seq1 = pF1KE2112.tfa, 2763 bp
seq2 = pF1KE2112/gi568815594r_121779739.tfa (gi568815594r:121779739_122051680), 271942 bp

>pF1KE2112 2763
>gi568815594r:121779739_122051680 (Chr4)

(complement)

1-215  (100001-100215)   100% ->
216-987  (118639-119410)   100% ->
988-1176  (126475-126663)   100% ->
1177-1341  (136737-136901)   100% ->
1342-1558  (139588-139804)   100% ->
1559-1792  (141294-141527)   100% ->
1793-2057  (144114-144378)   100% ->
2058-2253  (147164-147359)   100% ->
2254-2463  (148620-148829)   100% ->
2464-2547  (151986-152069)   100% ->
2548-2623  (169252-169327)   100% ->
2624-2763  (171803-171942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCACCAAGGTCAGGAAGTGCAAAGAACAAGCAAGGGTGACCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCACCAAGGTCAGGAAGTGCAAAGAACAAGCAAGGGTGACCTTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCCGGAGGAGGAGGAAGACGAGGGCGAGGACGAGGGCGCGGAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCCGGAGGAGGAGGAAGACGAGGGCGAGGACGAGGGCGCGGAGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCGCCGCCGCCGGGGCTGGAGGGGCGTCAACGGGGGGCTGGAGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCGCCGCCGCCGGGGCTGGAGGGGCGTCAACGGGGGGCTGGAGCCGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGCGCCCTCGCAGCGGGAGCCGCACGGCTACTGCCCGCCGCCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGGCGCCCTCGCAGCGGGAGCCGCACGGCTACTGCCCGCCGCCCTTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCACGGGCCGGACCT         GTCCATGGAGGGAAGCCCATCCCTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCACGGGCCGGACCTGTG...TAGGTCCATGGAGGGAAGCCCATCCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACGCATGACAGTGATGCGGGAGAAGGGCCGGCGCCAGGCTGTCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118665 GACGCATGACAGTGATGCGGGAGAAGGGCCGGCGCCAGGCTGTCAGGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCGGCCTTCATGTTCAATGACCGCGGCACCAGCCTCACCGCCGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118715 CCGGCCTTCATGTTCAATGACCGCGGCACCAGCCTCACCGCCGAGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCGCTTCCTCGACGCCGCCGAGTACGGCAACATCCCAGTGGTGCGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118765 GCGCTTCCTCGACGCCGCCGAGTACGGCAACATCCCAGTGGTGCGCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCTGGAGGAGTCCAAGACGCTGAACGTCAACTGCGTGGACTACATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118815 TGCTGGAGGAGTCCAAGACGCTGAACGTCAACTGCGTGGACTACATGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGAACGCGCTGCAGCTGGCTGTGGGCAACGAGCACCTGGAGGTGACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118865 CAGAACGCGCTGCAGCTGGCTGTGGGCAACGAGCACCTGGAGGTGACCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCTGCTGCTCAAGAAGGAGAACCTGGCGCGCATTGGCGACGCCCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118915 GCTGCTGCTCAAGAAGGAGAACCTGGCGCGCATTGGCGACGCCCTGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCGCCATCAGCAAGGGCTACGTGCGCATCGTAGAGGCCATCCTCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118965 TCGCCATCAGCAAGGGCTACGTGCGCATCGTAGAGGCCATCCTCAACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCTGGCTTCGCGGCCAGCAAGCGTCTCACTCTGAGCCCCTGTGAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119015 CCTGGCTTCGCGGCCAGCAAGCGTCTCACTCTGAGCCCCTGTGAGCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGCAGGACGACGACTTCTACGCTTACGACGAGGACGGCACGCGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119065 GCTGCAGGACGACGACTTCTACGCTTACGACGAGGACGGCACGCGCTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGCCGGACATCACCCCCATCATCCTGGCGGCGCACTGCCAGAAATACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119115 CGCCGGACATCACCCCCATCATCCTGGCGGCGCACTGCCAGAAATACGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTGGTGCACATGCTGCTGATGAAGGGTGCCAGGATCGAGCGGCCGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119165 GTGGTGCACATGCTGCTGATGAAGGGTGCCAGGATCGAGCGGCCGCACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CTATTTCTGCAAGTGCGGGGACTGCATGGAGAAGCAGAGGCACGACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119215 CTATTTCTGCAAGTGCGGGGACTGCATGGAGAAGCAGAGGCACGACTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCAGCCACTCACGCTCGAGGATCAATGCCTACAAGGGGCTGGCCAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119265 TCAGCCACTCACGCTCGAGGATCAATGCCTACAAGGGGCTGGCCAGCCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCTTACCTCTCATTGTCCAGCGAGGACCCGGTGCTTACGGCCCTAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119315 GCTTACCTCTCATTGTCCAGCGAGGACCCGGTGCTTACGGCCCTAGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAGCAACGAGCTGGCCAAGCTGGCCAACATAGAGAAGGAGTTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 119365 CAGCAACGAGCTGGCCAAGCTGGCCAACATAGAGAAGGAGTTCAAGGTA.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988      AATGACTATCGGAAGCTCTCCATGCAATGCAAAGACTTTGTAGTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119415 ..TAGAATGACTATCGGAAGCTCTCCATGCAATGCAAAGACTTTGTAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GGTGTGCTGGATCTCTGCCGAGACTCAGAAGAGGTAGAAGCCATTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126520 GGTGTGCTGGATCTCTGCCGAGACTCAGAAGAGGTAGAAGCCATTCTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGGAGATCTGGAATCAGCAGAGCCTCTGGAGGTACACAGGCACAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126570 TGGAGATCTGGAATCAGCAGAGCCTCTGGAGGTACACAGGCACAAAGCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CATTAAGTCGTGTCAAACTTGCCATTAAGTATGAAGTCAAAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 126620 CATTAAGTCGTGTCAAACTTGCCATTAAGTATGAAGTCAAAAAGGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1177    TTTGTGGCTCATCCCAACTGCCAGCAGCAGCTCTTGACGATCTGGTA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136734 TAGTTTGTGGCTCATCCCAACTGCCAGCAGCAGCTCTTGACGATCTGGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGAGAACCTCTCAGGCCTAAGGGAGCAGACCATAGCTATCAAGTGTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136784 TGAGAACCTCTCAGGCCTAAGGGAGCAGACCATAGCTATCAAGTGTCTCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TTGTGCTGGTCGTGGCCCTGGGCCTTCCATTCCTGGCCATTGGCTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136834 TTGTGCTGGTCGTGGCCCTGGGCCTTCCATTCCTGGCCATTGGCTACTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ATCGCACCTTGCAGCAGG         CTGGGGAAAATTCTGCGAAGCCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 136884 ATCGCACCTTGCAGCAGGGTA...CAGCTGGGGAAAATTCTGCGAAGCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TTTTATGAAGTTTGTAGCACATGCAGCTTCTTTCATCATCTTCCTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139611 TTTTATGAAGTTTGTAGCACATGCAGCTTCTTTCATCATCTTCCTGGGTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 TGCTTGTGTTCAATGCCTCAGACAGGTTCGAAGGCATCACCACGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139661 TGCTTGTGTTCAATGCCTCAGACAGGTTCGAAGGCATCACCACGCTGCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 AATATCACAGTTACTGACTATCCCAAACAGATCTTCAGGGTGAAAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139711 AATATCACAGTTACTGACTATCCCAAACAGATCTTCAGGGTGAAAACCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CCAGTTTACATGGACTGAAATGCTAATTATGGTCTGGGTTCTTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 139761 CCAGTTTACATGGACTGAAATGCTAATTATGGTCTGGGTTCTTGGTA...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1559    GAATGATGTGGTCTGAATGTAAAGAGCTCTGGCTGGAAGGACCTAGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141291 CAGGAATGATGTGGTCTGAATGTAAAGAGCTCTGGCTGGAAGGACCTAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GAATACATTTTGCAGTTGTGGAATGTGCTTGACTTTGGGATGCTGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141341 GAATACATTTTGCAGTTGTGGAATGTGCTTGACTTTGGGATGCTGTCCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CTTCATTGCTGCTTTCACAGCCAGATTCCTAGCTTTCCTTCAGGCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141391 CTTCATTGCTGCTTTCACAGCCAGATTCCTAGCTTTCCTTCAGGCAACGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AGGCACAACAGTATGTGGACAGTTACGTCCAAGAGAGTGACCTCAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141441 AGGCACAACAGTATGTGGACAGTTACGTCCAAGAGAGTGACCTCAGTGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GTGACACTCCCACCAGAGATACAGTATTTCACTTATG         CTAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 141491 GTGACACTCCCACCAGAGATACAGTATTTCACTTATGGTA...TAGCTAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 AGATAAATGGCTCCCTTCTGACCCTCAGATTATATCTGAAGGCCTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144118 AGATAAATGGCTCCCTTCTGACCCTCAGATTATATCTGAAGGCCTTTATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 CCATAGCTGTTGTGCTCAGCTTCTCTCGGATTGCGTACATCCTCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144168 CCATAGCTGTTGTGCTCAGCTTCTCTCGGATTGCGTACATCCTCCCTGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 AATGAGAGCTTTGGCCCCCTGCAGATCTCTCTTGGAAGGACTGTAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144218 AATGAGAGCTTTGGCCCCCTGCAGATCTCTCTTGGAAGGACTGTAAAGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 CATATTCAAGTTCATGGTCCTCTTTATTATGGTGTTTTTTGCCTTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144268 CATATTCAAGTTCATGGTCCTCTTTATTATGGTGTTTTTTGCCTTTATGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 TTGGCATGTTCATACTTTATTCTTACTACCTTGGGGCTAAAGTTAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144318 TTGGCATGTTCATACTTTATTCTTACTACCTTGGGGCTAAAGTTAATGCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GCTTTTACCAC         TGTAGAAGAAAGTTTCAAGACTTTATTTTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 144368 GCTTTTACCACGTA...CAGTGTAGAAGAAAGTTTCAAGACTTTATTTTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 GTCAATATTTGGGTTGTCTGAAGTGACTTCCGTTGTGCTCAAATATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147194 GTCAATATTTGGGTTGTCTGAAGTGACTTCCGTTGTGCTCAAATATGATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 ACAAATTCATAGAAAATATTGGATACGTTCTTTATGGAATATACAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147244 ACAAATTCATAGAAAATATTGGATACGTTCTTTATGGAATATACAATGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 ACTATGGTGGTCGTTTTACTCAACATGCTAATTGCTATGATTAATAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147294 ACTATGGTGGTCGTTTTACTCAACATGCTAATTGCTATGATTAATAGCTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 ATATCAAGAAATTGAG         GATGACAGTGATGTAGAATGGAAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 147344 ATATCAAGAAATTGAGGTA...CAGGATGACAGTGATGTAGAATGGAAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 TTGCTCGTTCAAAACTTTGGTTATCCTATTTTGATGATGGAAAAACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148645 TTGCTCGTTCAAAACTTTGGTTATCCTATTTTGATGATGGAAAAACATTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CCTCCACCTTTCAGTCTAGTTCCTAGTCCAAAATCATTTGTTTATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148695 CCTCCACCTTTCAGTCTAGTTCCTAGTCCAAAATCATTTGTTTATTTCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 CATGCGAATTGTTAACTTTCCCAAATGCAGAAGGAGAAGGCTTCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148745 CATGCGAATTGTTAACTTTCCCAAATGCAGAAGGAGAAGGCTTCAGAAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 ATATAGAAATGGGAATGGGTAACTCAAAGTCCAGG         TTAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 148795 ATATAGAAATGGGAATGGGTAACTCAAAGTCCAGGGTA...TAGTTAAAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 CTCTTCACTCAGTCTAACTCAAGAGTTTTTGAATCACACAGTTTTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151992 CTCTTCACTCAGTCTAACTCAAGAGTTTTTGAATCACACAGTTTTAACAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 CATTCTCAATCAGCCAACACGTTATCAG         CAGATAATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 152042 CATTCTCAATCAGCCAACACGTTATCAGGTA...CAGCAGATAATGAAAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2561 GACTTATAAAGCGGTATGTTTTGAAAGCACAAGTAGACAAAGAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169265 GACTTATAAAGCGGTATGTTTTGAAAGCACAAGTAGACAAAGAAAATGAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611 GAAGTTAATGAAG         GTGAATTAAAAGAAATCAAGCAAGATAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 169315 GAAGTTAATGAAGGTA...TAGGTGAATTAAAAGAAATCAAGCAAGATAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 CTCCAGCCTTCGTTATGAACTTTTGGAAGACAAGAGCCAAGCAACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171831 CTCCAGCCTTCGTTATGAACTTTTGGAAGACAAGAGCCAAGCAACTGAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 AATTAGCCATTCTAATTCATAAACTTAGTGAGAAACTGAATCCCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171881 AATTAGCCATTCTAATTCATAAACTTAGTGAGAAACTGAATCCCAGCATG

   2850     .    :
   2752 CTGAGATGTGAA
        ||||||||||||
 171931 CTGAGATGTGAA