTTGTTGCAACGAAAAGAGCAGTAGCTACAGATACTCGATACCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCCATCGCACAACCCAAAAAAGTTATCACACCGGAAAGAAGTCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCCATCGCACAACCCAAAAAAGTTATCACACCGGAAAGAAGTCACCGAG

    650     .    :    .    :    .
    651 CGTCTACTCCAGAAGTCAGTATGTG
        |||||||||||||||||||||||||
 100651 CGTCTACTCCAGAAGTCAGTATGTG