seq1 = pF1KE2148.tfa, 456 bp
seq2 = pF1KE2148/gi568815595r_101476492.tfa (gi568815595r:101476492_101676947), 200456 bp

>pF1KE2148 456
>gi568815595r:101476492_101676947 (Chr3)

(complement)

1-456  (100001-100456)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCTAGTGATCCCTGAAAAGTTCCAGCATATTTTGCGAGTACTCAA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCTAGTGATCCCTGAAAAGTTCCAGCATATTTTGCGAGTACTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCAACATCGATGGGCGGCGGAAAATAGCCTTTGCCATCACTGCCATTA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCAACATCGATGGGCAGCGGAAAATAGCCTTTGCCATCACTGCCATTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGTGTGGGCCGAAGATATGCTCATGTGGTGTTGAGGAAAGCAGACATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100101 AGGGTGTGGGCCGAAGATATGCTCATGTGGTGTTGAGGAAAGCAGACACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCTCACCAAGAGGGCGGGAGAACTCACTGAGGATGAGGTGGAACGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100151 GACCTCACCAAGAGGGCGGGAGAACTCACTGATGATGAGGTGGAACGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATCACCATTATGCAGAATCCACGCCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATCACCGTTATGCAGAATCCACGCCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAACAGACAGAAGGATGTAAAGGATGGAAAATACAGCCAGGTCCTAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100251 TGAACAGACAGAAGGATGTAAAGGATGGAAAATATAGCCAGGTCCTAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGGTCTGGACAACAAGCTCCGTGAAGACCTGGAGCGACTGAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATGGTCTGGACAACAAGCTCCGTGAAGACCTGGAGCGACTGAAGAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCGGGCCCATAGAGGGCTGCGTCACTTCTGGGGCCTTCGTGTCCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCGGGCCCATAGAGGGCTGCGTCACTTCTGGGGCCTTCGTGTCCGAGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCACACCAAGACCACTGGCCGCCGTGGCCGCACCGTGGGTGTGTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCACACCAAGACCACTGGCCGCCGTGGCCGCACCGTGGGTGTGTCCAAG

    450     .
    451 AAGAAA
        ||||||
 100451 AAGAAA