seq1 = pF1KE2154.tfa, 1041 bp
seq2 = pF1KE2154/gi568815579r_4437943.tfa (gi568815579r:4437943_4638953), 201011 bp

>pF1KE2154 1041
>gi568815579r:4437943_4638953 (Chr19)

(complement)

1-32  (98941-98972)   100% ->
33-1041  (100003-101011)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTCTTGGAGCAGACAGCGACCAAAAAG         CCCAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  98941 ATGTCCTCTTGGAGCAGACAGCGACCAAAAAGGTA...CAGCCCAGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CATTCAACCCCATGTTTCTAGAACTCTGTTCCTGCTGCTGCTGTTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 CATTCAACCCCATGTTTCTAGAACTCTGTTCCTGCTGCTGCTGTTGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTCAGCCTGGGGGGTCACCCTGAGCCCCAAAGACTGCCAGGTGTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 CCTCAGCCTGGGGGGTCACCCTGAGCCCCAAAGACTGCCAGGTGTTCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAGACCATGGCAGCTCCATCTCCTGTCAACCACCTGCCGAAATCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100112 TCAGACCATGGCAGCTCCATCTCCTGTCAACCACCTGCCGAAATCCCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACCTGCCAGCCGACACCGTGCACCTGGCCGTGGAATTCTTCAACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100162 CTACCTGCCAGCCGACACCGTGCACCTGGCCGTGGAATTCTTCAACCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCACCTGCCAGCCAACCTCCTCCAGGGCGCCTCTAAGCTCCAAGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100212 CCCACCTGCCAGCCAACCTCCTCCAGGGCGCCTCTAAGCTCCAAGAATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACCTCTCCAGCAATGGGCTGGAAAGCCTCTCGCCCGAATTCCTGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100262 CACCTCTCCAGCAATGGGCTGGAAAGCCTCTCGCCCGAATTCCTGCGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGTGCCGCAGCTGAGGGTGCTGGATCTAACCCGAAACGCCCTGACCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100312 AGTGCCGCAGCTGAGGGTGCTGGATCTAACCCGAAACGCCCTGACCGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCCCTCGGGCCTCTTCCAGGCCTCAGCCACCCTGGACACCCTGGTATTG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100362 TGCCCCCGGGCCTCTTCCAGGCCTCAGCCACCCTGGACACCCTGGTATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAAGAAAACCAGCTGGAGGTCCTGGAGGTCTCGTGGCTACACGGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100412 AAAGAAAACCAGCTGGAGGTCCTGGAGGTCTCGTGGCTACACGGCCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGCTCTGGGGCATCTGGACCTGTCTGGGAACCGCCTCCGGAAACTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100462 AGCTCTGGGGCATCTGGACCTGTCTGGGAACCGCCTCCGGAAACTGCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCGGGCTGCTGGCCAACTTCACCCTCCTGCGCACCCTTGACCTTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100512 CCGGGCTGCTGGCCAACTTCACCCTCCTGCGCACCCTTGACCTTGGGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AACCAGTTGGAGACCTTGCCACCTGACCTCCTGAGGGGTCCGCTGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100562 AACCAGTTGGAGACCTTGCCACCTGACCTCCTGAGGGGTCCGCTGCAATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGAACGGCTACATCTAGAAGGCAACAAATTGCAAGTACTGGGAAAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100612 AGAACGGCTACATCTAGAAGGCAACAAATTGCAAGTACTGGGAAAAGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCTCTTGCCGCAGCCGGACCTGCGCTACCTCTTCCTGAACGGCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100662 TCCTCTTGCCGCAGCCGGACCTGCGCTACCTCTTCCTGAACGGCAACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGGCCAGGGTGGCAGCCGGTGCCTTCCAGGGCCTGCGGCAGCTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100712 CTGGCCAGGGTGGCAGCCGGTGCCTTCCAGGGCCTGCGGCAGCTGGACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCTGGACCTCTCCAATAACTCACTGGCCAGCGTGCCCGAGGGGCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100762 GCTGGACCTCTCCAATAACTCACTGGCCAGCGTGCCCGAGGGGCTCTGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CATCCCTAGGGCAGCCAAACTGGGACATGCGGGATGGCTTCGACATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100812 CATCCCTAGGGCAGCCAAACTGGGACATGCGGGATGGCTTCGACATCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGCAACCCCTGGATCTGTGACCAGAACCTGAGCGACCTCTATCGTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100862 GGCAACCCCTGGATCTGTGACCAGAACCTGAGCGACCTCTATCGTTGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TCAGGCCCAAAAAGACAAGATGTTTTCCCAGAATGACACGCGCTGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100912 TCAGGCCCAAAAAGACAAGATGTTTTCCCAGAATGACACGCGCTGTGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGCCTGAAGCCGTGAAGGGCCAGACGCTCCTGGCAGTGGCCAAGTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100962 GGCCTGAAGCCGTGAAGGGCCAGACGCTCCTGGCAGTGGCCAAGTCCCAG