seq1 = pF1KE2134.tfa, 2574 bp
seq2 = pF1KE2134/gi568815597r_223010522.tfa (gi568815597r:223010522_223213031), 202510 bp

>pF1KE2134 2574
>gi568815597r:223010522_223213031 (Chr1)

(complement)

1-2574  (100001-102574)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGACCACCTGGACCTTCTCCTAGGAGTGGTGCTCATGGCCGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGACCACCTGGACCTTCTCCTAGGAGTGGTGCTCATGGCCGGTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGTTTGGAATTCCTTCCTGCTCCTTTGATGGCCGAATAGCCTTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGTTTGGAATTCCTTCCTGCTCCTTTGATGGCCGAATAGCCTTTTATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTTCTGCAACCTCACCCAGGTCCCCCAGGTCCTCAACACCACTGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTTCTGCAACCTCACCCAGGTCCCCCAGGTCCTCAACACCACTGAGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCTGCTGAGCTTCAACTATATCAGGACAGTCACTGCTTCATCCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCCTGCTGAGCTTCAACTATATCAGGACAGTCACTGCTTCATCCTTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTCTGGAACAGCTGCAGCTGCTGGAGCTCGGGAGCCAGTATACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTCTGGAACAGCTGCAGCTGCTGGAGCTCGGGAGCCAGTATACCCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGACTATTGACAAGGAGGCCTTCAGAAACCTGCCCAACCTTAGAATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGACTATTGACAAGGAGGCCTTCAGAAACCTGCCCAACCTTAGAATCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCTGGGAAGTAGTAAGATATACTTCTTGCATCCAGATGCTTTTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCTGGGAAGTAGTAAGATATACTTCTTGCATCCAGATGCTTTTCAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTGTTCCATCTGTTTGAACTTAGACTGTATTTCTGTGGTCTCTCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTGTTCCATCTGTTTGAACTTAGACTGTATTTCTGTGGTCTCTCTGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGTATTGAAAGATGGTTATTTCAGAAATTTAAAGGCTTTAACTCGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGTATTGAAAGATGGTTATTTCAGAAATTTAAAGGCTTTAACTCGCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATCTATCCAAAAATCAGATTCGTAGCCTTTACCTTCATCCTTCATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GATCTATCCAAAAATCAGATTCGTAGCCTTTACCTTCATCCTTCATTTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGTTGAATTCCTTAAAGTCCATAGATTTTTCCTCCAACCAAATATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGTTGAATTCCTTAAAGTCCATAGATTTTTCCTCCAACCAAATATTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGTATGTGAACATGAGCTCGAGCCCCTACAAGGGAAAACGCTCTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGTATGTGAACATGAGCTCGAGCCCCTACAAGGGAAAACGCTCTCCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTAGCCTCGCAGCTAATAGCTTGTATAGCAGAGTCTCAGTGGACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTAGCCTCGCAGCTAATAGCTTGTATAGCAGAGTCTCAGTGGACTGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAAATGTATGAACCCATTCAGAAACATGGTGCTGGAGATACTAGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAAATGTATGAACCCATTCAGAAACATGGTGCTGGAGATACTAGATGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGGAAATGGCTGGACAGTGGACATCACAGGAAACTTTAGCAATGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGGAAATGGCTGGACAGTGGACATCACAGGAAACTTTAGCAATGCCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCAAAAGCCAGGCCTTCTCTTTGATTCTTGCCCACCACATCATGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGCAAAAGCCAGGCCTTCTCTTTGATTCTTGCCCACCACATCATGGGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGGGTTTGGCTTCCATAACATCAAAGATCCTGACCAGAACACATTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGGGTTTGGCTTCCATAACATCAAAGATCCTGACCAGAACACATTTGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCTGGCCAGAAGTTCAGTGAGACACCTGGATCTTTCACATGGGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCTGGCCAGAAGTTCAGTGAGACACCTGGATCTTTCACATGGGTTTGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCTCCCTGAACTCACGAGTCTTTGAGACACTCAAGGATTTGAAGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCTCCCTGAACTCACGAGTCTTTGAGACACTCAAGGATTTGAAGGTTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAACCTTGCCTACAACAAGATAAATAAGATTGCAGATGAAGCATTTTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAACCTTGCCTACAACAAGATAAATAAGATTGCAGATGAAGCATTTTACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GACTTGACAACCTCCAAGTTCTCAATTTGTCATATAACCTTCTGGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GACTTGACAACCTCCAAGTTCTCAATTTGTCATATAACCTTCTGGGGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTTTACAGTTCGAATTTCTATGGACTACCTAAGGTAGCCTACATTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTTTACAGTTCGAATTTCTATGGACTACCTAAGGTAGCCTACATTGATTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCAAAAGAATCACATTGCAATAATTCAAGACCAAACATTCAAATTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCAAAAGAATCACATTGCAATAATTCAAGACCAAACATTCAAATTCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAAAATTACAGACCTTGGATCTCCGAGACAATGCTCTTACAACCATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAAAATTACAGACCTTGGATCTCCGAGACAATGCTCTTACAACCATTCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTTATTCCAAGCATACCCGATATCTTCTTGAGTGGCAATAAACTAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTTATTCCAAGCATACCCGATATCTTCTTGAGTGGCAATAAACTAGTGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTTGCCAAAGATCAACCTTACAGCGAACCTCATCCACTTATCAGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTGCCAAAGATCAACCTTACAGCGAACCTCATCCACTTATCAGAAAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GGCTAGAAAATCTAGATATTCTCTACTTTCTCCTACGGGTACCTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GGCTAGAAAATCTAGATATTCTCTACTTTCTCCTACGGGTACCTCATCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CAGATTCTCATTTTAAATCAAAATCGCTTCTCCTCCTGTAGTGGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CAGATTCTCATTTTAAATCAAAATCGCTTCTCCTCCTGTAGTGGAGATCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AACCCCTTCAGAGAATCCCAGCTTAGAACAGCTTTTCCTTGGAGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AACCCCTTCAGAGAATCCCAGCTTAGAACAGCTTTTCCTTGGAGAAAATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGTTGCAACTTGCCTGGGAAACTGAGCTCTGTTGGGATGTTTTTGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGTTGCAACTTGCCTGGGAAACTGAGCTCTGTTGGGATGTTTTTGAGGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTTTCTCATCTTCAAGTTCTGTATTTGAATCATAACTATCTTAATTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTTTCTCATCTTCAAGTTCTGTATTTGAATCATAACTATCTTAATTCCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCCACCAGGAGTATTTAGCCATCTGACTGCATTAAGGGGACTAAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCCACCAGGAGTATTTAGCCATCTGACTGCATTAAGGGGACTAAGCCTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ACTCCAACAGGCTGACAGTTCTTTCTCACAATGATTTACCTGCTAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ACTCCAACAGGCTGACAGTTCTTTCTCACAATGATTTACCTGCTAATTTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAGATCCTGGACATATCCAGGAACCAGCTCCTAGCTCCTAATCCTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAGATCCTGGACATATCCAGGAACCAGCTCCTAGCTCCTAATCCTGATGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ATTTGTATCACTTAGTGTCTTGGATATAACTCATAACAAGTTCATTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 ATTTGTATCACTTAGTGTCTTGGATATAACTCATAACAAGTTCATTTGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AATGTGAACTTAGCACTTTTATCAGTTGGCTTAATCACACCAATGTCACT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 101751 AATGTGAACTTAGCACTTTTATCAATTGGCTTAATCACACCAATGTCACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ATAGCTGGGCCTCCTGCAGACATATATTGTGTGTACCCTGACTCGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 101801 ATAGCTGGGCCTCCTGCAGACATATATTGTGTGTACCCTGACTCGTTCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TGGGGTTTCCCTCTTCTCTCTTTCCACGGAAGGTTGTGATGAAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TGGGGTTTCCCTCTTCTCTCTTTCCACGGAAGGTTGTGATGAAGAGGAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TCTTAAAGTCCCTAAAGTTCTCCCTTTTCATTGTATGCACTGTCACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TCTTAAAGTCCCTAAAGTTCTCCCTTTTCATTGTATGCACTGTCACTCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 ACTCTGTTCCTCATGACCATCCTCACAGTCACAAAGTTCCGGGGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 ACTCTGTTCCTCATGACCATCCTCACAGTCACAAAGTTCCGGGGCTTCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TTTTATCTGTTATAAGACAGCCCAGAGACTGGTGTTCAAGGATCATCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 102001 TTTTATCTGTTATAAGACAGCCCAGAGACTGGTGTTCAAGGACCATCCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AGGGCACAGAACCTGATATGTACAAATATGATGCCTATTTGTGCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AGGGCACAGAACCTGATATGTACAAATATGATGCCTATTTGTGCTTCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 AGCAAAGACTTCACATGGGTGCAGAATGCTTTGCTCAAACACCTGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 AGCAAAGACTTCACATGGGTGCAGAATGCTTTGCTCAAACACCTGGACAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 TCAATACAGTGACCAAAACAGATTCAACCTGTGCTTTGAAGAAAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 TCAATACAGTGACCAAAACAGATTCAACCTGTGCTTTGAAGAAAGAGACT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 TTGTCCCAGGAGAAAACCGCATTGCCAATATCCAGGATGCCATCTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 TTGTCCCAGGAGAAAACCGCATTGCCAATATCCAGGATGCCATCTGGAAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 AGTAGAAAGATCGTTTGTCTTGTGAGCAGACACTTCCTTAGAGATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 AGTAGAAAGATCGTTTGTCTTGTGAGCAGACACTTCCTTAGAGATGGCTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 GTGCCTTGAAGCCTTCAGTTATGCCCAGGGCAGGTGCTTATCTGACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 GTGCCTTGAAGCCTTCAGTTATGCCCAGGGCAGGTGCTTATCTGACCTTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 ACAGTGCTCTCATCATGGTGGTGGTTGGGTCCTTGTCCCAGTACCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 ACAGTGCTCTCATCATGGTGGTGGTTGGGTCCTTGTCCCAGTACCAGTTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 ATGAAACATCAATCCATCAGAGGCTTTGTACAGAAACAGCAGTATTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 ATGAAACATCAATCCATCAGAGGCTTTGTACAGAAACAGCAGTATTTGAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 GTGGCCTGAGGATCTCCAGGATGTTGGCTGGTTTCTTCATAAACTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 GTGGCCTGAGGATCTCCAGGATGTTGGCTGGTTTCTTCATAAACTCTCTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 AACAGATACTAAAGAAAGAAAAAGAAAAGAAGAAAGACAATAACATTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 AACAGATACTAAAGAAAGAAAAAGAAAAGAAGAAAGACAATAACATTCCG

   2550     .    :    .    :
   2551 TTGCAAACTGTAGCAACCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||
 102551 TTGCAAACTGTAGCAACCATCTCC