seq1 = pF1KE2118.tfa, 2577 bp
seq2 = pF1KE2118/gi568815586r_53381185.tfa (gi568815586r:53381185_53587391), 206207 bp

>pF1KE2118 2577
>gi568815586r:53381185_53587391 (Chr12)

(complement)

1-137  (100001-100137)   100% ->
138-346  (100237-100445)   100% ->
347-530  (100770-100953)   100% ->
531-722  (101145-101336)   100% ->
723-881  (101917-102075)   100% ->
882-1040  (102178-102336)   100% ->
1041-1149  (103027-103135)   100% ->
1150-1259  (103372-103481)   100% ->
1260-1376  (103669-103785)   100% ->
1377-1514  (103906-104043)   100% ->
1515-2139  (104203-104827)   100% ->
2140-2210  (105023-105093)   100% ->
2211-2481  (105181-105451)   100% ->
2482-2577  (106112-106207)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTGCCTCCATGAGACCCGAACACCCTCTCCTTCCTTTGGGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTGCCTCCATGAGACCCGAACACCCTCTCCTTCCTTTGGGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGTCTACCCTAAGTGAGGCATCCATGCGCAAGCTGGACCCAGACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGTCTACCCTAAGTGAGGCATCCATGCGCAAGCTGGACCCAGACACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGACTGCACTCCCGAGAAGGACCTGACGCCTACCCA         TGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100101 CTGACTGCACTCCCGAGAAGGACCTGACGCCTACCCAGTG...CAGTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCAGCTACATGAGCAGGATGCAGGGGGCCCAGGGGGAGCAGCTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100241 CTGCAGCTACATGAGCAGGATGCAGGGGGCCCAGGGGGAGCAGCTGGGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCTGAGAGTCGGGCATCCAGAGTTCGAGCTGACGAGGTGCGACTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100291 ACCTGAGAGTCGGGCATCCAGAGTTCGAGCTGACGAGGTGCGACTGCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAGGGCCTCTTTGGCTGCCTGCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100341 GCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAGGGCCTCTTTGGCTGCCTGCGCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTCTGGACCATGATTGGCAAAGCCTACTCCACTGAGCACAAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100391 GTCTGGACCATGATTGGCAAAGCCTACTCCACTGAGCACAAGCAGCAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAAG         ACCTTTGGGAGGTCCCCTTTGAGGAAATCCTGGACC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100441 GGAAGGTA...CAGACCTTTGGGAGGTCCCCTTTGAGGAAATCCTGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCAGTGGGTGGGCTCAGGGGCCCAGGGTGCTGTCTTCCTGGGGCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100806 TGCAGTGGGTGGGCTCAGGGGCCCAGGGTGCTGTCTTCCTGGGGCGCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACGGGGAGGAGGTGGCTGTGAAGAAGGTGCGAGACCTCAAAGAAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 CACGGGGAGGAGGTGGCTGTGAAGAAGGTGCGAGACCTCAAAGAAACCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCAAGCACTTGCGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATCACTTTCAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100906 CATCAAGCACTTGCGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATCACTTTCAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531        GGGTGTGTGCACCCAGGCTCCCTGCTACTGCATCCTCATGGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100956 G...CAGGGGTGTGTGCACCCAGGCTCCCTGCTACTGCATCCTCATGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCTGCGCCCAGGGCCAGCTGTATGAGGTACTGCGGGCTGGCCGCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101188 TTCTGCGCCCAGGGCCAGCTGTATGAGGTACTGCGGGCTGGCCGCCCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACCCCCTCCTTACTGGTTGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101238 CACCCCCTCCTTACTGGTTGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGGGATCTCAAGTCACCCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101288 ACTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGGGATCTCAAGTCACCCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    723         CATGCTAATCACCTACGACGATGTGGTGAAGATCTCAGATTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101338 TG...CAGCATGCTAATCACCTACGACGATGTGGTGAAGATCTCAGATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGACAAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101959 TGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGACAAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGACAGTAGCCTGGATGGCCCCTGAGGTGATCCGCAATGAACCTGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102009 GGACAGTAGCCTGGATGGCCCCTGAGGTGATCCGCAATGAACCTGTGTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GAGAAGGTCGACATCTG         GTCCTTTGGCGTGGTGCTATGGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102059 GAGAAGGTCGACATCTGGTG...TAGGTCCTTTGGCGTGGTGCTATGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACTGCTGACTGGTGAGATCCCCTACAAAGACGTAGATTCCTCAGCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102202 ACTGCTGACTGGTGAGATCCCCTACAAAGACGTAGATTCCTCAGCCATTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCTGGGGTGTGGGAAGCAACAGTCTCCATCTGCCCGTGCCCTCCAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102252 TCTGGGGTGTGGGAAGCAACAGTCTCCATCTGCCCGTGCCCTCCAGTTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCAGATGGTTTCAAGATCCTGCTTCGCCAGTGCTG         GAATAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102302 CCAGATGGTTTCAAGATCCTGCTTCGCCAGTGCTGGTA...CAGGAATAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCCTGCTGCATCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103033 CAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCCTGCTGCATCTGGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TTGCCTCAGCTGATGTACTCTCCACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103083 TTGCCTCAGCTGATGTACTCTCCACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAG         GCAGAGTGGCGGGAAGAAGTAAAACTGCACTTTGAAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103133 CAGGTG...TAGGCAGAGTGGCGGGAAGAAGTAAAACTGCACTTTGAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GATTAAGTCAGAAGGGACCTGTCTGCACCGCCTAGAAGAGGAACTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103410 GATTAAGTCAGAAGGGACCTGTCTGCACCGCCTAGAAGAGGAACTGGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGAGGAGGAGGGAGGAGCTCAG         ACACGCCCTGGACATCAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103460 TGAGGAGGAGGGAGGAGCTCAGGTG...CAGACACGCCCTGGACATCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGCACTATGAAAGGAAGCTGGAGAGAGCCAACAACCTGTATATGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103688 GAGCACTATGAAAGGAAGCTGGAGAGAGCCAACAACCTGTATATGGAACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TAATGCCCTCATGTTGCAGCTGGAACTCAAGGAGAGGGAGCTGCTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103738 TAATGCCCTCATGTTGCAGCTGGAACTCAAGGAGAGGGAGCTGCTCAGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1377        GCGAGAGCAAGCTTTAGAGCGGAGGTGCCCAGGCCTGCTGAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103788 A...TAGGCGAGAGCAAGCTTTAGAGCGGAGGTGCCCAGGCCTGCTGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCACACCCTTCCCGGGGCCTCCTGCATGGAAACACAATGGAGAAGCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103949 CCACACCCTTCCCGGGGCCTCCTGCATGGAAACACAATGGAGAAGCTTAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CAAGAAGAGGAATGTGCCACAGAAGCTGTCACCCCATAGCAAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103999 CAAGAAGAGGAATGTGCCACAGAAGCTGTCACCCCATAGCAAAAGGTG..

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515     GCCAGATATCCTCAAGACGGAGTCTTTGCTCCCTAAACTAGATGCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104049 .CAGGCCAGATATCCTCAAGACGGAGTCTTTGCTCCCTAAACTAGATGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCCCTGAGTGGGGTGGGGCTTCCTGGGTGTCCTAAGGGCCCCCCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104249 GCCCTGAGTGGGGTGGGGCTTCCTGGGTGTCCTAAGGGCCCCCCCTCACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AGGACGGAGTCGCCGTGGCAAGACCCGTCACCGCAAGGCCAGCGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104299 AGGACGGAGTCGCCGTGGCAAGACCCGTCACCGCAAGGCCAGCGCCAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GGAGCTGTGGGGACCTGCCTGGGCTTCGTACAGCTGTGCCACCCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104349 GGAGCTGTGGGGACCTGCCTGGGCTTCGTACAGCTGTGCCACCCCATGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCTGGAGGACCAGGAAGCCCAGGGGGCCTAGGAGGGGGACCCTCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104399 CCTGGAGGACCAGGAAGCCCAGGGGGCCTAGGAGGGGGACCCTCAGCCTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GGAGGCCTGCCCTCCCGCCCTCCGTGGGCTTCATCATGACCTCCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104449 GGAGGCCTGCCCTCCCGCCCTCCGTGGGCTTCATCATGACCTCCTGCTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GCAAAATGTCTTCATCGTCCCCAGACCTGCTGTCAGCAGCACTAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104499 GCAAAATGTCTTCATCGTCCCCAGACCTGCTGTCAGCAGCACTAGGGTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CGGGGCCGGGGGGCCACAGGCGGAGCTGGGGATCCTGGCTCACCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104549 CGGGGCCGGGGGGCCACAGGCGGAGCTGGGGATCCTGGCTCACCACCTCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 GGCCCGGGGTGACACCCCACCAAGTGAGGGCTCAGCCCCTGGCTCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104599 GGCCCGGGGTGACACCCCACCAAGTGAGGGCTCAGCCCCTGGCTCCACCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 GCCCAGATTCACCTGGGGGAGCCAAAGGGGAACCACCTCCTCCAGTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104649 GCCCAGATTCACCTGGGGGAGCCAAAGGGGAACCACCTCCTCCAGTAGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 CCTGGTGAAGGTGTGGGGCTTCTGGGAACTGGAAGGGAAGGGACCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104699 CCTGGTGAAGGTGTGGGGCTTCTGGGAACTGGAAGGGAAGGGACCTCAGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 CCGGGGAGGAAGCCGGGCTGGGTCCCAGCACTTGACCCCAGCTGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104749 CCGGGGAGGAAGCCGGGCTGGGTCCCAGCACTTGACCCCAGCTGCACTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 TGTACAGGGCTGCCGTCACCCGAAGTCAG         AAACGTGGCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104799 TGTACAGGGCTGCCGTCACCCGAAGTCAGGTA...CAGAAACGTGGCATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 TCATCGGAAGAGGAGGAAGGAGAGGTAGACAGTGAAGTAGAGCTGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105035 TCATCGGAAGAGGAGGAAGGAGAGGTAGACAGTGAAGTAGAGCTGACATC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 AAGCCAGAG         GTGGCCTCAGAGCCTGAACATGCGCCAGTCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105085 AAGCCAGAGGTA...TAGGTGGCCTCAGAGCCTGAACATGCGCCAGTCAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 TATCTACCTTCAGCTCAGAGAATCCATCAGATGGGGAGGAAGGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105213 TATCTACCTTCAGCTCAGAGAATCCATCAGATGGGGAGGAAGGCACAGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 AGTGAACCTTCCCCCAGTGGCACACCTGAAGTTGGCAGCACCAACACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105263 AGTGAACCTTCCCCCAGTGGCACACCTGAAGTTGGCAGCACCAACACTGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 TGAGCGGCCAGATGAGCGGTCTGATGACATGTGCTCCCAGGGCTCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105313 TGAGCGGCCAGATGAGCGGTCTGATGACATGTGCTCCCAGGGCTCAGAAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 TCCCACTGGACCCACCTCCTTCAGAGGTCATCCCTGGCCCTGAACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105363 TCCCACTGGACCCACCTCCTTCAGAGGTCATCCCTGGCCCTGAACCCAGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 TCCCTGCCCATTCCACACCAGGAACTTCTCAGAGAGCGG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 105413 TCCCTGCCCATTCCACACCAGGAACTTCTCAGAGAGCGGGTG...CAGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 CCCTCCCAATTCTGAGGACTCAGACTGTGACAGCACTGAATTGGACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106114 CCCTCCCAATTCTGAGGACTCAGACTGTGACAGCACTGAATTGGACAACT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 CCAACAGCGTTGATGCCTTGCGGCCCCCAGCTTCCCTCCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106164 CCAACAGCGTTGATGCCTTGCGGCCCCCAGCTTCCCTCCCTCCA