seq1 = pF1KE2076.tfa, 2235 bp
seq2 = pF1KE2076/gi568815588r_100090869.tfa (gi568815588r:100090869_100326018), 235150 bp

>pF1KE2076 2235
>gi568815588r:100090869_100326018 (Chr10)

(complement)

1-105  (96487-96591)   100% ->
106-200  (100002-100096)   100% ->
201-315  (103039-103153)   100% ->
316-385  (103838-103907)   100% ->
386-474  (105343-105431)   100% ->
475-564  (106660-106749)   98% ->
565-689  (106887-107011)   100% ->
690-797  (107194-107301)   100% ->
798-933  (107889-108024)   99% ->
934-1128  (116230-116424)   100% ->
1129-1231  (118687-118789)   100% ->
1232-1355  (120820-120943)   100% ->
1356-1507  (121362-121513)   100% ->
1508-1569  (123870-123931)   100% ->
1570-1679  (125239-125348)   100% ->
1680-1729  (125999-126048)   100% ->
1730-1826  (131498-131594)   100% ->
1827-1974  (131888-132035)   100% ->
1975-2108  (132588-132721)   100% ->
2109-2208  (135051-135150)   100% ->
2209-2235  (136392-136418)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGCCCCCGGGGCTGCGGCCGGGCGCGGGCGGGCCCTGGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96487 ATGGAGCGGCCCCCGGGGCTGCGGCCGGGCGCGGGCGGGCCCTGGGAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGGAGCGGCTGGGCACCGGCGGCTTCGGGAACGTCTGTCTGTACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96537 GCGGGAGCGGCTGGGCACCGGCGGCTTCGGGAACGTCTGTCTGTACCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCGG         GAACTTGATCTCAAAATAGCAATTAAGTCTTGTCGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96587 ATCGGGTG...CAGGAACTTGATCTCAAAATAGCAATTAAGTCTTGTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTAGAGCTAAGTACCAAAAACAGAGAACGATGGTGCCATGAAATCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100038 CTAGAGCTAAGTACCAAAAACAGAGAACGATGGTGCCATGAAATCCAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATGAAGAA         GTTGAACCATGCCAATGTTGTAAAGGCCTGTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100088 TATGAAGAAGTA...TAGGTTGAACCATGCCAATGTTGTAAAGGCCTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTTCCTGAAGAATTGAATATTTTGATTCATGATGTGCCTCTTCTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103071 ATGTTCCTGAAGAATTGAATATTTTGATTCATGATGTGCCTCTTCTAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGGAATACTGTTCTGGAGGAGATCTCCGAAAG         CTGCTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103121 ATGGAATACTGTTCTGGAGGAGATCTCCGAAAGGTA...TAGCTGCTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAACCAGAAAATTGTTGTGGACTTAAAGAAAGCCAGATACTTTCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103846 CAAACCAGAAAATTGTTGTGGACTTAAAGAAAGCCAGATACTTTCTTTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAAGTGATATAG         GGTCTGGGATTCGATATTTGCATGAAAAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103896 TAAGTGATATAGGTA...TAGGGTCTGGGATTCGATATTTGCATGAAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAATTATACATCGAGATCTAAAACCTGAAAACATAGTTCTTCAGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105372 AAAATTATACATCGAGATCTAAAACCTGAAAACATAGTTCTTCAGGATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGTGGAAAG         ATAATACATAAAATAATTGATCTGGGATATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105422 TGGTGGAAAGGTA...CAGATAATACATAAAATAATTGATCTGGGATATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCAAAGATGTTGATCAAGGAAGTCTGTGTACATCTTTTGTAGGAACACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 106691 CCAAAGATGTTGATCAAGGAAGTCTGTGTACATCTTTTGTGGGAACACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAGTATCTG         GCCCCAGAGCTCTTTGAGAATAAGCCTTACAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106741 CAGTATCTGGTG...AAGGCCCCAGAGCTCTTTGAGAATAAGCCTTACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGCCACTGTTGATTATTGGAGCTTTGGGACCATGGTATTTGAATGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106919 AGCCACTGTTGATTATTGGAGCTTTGGGACCATGGTATTTGAATGTATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGGATATAGGCCTTTTTTGCATCATCTGCAGCCATTTACCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106969 CTGGATATAGGCCTTTTTTGCATCATCTGCAGCCATTTACCTGGTA...T

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    690   GCATGAGAAGATTAAGAAGAAGGATCCAAAGTGTATATTTGCATGTGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107192 AGGCATGAGAAGATTAAGAAGAAGGATCCAAAGTGTATATTTGCATGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGAGATGTCAGGAGAAGTTCGGTTTAGTAGCCATTTACCTCAACCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107242 AGAGATGTCAGGAGAAGTTCGGTTTAGTAGCCATTTACCTCAACCAAATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GCCTTTGTAG         TTTAATAGTAGAACCCATGGAAAACTGGCTA
        ||||||||||>>>...>>>|||| ||||||||||||||||||||||||||
 107292 GCCTTTGTAGGTA...TAGTTTAGTAGTAGAACCCATGGAAAACTGGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CAGTTGATGTTGAATTGGGACCCTCAGCAGAGAGGAGGACCTGTTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107920 CAGTTGATGTTGAATTGGGACCCTCAGCAGAGAGGAGGACCTGTTGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TACTTTGAAGCAGCCAAGATGTTTTGTATTAATGGATCACATTTTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107970 TACTTTGAAGCAGCCAAGATGTTTTGTATTAATGGATCACATTTTGAATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGAAG         ATAGTACACATCCTAAATATGACTTCTGCAAAGATA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108020 TGAAGGTT...CAGATAGTACACATCCTAAATATGACTTCTGCAAAGATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ATTTCTTTTCTGTTACCACCTGATGAAAGTCTTCATTCACTACAGTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116266 ATTTCTTTTCTGTTACCACCTGATGAAAGTCTTCATTCACTACAGTCTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TATTGAGCGTGAAACTGGAATAAATACTGGTTCTCAAGAACTTCTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116316 TATTGAGCGTGAAACTGGAATAAATACTGGTTCTCAAGAACTTCTTTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGACAGGAATTTCTCTGGATCCTCGGAAACCAGCCTCTCAATGTGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116366 AGACAGGAATTTCTCTGGATCCTCGGAAACCAGCCTCTCAATGTGTTCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GATGGAGTT         AGAGGCTGTGATAGCTATATGGTTTATTTGTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116416 GATGGAGTTGTA...CAGAGAGGCTGTGATAGCTATATGGTTTATTTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGATAAAAGTAAAACTGTATATGAAGGGCCATTTGCTTCCAGAAGTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118719 TGATAAAAGTAAAACTGTATATGAAGGGCCATTTGCTTCCAGAAGTTTAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTGATTGTGTAAATTATATTG         TACAGGACAGCAAAATACAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 118769 CTGATTGTGTAAATTATATTGGTA...TAGTACAGGACAGCAAAATACAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CTTCCAATTATACAGCTGCGTAAAGTGTGGGCTGAAGCAGTGCACTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120840 CTTCCAATTATACAGCTGCGTAAAGTGTGGGCTGAAGCAGTGCACTATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GTCTGGACTAAAAGAAGACTATAGCAGGCTCTTTCAGGGACAAAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120890 GTCTGGACTAAAAGAAGACTATAGCAGGCTCTTTCAGGGACAAAGGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CAAT         GTTAAGTCTTCTTAGATATAATGCTAACTTAACAAAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120940 CAATGTA...TAGGTTAAGTCTTCTTAGATATAATGCTAACTTAACAAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATGAAGAACACTTTGATCTCAGCATCACAACAACTGAAAGCTAAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121399 ATGAAGAACACTTTGATCTCAGCATCACAACAACTGAAAGCTAAATTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GTTTTTTCACAAAAGCATTCAGCTTGACTTGGAGAGATACAGCGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121449 GTTTTTTCACAAAAGCATTCAGCTTGACTTGGAGAGATACAGCGAGCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGACGTATGGGATAT         CTTCAGAAAAAATGCTAAAAGCATGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 121499 TGACGTATGGGATATGTA...TAGCTTCAGAAAAAATGCTAAAAGCATGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAAGAAATGGAAGAAAAGGCCATCCACTATGCTGAG         GTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123896 AAAGAAATGGAAGAAAAGGCCATCCACTATGCTGAGGTA...TAGGTTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGTCATTGGATACCTGGAGGATCAGATTATGTCTTTGCATGCTGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125244 TGTCATTGGATACCTGGAGGATCAGATTATGTCTTTGCATGCTGAAATCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGGAGCTACAGAAGAGCCCCTATGGAAGACGTCAGGGAGACTTGATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125294 TGGAGCTACAGAAGAGCCCCTATGGAAGACGTCAGGGAGACTTGATGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TCTCT         GGAACAGCGTGCCATTGATCTATATAAGCAGTTAAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125344 TCTCTGTA...TAGGGAACAGCGTGCCATTGATCTATATAAGCAGTTAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 ACACAGACCTTCAG         ATCACTCCTACAGTGACAGCACAGAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 126035 ACACAGACCTTCAGGTA...TAGATCACTCCTACAGTGACAGCACAGAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TGGTGAAAATCATTGTGCACACTGTGCAGAGTCAGGACCGTGTGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131525 TGGTGAAAATCATTGTGCACACTGTGCAGAGTCAGGACCGTGTGCTCAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 GAGCTGTTTGGTCATTTGAG         CAAGTTGTTGGGCTGTAAGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 131575 GAGCTGTTTGGTCATTTGAGGTA...CAGCAAGTTGTTGGGCTGTAAGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 GAAGATTATTGATCTACTCCCTAAGGTGGAAGTGGCCCTCAGTAATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131909 GAAGATTATTGATCTACTCCCTAAGGTGGAAGTGGCCCTCAGTAATATCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 AAGAAGCTGACAATACTGTCATGTTCATGCAGGGAAAAAGGCAGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131959 AAGAAGCTGACAATACTGTCATGTTCATGCAGGGAAAAAGGCAGAAAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 ATATGGCATCTCCTTAAAATTGCCTGT         ACACAGAGTTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 132009 ATATGGCATCTCCTTAAAATTGCCTGTGTA...CAGACACAGAGTTCTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 CCGGTCCCTTGTAGGATCCAGTCTAGAAGGTGCAGTAACCCCTCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132602 CCGGTCCCTTGTAGGATCCAGTCTAGAAGGTGCAGTAACCCCTCAGACAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 CAGCATGGCTGCCCCCGACTTCAGCAGAACATGATCATTCTCTGTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132652 CAGCATGGCTGCCCCCGACTTCAGCAGAACATGATCATTCTCTGTCATGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GTGGTAACTCCTCAAGATGG         GGAGACTTCAGCACAAATGAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 132702 GTGGTAACTCCTCAAGATGGGTG...CAGGGAGACTTCAGCACAAATGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 AGAAGAAAATTTGAACTGCCTTGGCCATTTAAGCACTATTATTCATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135072 AGAAGAAAATTTGAACTGCCTTGGCCATTTAAGCACTATTATTCATGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 CAAATGAGGAACAGGGCAATAGTATGATG         AATCTTGATTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 135122 CAAATGAGGAACAGGGCAATAGTATGATGGTA...TAGAATCTTGATTGG

   2400     .    :    .
   2221 AGTTGGTTAACAGAA
        |||||||||||||||
 136404 AGTTGGTTAACAGAA