seq1 = pF1KE2149.tfa, 1821 bp
seq2 = pF1KE2149/gi568815579r_40567471.tfa (gi568815579r:40567471_40784560), 217090 bp

>pF1KE2149 1821
>gi568815579r:40567471_40784560 (Chr19)

(complement)

1-24  (94078-94101)   100% ->
25-109  (97566-97650)   100% ->
110-249  (100005-100144)   100% ->
250-324  (101593-101667)   100% ->
325-399  (101759-101833)   100% ->
400-540  (103504-103644)   100% ->
541-730  (107140-107329)   100% ->
731-1036  (110912-111217)   100% ->
1037-1159  (114541-114663)   100% ->
1160-1821  (116423-117090)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGCAGCGCGGCGGCCAGC         GGCGGACCCCGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  94078 ATGTCCCGCAGCGCGGCGGCCAGCGTG...CAGGGCGGACCCCGGAGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAGCGGCACCTGCCCCCAGCCCCCTGTGGGGCCCCGGGGCCCCCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  97583 TGAGCGGCACCTGCCCCCAGCCCCCTGTGGGGCCCCGGGGCCCCCAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTGCAGGACGGAGCCAG         ACGGGGCGGGCACCATGAACAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  97633 CCTGCAGGACGGAGCCAGGTG...CAGACGGGGCGGGCACCATGAACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTACGGCAGAGCCTGCGGCGGAGGAAGCCAGCCTACGTGCCCGAGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 TTACGGCAGAGCCTGCGGCGGAGGAAGCCAGCCTACGTGCCCGAGGCGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCGCCCGCACCAGTGGCAGGCAGACGAGGACGCGGTGCGGAAGGGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 GCGCCCGCACCAGTGGCAGGCAGACGAGGACGCGGTGCGGAAGGGCACGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAGCTTCCCGGTCAGG         TACCTGGGTCACGTGGAGGTAGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100128 GCAGCTTCCCGGTCAGGGTG...AAGTACCTGGGTCACGTGGAGGTAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGTCCCGGGGAATGCACGTGTGTGAAGATGCGGTGAAGAAGCTGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 GAGTCCCGGGGAATGCACGTGTGTGAAGATGCGGTGAAGAAGCTGAAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         ATGGGCCGAAAGTCCGTGAAGTCTGTCCTGTGGGTGTCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101667 GGTG...CAGATGGGCCGAAAGTCCGTGAAGTCTGTCCTGTGGGTGTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCGATGGGCTCCGAGTGGTGGACGACAAAACCAAG         GATCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101799 CCGATGGGCTCCGAGTGGTGGACGACAAAACCAAGGTA...TAGGATCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CTGGTCGACCAGACCATCGAAAAGGTCTCCTTTTGTGCTCCTGACCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103510 CTGGTCGACCAGACCATCGAAAAGGTCTCCTTTTGTGCTCCTGACCGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCTGGACAAGGCTTTCTCCTATATCTGTCGTGACGGGACTACCCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103560 CCTGGACAAGGCTTTCTCCTATATCTGTCGTGACGGGACTACCCGCCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGATCTGCCACTGTTTTCTGGCACTGAAGGACTCC         GGCGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103610 GGATCTGCCACTGTTTTCTGGCACTGAAGGACTCCGTG...TAGGGCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AGGCTGAGCCACGCTGTGGGCTGTGCTTTTGCCGCCTGCCTGGAGCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107146 AGGCTGAGCCACGCTGTGGGCTGTGCTTTTGCCGCCTGCCTGGAGCGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACAGCGACGGGAGAAGGAATGTGGGGTCACGGCCGCCTTCGATGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107196 ACAGCGACGGGAGAAGGAATGTGGGGTCACGGCCGCCTTCGATGCCAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCACCAGCTTCGCCCGCGAGGGCTCCTTCCGCCTGTCTGGGGGTGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107246 GCACCAGCTTCGCCCGCGAGGGCTCCTTCCGCCTGTCTGGGGGTGGGCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTGCTGAGCGAGAGGCCCCGGACAAGAAGAAAG         CAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107296 CCTGCTGAGCGAGAGGCCCCGGACAAGAAGAAAGGTG...CAGCAGAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCAGCTGCCCCCACTGTGGCTCCTGGCCCTGCCCAGCCTGGGCACGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110919 AGCAGCTGCCCCCACTGTGGCTCCTGGCCCTGCCCAGCCTGGGCACGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCCCGACACCAGCCACCACATCCCCTGGTGAGAAGGGTGAGGCAGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110969 CCCCGACACCAGCCACCACATCCCCTGGTGAGAAGGGTGAGGCAGGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCTGTGGCTGCAGGCACCACTGCGGCCGCCATCCCCCGGCGCCATGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111019 CCTGTGGCTGCAGGCACCACTGCGGCCGCCATCCCCCGGCGCCATGCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTGGAGCAGCTGGTTCGCCAGGGCTCCTTCCGTGGGTTCCCAGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111069 CCTGGAGCAGCTGGTTCGCCAGGGCTCCTTCCGTGGGTTCCCAGCACTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCCAGAAGAACTCGCCTTTCAAACGGCAGCTGAGCCTACGGCTGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111119 GCCAGAAGAACTCGCCTTTCAAACGGCAGCTGAGCCTACGGCTGAATGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTGCCATCCACGCTGCAGCGCCGCACTGACTTCCAGGTGAAGGGCACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 111169 CTGCCATCCACGCTGCAGCGCCGCACTGACTTCCAGGTGAAGGGCACAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037         TGCCTGAGATGGAGCCTCCTGGTGCCGGCGACAGTGACAGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111219 TG...CAGTGCCTGAGATGGAGCCTCCTGGTGCCGGCGACAGTGACAGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCAACGCTCTGTGCACACAGATCAGTTCATCTTTTGCCAGTGCTGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114583 TCAACGCTCTGTGCACACAGATCAGTTCATCTTTTGCCAGTGCTGGAGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCAGCACCAGGGCCACCACCTGCCACAACAG         GGACTTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 114633 CCAGCACCAGGGCCACCACCTGCCACAACAGGTA...CAGGGACTTCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTGGGGTGAGCCCTCCGTGCCCCCTGCAGCTGCCTTCCAGCCTGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116433 CTGGGGTGAGCCCTCCGTGCCCCCTGCAGCTGCCTTCCAGCCTGGGCACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGCGGACACCTTCAGAGGCTGAGCGATGGCTGGAGGAGGTGTCACAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116483 AGCGGACACCTTCAGAGGCTGAGCGATGGCTGGAGGAGGTGTCACAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCCAAGGCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAG   CAGCAGCAGCAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||||||||||
 116533 GCCAAGGCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1317   A CAGCAACAGCAGCAAGCAGCCTCAGTGGCCCCAGTGCCCACCATGC
        --|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116583 GCAGCAGCAACAGCAGCAAGCAGCCTCAGTGGCCCCAGTGCCCACCATGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1364 CTCCTGCCCTGCAGCCTTTCCCCGCCCCCGTGGGGCCCTTTGACGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116633 CTCCTGCCCTGCAGCCTTTCCCCGCCCCCGTGGGGCCCTTTGACGCTGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1414 CCTGCCCAAGTGGCCGTGTTCCTGCCACCCCCACACATGCAGCCCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116683 CCTGCCCAAGTGGCCGTGTTCCTGCCACCCCCACACATGCAGCCCCCTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1464 TGTGCCCGCCTACCCGGGCTTGGGCTACCCACCGATGCCCCGGGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116733 TGTGCCCGCCTACCCGGGCTTGGGCTACCCACCGATGCCCCGGGTGCCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1514 TGGTGGGCATCACACCCTCACAGATGGTGGCAAACGCCTTCTGCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116783 TGGTGGGCATCACACCCTCACAGATGGTGGCAAACGCCTTCTGCTCAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1564 GCCCAGCTCCAGCCTCAGCCTGCCACTCTGCTTGGGAAAGCTGGGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116833 GCCCAGCTCCAGCCTCAGCCTGCCACTCTGCTTGGGAAAGCTGGGGCCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1614 CCCGCCCCCTGCCATACCCAGTGCCCCTGGGAGCCAGGCCCGCCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116883 CCCGCCCCCTGCCATACCCAGTGCCCCTGGGAGCCAGGCCCGCCCTCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1664 CCAATGGGGCCCCCTGGCCCCCTGAGCCAGCGCCTGCCCCAGCTCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116933 CCAATGGGGCCCCCTGGCCCCCTGAGCCAGCGCCTGCCCCAGCTCCAGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714 TTGGACCCCTTTGAGGCCCAGTGGGCGGCATTAGAAGGCAAAGCCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116983 TTGGACCCCTTTGAGGCCCAGTGGGCGGCATTAGAAGGCAAAGCCACTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1764 AGAGAAACCCTCCAACCCCTTTTCTGGCGACCTGCAAAAGACATTCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117033 AGAGAAACCCTCCAACCCCTTTTCTGGCGACCTGCAAAAGACATTCGAGA

   1900     .
   1814 TTGAACTG
        ||||||||
 117083 TTGAACTG