seq1 = pF1KE2133.tfa, 2979 bp
seq2 = pF1KE2133/gi568815585r_27904055.tfa (gi568815585r:27904055_28200510), 296456 bp

>pF1KE2133 2979
>gi568815585r:27904055_28200510 (Chr13)

(complement)

1-43  (100001-100043)   97% ->
44-165  (129899-130020)   100% ->
166-368  (138442-138644)   99% ->
369-484  (143049-143164)   100% ->
485-614  (147837-147966)   100% ->
615-742  (150289-150416)   99% ->
743-882  (150737-150876)   100% ->
883-1036  (150974-151127)   100% ->
1037-1205  (152068-152236)   100% ->
1206-1309  (163223-163326)   100% ->
1310-1418  (164468-164576)   100% ->
1419-1597  (164838-165016)   100% ->
1598-1704  (166104-166210)   100% ->
1705-1837  (166297-166429)   100% ->
1838-1942  (166520-166624)   100% ->
1943-2053  (172223-172333)   100% ->
2054-2207  (173270-173423)   100% ->
2208-2290  (175568-175650)   100% ->
2291-2418  (177034-177161)   100% ->
2419-2541  (181922-182044)   100% ->
2542-2653  (184810-184921)   100% ->
2654-2753  (185255-185354)   100% ->
2754-2859  (185954-186059)   100% ->
2860-2979  (196337-196456)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGCGTTGGCGCGCGGCGGCGGCCAGCTGCCGCTGCTCG       
        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||>>>...>
 100001 ATGCCGGCGTTGGCGCGCGACGGCGGCCAGCTGCCGCTGCTCGGTA...C

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     44   TTGTTTTTTCTGCAATGATATTTGGGACTATTACAAATCAAGATCTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129897 AGTTGTTTTTTCTGCAATGATATTTGGGACTATTACAAATCAAGATCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGTGATCAAGTGTGTTTTAATCAATCATAAGAACAATGATTCATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129947 CTGTGATCAAGTGTGTTTTAATCAATCATAAGAACAATGATTCATCAGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAAGTCATCATCATATCCCATG         GTATCAGAATCCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 129997 GGGAAGTCATCATCATATCCCATGGTA...TAGGTATCAGAATCCCCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGACCTCGGGTGTGCGTTGAGACCCCAGAGCTCAGGGACAGTGTACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138459 AGACCTCGGGTGTGCGTTGAGACCCCAGAGCTCAGGGACAGTGTACGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGCCGCTGTGGAAGTGGATGTATCTGCTTCCATCACACTGCAAGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138509 CTGCCGCTGTGGAAGTGGATGTATCTGCTTCCATCACACTGCAAGTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCGATGCCCCAGGGAACATTTCCTGTCTCTGGGTCTTTAAGCACAGCTC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138559 GTCGACGCCCCAGGGAACATTTCCTGTCTCTGGGTCTTTAAGCACAGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGAATTGCCAGCCACATTTTGATTTACAAAACAG         AGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 138609 CCTGAATTGCCAGCCACATTTTGATTTACAAAACAGGTA...CAGAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGTTTCCATGGTCATTTTGAAAATGACAGAAACCCAAGCTGGAGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143054 TTGTTTCCATGGTCATTTTGAAAATGACAGAAACCCAAGCTGGAGAATAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTACTTTTTATTCAGAGTGAAGCTACCAATTACACAATATTGTTTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143104 CTACTTTTTATTCAGAGTGAAGCTACCAATTACACAATATTGTTTACAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGTATAAGAA         ATACCCTGCTTTACACATTAAGAAGACCTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 143154 GAGTATAAGAAGTA...TAGATACCCTGCTTTACACATTAAGAAGACCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACTTTAGAAAAATGGAAAACCAGGACGCCCTGGTCTGCATATCTGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147867 ACTTTAGAAAAATGGAAAACCAGGACGCCCTGGTCTGCATATCTGAGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTTCCAGAGCCGATCGTGGAATGGGTGCTTTGCGATTCACAGGGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147917 GTTCCAGAGCCGATCGTGGAATGGGTGCTTTGCGATTCACAGGGGGAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615          CTGTAAAGAAGAAAGTCCAGCTGTTGTTAAAAAGGAGGAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147967 GTA...CAGCTGTAAAGAAGAAAGTCCAGCTGTTGTTAAAAAGGAGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGTGCTTCATGAATTATTTGGGATGGACATAAGGTGCTGTGCCAGAAAT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 150330 AAGTGCTTCATGAATTATTTGGGACGGACATAAGGTGCTGTGCCAGAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAACTGGGCAGGGAATGCACCAGGCTGTTCACAATAG         ATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 150380 GAACTGGGCAGGGAATGCACCAGGCTGTTCACAATAGGTA...TAGATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAATCAAACTCCTCAGACCACATTGCCACAATTATTTCTTAAAGTAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150741 AAATCAAACTCCTCAGACCACATTGCCACAATTATTTCTTAAAGTAGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AACCCTTATGGATAAGGTGCAAAGCTGTTCATGTGAACCATGGATTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150791 AACCCTTATGGATAAGGTGCAAAGCTGTTCATGTGAACCATGGATTCGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCACCTGGGAATTAGAAAACAAAGCACTCGAGGAG         GGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 150841 CTCACCTGGGAATTAGAAAACAAAGCACTCGAGGAGGTA...TAGGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTACTTTGAGATGAGTACCTATTCAACAAACAGAACTATGATACGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150979 CTACTTTGAGATGAGTACCTATTCAACAAACAGAACTATGATACGGATTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGTTTGCTTTTGTATCATCAGTGGCAAGAAACGACACCGGATACTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151029 TGTTTGCTTTTGTATCATCAGTGGCAAGAAACGACACCGGATACTACACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TGTTCCTCTTCAAAGCATCCCAGTCAATCAGCTTTGGTTACCATCGTAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 151079 TGTTCCTCTTCAAAGCATCCCAGTCAATCAGCTTTGGTTACCATCGTAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037         AAAAGGGATTTATAAATGCTACCAATTCAAGTGAAGATTATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151129 TA...CAGAAAAGGGATTTATAAATGCTACCAATTCAAGTGAAGATTATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAATTGACCAATATGAAGAGTTTTGTTTTTCTGTCAGGTTTAAAGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152110 AAATTGACCAATATGAAGAGTTTTGTTTTTCTGTCAGGTTTAAAGCCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCACAAATCAGATGTACGTGGACCTTCTCTCGAAAATCATTTCCTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152160 CCACAAATCAGATGTACGTGGACCTTCTCTCGAAAATCATTTCCTTGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCAAAAGGGTCTTGATAACGGATACAG         CATATCCAAGTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 152210 GCAAAAGGGTCTTGATAACGGATACAGGTG...CAGCATATCCAAGTTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCAATCATAAGCACCAGCCAGGAGAATATATATTCCATGCAGAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163237 GCAATCATAAGCACCAGCCAGGAGAATATATATTCCATGCAGAAAATGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GATGCCCAATTTACCAAAATGTTCACGCTGAATATAAGAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 163287 GATGCCCAATTTACCAAAATGTTCACGCTGAATATAAGAAGTA...TAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GAAACCTCAAGTGCTCGCAGAAGCATCGGCAAGTCAGGCGTCCTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164469 GAAACCTCAAGTGCTCGCAGAAGCATCGGCAAGTCAGGCGTCCTGTTTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CGGATGGATACCCATTACCATCTTGGACCTGGAAGAAGTGTTCAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164519 CGGATGGATACCCATTACCATCTTGGACCTGGAAGAAGTGTTCAGACAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCTCCCAA         CTGCACAGAAGAGATCACAGAAGGAGTCTGGAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 164569 TCTCCCAAGTA...CAGCTGCACAGAAGAGATCACAGAAGGAGTCTGGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TAGAAAGGCTAACAGAAAAGTGTTTGGACAGTGGGTGTCGAGCAGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164871 TAGAAAGGCTAACAGAAAAGTGTTTGGACAGTGGGTGTCGAGCAGTACTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TAAACATGAGTGAAGCCATAAAAGGGTTCCTGGTCAAGTGCTGTGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164921 TAAACATGAGTGAAGCCATAAAAGGGTTCCTGGTCAAGTGCTGTGCATAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AATTCCCTTGGCACATCTTGTGAGACGATCCTTTTAAACTCTCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 164971 AATTCCCTTGGCACATCTTGTGAGACGATCCTTTTAAACTCTCCAGGTA.

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598      GCCCCTTCCCTTTCATCCAAGACAACATCTCATTCTATGCAACAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165021 ..CAGGCCCCTTCCCTTTCATCCAAGACAACATCTCATTCTATGCAACAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TTGGTGTTTGTCTCCTCTTCATTGTCGTTTTAACCCTGCTAATTTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166149 TTGGTGTTTGTCTCCTCTTCATTGTCGTTTTAACCCTGCTAATTTGTCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGTACAAAAAG         CAATTTAGGTATGAAAGCCAGCTACAGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 166199 AAGTACAAAAAGGTA...AAGCAATTTAGGTATGAAAGCCAGCTACAGAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGTACAGGTGACCGGCTCCTCAGATAATGAGTACTTCTACGTTGATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166326 GGTACAGGTGACCGGCTCCTCAGATAATGAGTACTTCTACGTTGATTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GAGAATATGAATATGATCTCAAATGGGAGTTTCCAAGAGAAAATTTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166376 GAGAATATGAATATGATCTCAAATGGGAGTTTCCAAGAGAAAATTTAGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTTG         GGAAGGTACTAGGATCAGGTGCTTTTGGAAAAGTGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166426 TTTGGTA...CAGGGAAGGTACTAGGATCAGGTGCTTTTGGAAAAGTGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GAACGCAACAGCTTATGGAATTAGCAAAACAGGAGTCTCAATCCAGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166557 GAACGCAACAGCTTATGGAATTAGCAAAACAGGAGTCTCAATCCAGGTTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCGTCAAAATGCTGAAAG         AAAAAGCAGACAGCTCTGAAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 166607 CCGTCAAAATGCTGAAAGGTA...CAGAAAAAGCAGACAGCTCTGAAAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GAGGCACTCATGTCAGAACTCAAGATGATGACCCAGCTGGGAAGCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172246 GAGGCACTCATGTCAGAACTCAAGATGATGACCCAGCTGGGAAGCCACGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GAATATTGTGAACCTGCTGGGGGCGTGCACACTGTCAG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 172296 GAATATTGTGAACCTGCTGGGGGCGTGCACACTGTCAGGTA...CAGGAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CAATTTACTTGATTTTTGAATACTGTTGCTATGGTGATCTTCTCAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173273 CAATTTACTTGATTTTTGAATACTGTTGCTATGGTGATCTTCTCAACTAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CTAAGAAGTAAAAGAGAAAAATTTCACAGGACTTGGACAGAGATTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173323 CTAAGAAGTAAAAGAGAAAAATTTCACAGGACTTGGACAGAGATTTTCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GGAACACAATTTCAGTTTTTACCCCACTTTCCAATCACATCCAAATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173373 GGAACACAATTTCAGTTTTTACCCCACTTTCCAATCACATCCAAATTCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 G         CATGCCTGGTTCAAGAGAAGTTCAGATACACCCGGACTCG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173423 GGTA...TAGCATGCCTGGTTCAAGAGAAGTTCAGATACACCCGGACTCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GATCAAATCTCAGGGCTTCATGGGAATTCATTTCACTCTGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 175608 GATCAAATCTCAGGGCTTCATGGGAATTCATTTCACTCTGAAGGTA...C

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2291   ATGAAATTGAATATGAAAACCAAAAAAGGCTGGAAGAAGAGGAGGACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177032 AGATGAAATTGAATATGAAAACCAAAAAAGGCTGGAAGAAGAGGAGGACT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TGAATGTGCTTACATTTGAAGATCTTCTTTGCTTTGCATATCAAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177082 TGAATGTGCTTACATTTGAAGATCTTCTTTGCTTTGCATATCAAGTTGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 AAAGGAATGGAATTTCTGGAATTTAAGTCG         TGTGTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 177132 AAAGGAATGGAATTTCTGGAATTTAAGTCGGTA...CAGTGTGTTCACAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 AGACCTGGCCGCCAGGAACGTGCTTGTCACCCACGGGAAAGTGGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181933 AGACCTGGCCGCCAGGAACGTGCTTGTCACCCACGGGAAAGTGGTGAAGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 TATGTGACTTTGGATTGGCTCGAGATATCATGAGTGATTCCAACTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181983 TATGTGACTTTGGATTGGCTCGAGATATCATGAGTGATTCCAACTATGTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GTCAGGGGCAAT         GCCCGTCTGCCTGTAAAATGGATGGCCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 182033 GTCAGGGGCAATGTG...CAGGCCCGTCTGCCTGTAAAATGGATGGCCCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 CGAAAGCCTGTTTGAAGGCATCTACACCATTAAGAGTGATGTCTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184839 CGAAAGCCTGTTTGAAGGCATCTACACCATTAAGAGTGATGTCTGGTCAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 ATGGAATATTACTGTGGGAAATCTTCTCACTTG         GTGTGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 184889 ATGGAATATTACTGTGGGAAATCTTCTCACTTGGTA...CAGGTGTGAAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 CCTTACCCTGGCATTCCGGTTGATGCTAACTTCTACAAACTGATTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185263 CCTTACCCTGGCATTCCGGTTGATGCTAACTTCTACAAACTGATTCAAAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 TGGATTTAAAATGGATCAGCCATTTTATGCTACAGAAGAAAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 185313 TGGATTTAAAATGGATCAGCCATTTTATGCTACAGAAGAAATGTA...CA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2754  ATACATTATAATGCAATCCTGCTGGGCTTTTGACTCAAGGAAACGGCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185953 GATACATTATAATGCAATCCTGCTGGGCTTTTGACTCAAGGAAACGGCCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2803 TCCTTCCCTAATTTGACTTCGTTTTTAGGATGTCAGCTGGCAGATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186003 TCCTTCCCTAATTTGACTTCGTTTTTAGGATGTCAGCTGGCAGATGCAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 AGAAGCG         ATGTATCAGAATGTGGATGGCCGTGTTTCGGAAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186053 AGAAGCGGTA...CAGATGTATCAGAATGTGGATGGCCGTGTTTCGGAAT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 GTCCTCACACCTACCAAAACAGGCGACCTTTCAGCAGAGAGATGGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196371 GTCCTCACACCTACCAAAACAGGCGACCTTTCAGCAGAGAGATGGATTTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .
   2944 GGGCTACTCTCTCCGCAGGCTCAGGTCGAAGATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196421 GGGCTACTCTCTCCGCAGGCTCAGGTCGAAGATTCG