Result of SIM4 for
pF1KE2103
seq1 = pF1KE2103.tfa, 2766 bp
seq2 = pF1KE2103/gi568815595f_6761389.tfa (gi568815595f:6761389_7786424), 1025036 bp
>pF1KE2103 2766
>gi568815595f:6761389_7786424 (Chr3)
1-519 (100001-100519) 100% ->
520-736 (385064-385280) 100% ->
737-878 (537296-537437) 100% ->
879-1033 (545110-545264) 100% ->
1034-1174 (653635-653775) 100% ->
1175-1375 (691219-691419) 100% ->
1376-1515 (700195-700334) 100% ->
1516-2451 (817034-817969) 99% ->
2452-2698 (918661-918907) 100% ->
2699-2766 (924969-925036) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTCCAGCTGAGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGACTTTGATGAAGTTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGTCCAGCTGAGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGACTTTGATGAAGTTCCC
50 . : . : . : . : . :
51 CTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCTGTGCGCGCTGGCGGCGGCGGCGCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCTGTGCGCGCTGGCGGCGGCGGCGCGCG
100 . : . : . : . : . :
101 GCCAGGAGATGTACGCCCCGCACTCAATCCGGATCGAGGGGGACGTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GCCAGGAGATGTACGCCCCGCACTCAATCCGGATCGAGGGGGACGTCACC
150 . : . : . : . : . :
151 CTCGGGGGGCTGTTCCCCGTGCACGCCAAGGGTCCCAGCGGAGTGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CTCGGGGGGCTGTTCCCCGTGCACGCCAAGGGTCCCAGCGGAGTGCCCTG
200 . : . : . : . : . :
201 CGGCGACATCAAGAGGGAAAACGGGATCCACAGGCTGGAAGCGATGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CGGCGACATCAAGAGGGAAAACGGGATCCACAGGCTGGAAGCGATGCTCT
250 . : . : . : . : . :
251 ACGCCCTGGACCAGATCAACAGTGATCCCAACCTACTGCCCAACGTGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 ACGCCCTGGACCAGATCAACAGTGATCCCAACCTACTGCCCAACGTGACG
300 . : . : . : . : . :
301 CTGGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCAGGGACACTTACGCGCTCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CTGGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCAGGGACACTTACGCGCTCGA
350 . : . : . : . : . :
351 ACAGTCGCTTACTTTCGTCCAGGCGCTCATCCAGAAGGACACCTCCGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 ACAGTCGCTTACTTTCGTCCAGGCGCTCATCCAGAAGGACACCTCCGACG
400 . : . : . : . : . :
401 TGCGCTGCACCAACGGCGAACCGCCGGTTTTCGTCAAGCCGGAGAAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 TGCGCTGCACCAACGGCGAACCGCCGGTTTTCGTCAAGCCGGAGAAAGTA
450 . : . : . : . : . :
451 GTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGTTCGGTCTCCATCATGGTAGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGTTCGGTCTCCATCATGGTAGCCAA
500 . : . : . : . : . :
501 CATCCTGAGGCTCTTCCAG ATCCCCCAGATTAGTTATGCAT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
100501 CATCCTGAGGCTCTTCCAGGTA...CAGATCCCCCAGATTAGTTATGCAT
550 . : . : . : . : . :
542 CAACGGCACCCGAGCTAAGTGATGACCGGCGCTATGACTTCTTCTCTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385086 CAACGGCACCCGAGCTAAGTGATGACCGGCGCTATGACTTCTTCTCTCGC
600 . : . : . : . : . :
592 GTGGTGCCACCCGATTCCTTCCAAGCCCAGGCCATGGTAGACATTGTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385136 GTGGTGCCACCCGATTCCTTCCAAGCCCAGGCCATGGTAGACATTGTAAA
650 . : . : . : . : . :
642 GGCCCTAGGCTGGAATTATGTGTCTACCCTCGCATCGGAAGGAAGTTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385186 GGCCCTAGGCTGGAATTATGTGTCTACCCTCGCATCGGAAGGAAGTTATG
700 . : . : . : . : . :
692 GAGAGAAAGGTGTGGAGTCCTTCACGCAGATTTCCAAAGAGGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
385236 GAGAGAAAGGTGTGGAGTCCTTCACGCAGATTTCCAAAGAGGCAGGTA..
750 . : . : . : . : . :
737 GTGGACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATCCCCCAGGAACGCAA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385286 .CAGGTGGACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATCCCCCAGGAACGCAA
800 . : . : . : . : . :
783 AGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCAAACAGCTCCTGGACACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
537342 AGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCAAACAGCTCCTGGACACCC
850 . : . : . : . : . :
833 CCAACTCCAGGGCCGTCGTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
537392 CCAACTCCAGGGCCGTCGTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAAGTA.
900 . : . : . : . : . :
879 GCAGATCCTTGCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTTGGCCATTT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
537442 ..CAGGCAGATCCTTGCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTTGGCCATTT
950 . : . : . : . : . :
924 TCTTTGGGTGGGATCAGACAGCTGGGGATCCAAAATAAACCCACTGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
545155 TCTTTGGGTGGGATCAGACAGCTGGGGATCCAAAATAAACCCACTGCACC
1000 . : . : . : . : . :
974 AGCATGAAGATATCGCAGAAGGGGCCATCACCATTCAGCCCAAGCGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
545205 AGCATGAAGATATCGCAGAAGGGGCCATCACCATTCAGCCCAAGCGAGCC
1050 . : . : . : . : . :
1024 ACGGTGGAAG GGTTTGATGCCTACTTTACGTCCCGTACACT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
545255 ACGGTGGAAGGTA...TAGGGTTTGATGCCTACTTTACGTCCCGTACACT
1100 . : . : . : . : . :
1065 TGAAAACAACAGAAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAGGAAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
653666 TGAAAACAACAGAAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAGGAAAACT
1150 . : . : . : . : . :
1115 TCAACTGCAAGTTGACGATTAGTGGGTCAAAAAAAGAAGACACAGATCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
653716 TCAACTGCAAGTTGACGATTAGTGGGTCAAAAAAAGAAGACACAGATCGC
1200 . : . : . : . : . :
1165 AAATGCACAG GACAGGAGAGAATTGGAAAAGATTCCAACTA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
653766 AAATGCACAGGTA...CAGGACAGGAGAGAATTGGAAAAGATTCCAACTA
1250 . : . : . : . : . :
1206 TGAGCAGGAGGGTAAAGTCCAGTTCGTGATTGACGCAGTCTATGCTATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
691250 TGAGCAGGAGGGTAAAGTCCAGTTCGTGATTGACGCAGTCTATGCTATGG
1300 . : . : . : . : . :
1256 CTCACGCCCTTCACCACATGAACAAGGATCTCTGTGCTGACTACCGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
691300 CTCACGCCCTTCACCACATGAACAAGGATCTCTGTGCTGACTACCGGGGT
1350 . : . : . : . : . :
1306 GTCTGCCCAGAGATGGAGCAAGCTGGAGGCAAGAAGTTGCTGAAGTATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
691350 GTCTGCCCAGAGATGGAGCAAGCTGGAGGCAAGAAGTTGCTGAAGTATAT
1400 . : . : . : . : . :
1356 ACGCAATGTTAATTTCAATG GTAGTGCTGGCACTCCAGTGA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
691400 ACGCAATGTTAATTTCAATGGTG...TAGGTAGTGCTGGCACTCCAGTGA
1450 . : . : . : . : . :
1397 TGTTTAACAAGAACGGGGATGCACCTGGGCGTTATGACATCTTTCAGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
700216 TGTTTAACAAGAACGGGGATGCACCTGGGCGTTATGACATCTTTCAGTAC
1500 . : . : . : . : . :
1447 CAGACCACAAACACCAGCAACCCGGGTTACCGTCTGATCGGGCAGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
700266 CAGACCACAAACACCAGCAACCCGGGTTACCGTCTGATCGGGCAGTGGAC
1550 . : . : . : . : . :
1497 AGACGAACTTCAGCTCAAT ATAGAAGACATGCAGTGGGGTA
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
700316 AGACGAACTTCAGCTCAATGTG...CAGATAGAAGACATGCAGTGGGGTA
1600 . : . : . : . : . :
1538 AAGGAGTCCGAGAGATACCCGCCTCAGTGTGCACACTACCATGTAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817056 AAGGAGTCCGAGAGATACCCGCCTCAGTGTGCACACTACCATGTAAGCCA
1650 . : . : . : . : . :
1588 GGACAGAGAAAGAAGACACAGAAAGGAACTCCTTGCTGTTGGACCTGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817106 GGACAGAGAAAGAAGACACAGAAAGGAACTCCTTGCTGTTGGACCTGTGA
1700 . : . : . : . : . :
1638 GCCTTGCGATGGTTACCAGTACCAGTTTGATGAGATGACATGCCAGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817156 GCCTTGCGATGGTTACCAGTACCAGTTTGATGAGATGACATGCCAGCATT
1750 . : . : . : . : . :
1688 GCCCCTATGACCAGAGGCCCAATGAAAATCGAACCGGATGCCAGGATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817206 GCCCCTATGACCAGAGGCCCAATGAAAATCGAACCGGATGCCAGGATATT
1800 . : . : . : . : . :
1738 CCCATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTGATTCCTGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817256 CCCATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTGATTCCTGTCTT
1850 . : . : . : . : . :
1788 CCTGGCAATGTTGGGGATCATTGCCACCATCTTTGTCATGGCCACTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817306 CCTGGCAATGTTGGGGATCATTGCCACCATCTTTGTCATGGCCACTTTCA
1900 . : . : . : . : . :
1838 TCCGCTACAATGACACGCCCATTGTCCGGGCATCTGGGCGGGAACTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817356 TCCGCTACAATGACACGCCCATTGTCCGGGCATCTGGGCGGGAACTCAGC
1950 . : . : . : . : . :
1888 TATGTTCTTTTGACGGGCATCTTTCTTTGCTACATCATCACTTTCCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817406 TATGTTCTTTTGACGGGCATCTTTCTTTGCTACATCATCACTTTCCTGAT
2000 . : . : . : . : . :
1938 GATTGCCAAACCAGATGTGGCAGTGTGTTCTTTCCGGCGAGTTTTCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817456 GATTGCCAAACCAGATGTGGCAGTGTGTTCTTTCCGGCGAGTTTTCTTGG
2050 . : . : . : . : . :
1988 GCTTGGGTATGTGCATCAGTTATGCAGCCCTCTTGACGAAAACAAATCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817506 GCTTGGGTATGTGCATCAGTTATGCAGCCCTCTTGACGAAAACAAATCGG
2100 . : . : . : . : . :
2038 ATTTATCGCATATTTGAGCAGGGCAAGAAATCAGTAACAGCTCCCAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817556 ATTTATCGCATATTTGAGCAGGGCAAGAAATCAGTAACAGCTCCCAGACT
2150 . : . : . : . : . :
2088 CATAAGCCCAACATCACAACTGGCAATCACTTCCAGTTTAATATCAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817606 CATAAGCCCAACATCACAACTGGCAATCACTTCCAGTTTAATATCAGTTC
2200 . : . : . : . : . :
2138 AGCTTCTAGGGGTGTTCATTTGGTTTGGTGTTGATCCACCCAACATCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817656 AGCTTCTAGGGGTGTTCATTTGGTTTGGTGTTGATCCACCCAACATCATC
2250 . : . : . : . : . :
2188 ATAGACTACGATGAACACAAGACAATGAACCCTGAGCAAGCCAGAGGGGT
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817706 ATAGACTATGATGAACACAAGACAATGAACCCTGAGCAAGCCAGAGGGGT
2300 . : . : . : . : . :
2238 TCTCAAGTGTGACATTACAGATCTCCAAATCATTTGCTCCTTGGGATATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817756 TCTCAAGTGTGACATTACAGATCTCCAAATCATTTGCTCCTTGGGATATA
2350 . : . : . : . : . :
2288 GCATTCTTCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGACTCGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817806 GCATTCTTCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGACTCGGGGT
2400 . : . : . : . : . :
2338 GTACCCGAGAATTTTAACGAAGCCAAGCCCATTGGATTCACTATGTACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817856 GTACCCGAGAATTTTAACGAAGCCAAGCCCATTGGATTCACTATGTACAC
2450 . : . : . : . : . :
2388 GACATGTATAGTATGGCTTGCCTTCATTCCAATTTTTTTTGGCACCGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817906 GACATGTATAGTATGGCTTGCCTTCATTCCAATTTTTTTTGGCACCGCTC
2500 . : . : . : . : . :
2438 AATCAGCGGAAAAG CTCTACATACAAACTACCACGCTTACA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
817956 AATCAGCGGAAAAGGTA...TAGCTCTACATACAAACTACCACGCTTACA
2550 . : . : . : . : . :
2479 ATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGATGCTATACATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918688 ATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGATGCTATACATGCC
2600 . : . : . : . : . :
2529 GAAAGTGTACATCATCATTTTCCACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918738 GAAAGTGTACATCATCATTTTCCACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGA
2650 . : . : . : . : . :
2579 AGCGAAGCTTCAAGGCGGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918788 AGCGAAGCTTCAAGGCGGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGGCTG
2700 . : . : . : . : . :
2629 TCACACAAACCCAGTGACAGACCCAACGGTGAGGCAAAGACCGAGCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
918838 TCACACAAACCCAGTGACAGACCCAACGGTGAGGCAAAGACCGAGCTCTG
2750 . : . : . : . : . :
2679 TGAAAACGTAGACCCAAACA ACTGTATACCACCAGTAAGAA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
918888 TGAAAACGTAGACCCAAACAGTA...TAGACTGTATACCACCAGTAAGAA
2800 . : . : . : . : .
2720 AGAGTGTACAAAAGTCTGTTACTTGGTACACTATCCCACCAACAGTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
924990 AGAGTGTACAAAAGTCTGTTACTTGGTACACTATCCCACCAACAGTA