seq1 = pF1KE2150.tfa, 711 bp
seq2 = pF1KE2150/gi568815586f_8023879.tfa (gi568815586f:8023879_8238284), 214406 bp

>pF1KE2150 711
>gi568815586f:8023879_8238284 (Chr12)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-199  (101683-101799)   100% ->
200-298  (105386-105484)   100% ->
299-450  (111707-111858)   100% ->
451-566  (112910-113025)   100% ->
567-711  (114262-114406)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTCGGAAATCACTTATGCTGAAGTGAGGTTCAAAAATGAATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTCGGAAATCACTTATGCTGAAGTGAGGTTCAAAAATGAATTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCTCAGGCATCAACACAGCCTCTTCTGCAG         CTTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GTCCTCAGGCATCAACACAGCCTCTTCTGCAGGTA...CAGCTTCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGGACTGCCCCTCACAAAAGTAATACCGGATTCCCCAAGCTGCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101692 AGAGGACTGCCCCTCACAAAAGTAATACCGGATTCCCCAAGCTGCTTTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTCACTGTTGATATTTTTCCTGCTATTGGCAATCTCATTCTTTATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101742 GCCTCACTGTTGATATTTTTCCTGCTATTGGCAATCTCATTCTTTATTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTTGTCA         TTTTCTTTCAAAAATATTCTCAGCTTCTTGAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101792 TTTTGTCAGTA...CAGTTTTCTTTCAAAAATATTCTCAGCTTCTTGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAGACTACAAAAGAGCTGGTTCATACAACATTGGAGTGTGTGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105419 AAAAGACTACAAAAGAGCTGGTTCATACAACATTGGAGTGTGTGAAAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATATGCCCGTGGAAG         AGACAGCCTGGAGCTGTTGCCCAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105469 AATATGCCCGTGGAAGGTA...CAGAGACAGCCTGGAGCTGTTGCCCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAATTGGAAGTCATTTAGTTCCAACTGCTACTTTATTTCTACTGAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111732 GAATTGGAAGTCATTTAGTTCCAACTGCTACTTTATTTCTACTGAATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CATCTTGGCAAGACAGTGAGAAGGACTGTGCTAGAATGGAGGCTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111782 CATCTTGGCAAGACAGTGAGAAGGACTGTGCTAGAATGGAGGCTCACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGTGATAAACACTCAAGAAGAGCAG         GATTTCATCTTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111832 CTGGTGATAAACACTCAAGAAGAGCAGGTA...CAGGATTTCATCTTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAATCTGCAAGAAGAATCTGCTTATTTTGTGGGGCTCTCAGATCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112924 GAATCTGCAAGAAGAATCTGCTTATTTTGTGGGGCTCTCAGATCCAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTCAGCGACATTGGCAATGGGTTGATCAGACACCATACAATGAAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112974 GTCAGCGACATTGGCAATGGGTTGATCAGACACCATACAATGAAAGTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AC         ATTCTGGCATCCACGTGAGCCCAGTGATCCCAATGAGCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113024 ACGTG...CAGATTCTGGCATCCACGTGAGCCCAGTGATCCCAATGAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGCGTTGTGCTAAATTTTCGTAAATCACCCAAAAGATGGGGCTGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114301 CTGCGTTGTGCTAAATTTTCGTAAATCACCCAAAAGATGGGGCTGGAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGTTAATTGTCTTGGTCCTCAAAGGTCAGTTTGTGAGATGATGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114351 ATGTTAATTGTCTTGGTCCTCAAAGGTCAGTTTGTGAGATGATGAAGATC

    750     .
    706 CACTTA
        ||||||
 114401 CACTTA