seq1 = pF1KE2067.tfa, 2178 bp
seq2 = pF1KE2067/gi568815596r_70563498.tfa (gi568815596r:70563498_70806408), 242911 bp

>pF1KE2067 2178
>gi568815596r:70563498_70806408 (Chr2)

(complement)

1-183  (100001-100183)   100% ->
184-322  (101950-102088)   100% ->
323-474  (110013-110164)   100% ->
475-555  (110608-110688)   100% ->
556-705  (113857-114006)   100% ->
706-849  (115480-115623)   100% ->
850-948  (118287-118385)   100% ->
949-1125  (122642-122818)   100% ->
1126-1383  (127448-127705)   100% ->
1384-1503  (128532-128651)   100% ->
1504-1593  (129524-129613)   100% ->
1594-1741  (131584-131731)   100% ->
1742-1870  (133403-133531)   100% ->
1871-2178  (142674-142981)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGAAGAGACGGTCCCCGAGGCTGCCTCGCCGCCGCCCCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGAAGAGACGGTCCCCGAGGCTGCCTCGCCGCCGCCCCCGCAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCCTTACTTTGACCGCTTCTCAGAGGACGACCCCGAGTACATGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCCTTACTTTGACCGCTTCTCAGAGGACGACCCCGAGTACATGCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCGCAACCGGGCGGCGGACCTGCGGCAGGACTTCAACCTGATGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCGCAACCGGGCGGCGGACCTGCGGCAGGACTTCAACCTGATGGAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAGCGCGTCACCATGATCCTGCAGAGTCCC         TCTTTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100151 AAGAAGCGCGTCACCATGATCCTGCAGAGTCCCGTG...CAGTCTTTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGGAGCTGGAAGGCCTCATCCAGGAGCAGATGAAGAAGGGGAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101958 GGAGGAGCTGGAAGGCCTCATCCAGGAGCAGATGAAGAAGGGGAACAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTCCAACATCTGGGCCCTGCGACAGATCGCGGACTTCATGGCCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102008 CCTCCAACATCTGGGCCCTGCGACAGATCGCGGACTTCATGGCCAGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCCACGCAGTCTTCCCGACATCTTCCATGA         ATGTCTCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102058 TCCCACGCAGTCTTCCCGACATCTTCCATGAGTA...CAGATGTCTCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATGACGCCTATCAATGACCTCCACACAGCTGACTCCCTGAACCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110023 GATGACGCCTATCAATGACCTCCACACAGCTGACTCCCTGAACCTGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGGGGAGCGGCTCATGCGGTGCAAGATCAGCAGTGTCTACCGACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110073 AAGGGGAGCGGCTCATGCGGTGCAAGATCAGCAGTGTCTACCGACTCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACCTCTATGGCTGGGCCCAGCTGAGTGACACCTATGTCACG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 110123 GACCTCTATGGCTGGGCCCAGCTGAGTGACACCTATGTCACGGTG...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    475  TTGAGAGTCAGCAAGGAGCAGGACCACTTCCTGATCAGCCCTAAGGGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110607 GTTGAGAGTCAGCAAGGAGCAGGACCACTTCCTGATCAGCCCTAAGGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTCTTGCAGTGAAGTCACAGCGTCCAGCCTG         ATCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110657 TTTCTTGCAGTGAAGTCACAGCGTCCAGCCTGGTG...CAGATCAAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACATTCTGGGAGAGGTGGTGGAGAAGGGCAGCAGCTGCTTCCCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113866 AACATTCTGGGAGAGGTGGTGGAGAAGGGCAGCAGCTGCTTCCCAGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCACAGGCTTCTGTCTGCACTCGGCCATCTATGCAGCGAGGCCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113916 CACCACAGGCTTCTGTCTGCACTCGGCCATCTATGCAGCGAGGCCCGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCGCTGCATCATCCACCTGCACACACCGGCCACAGCAGCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 113966 TGCGCTGCATCATCCACCTGCACACACCGGCCACAGCAGCGGTG...AAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGTCGGCCATGAAGTGGGGCCTCCTGCCTGTCTCCCACAATGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115480 GTGTCGGCCATGAAGTGGGGCCTCCTGCCTGTCTCCCACAATGCCCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGTGGGGGACATGGCCTATTATGACTTCAATGGGGAAATGGAGCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115530 GGTGGGGGACATGGCCTATTATGACTTCAATGGGGAAATGGAGCAGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCGATCGGATCAACCTGCAGAAGTGCCTTGGACCCACCTGCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115580 CCGATCGGATCAACCTGCAGAAGTGCCTTGGACCCACCTGCAAGGTT...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850    ATCCTGGTGCTAAGAAACCATGGAGTGGTTGCTCTGGGTGACACGGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118284 CAGATCCTGGTGCTAAGAAACCATGGAGTGGTTGCTCTGGGTGACACGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAGGAGGCATTTTACAAGATCTTCCACCTGCAGGCTGCATGTGAGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118334 AGAGGAGGCATTTTACAAGATCTTCCACCTGCAGGCTGCATGTGAGATAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AG         GTGTCGGCTCTGTCCAGTGCCGGGGGAGTGGAGAACCTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118384 AGGTG...CAGGTGTCGGCTCTGTCCAGTGCCGGGGGAGTGGAGAACCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCCTCCTGGAGCAGGAGAAGCACCGGCCCCATGAGGTGGGCTCCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122681 ATCCTCCTGGAGCAGGAGAAGCACCGGCCCCATGAGGTGGGCTCCGTGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GTGGGCCGGGAGCACCTTTGGGCCTATGCAGAAGAGTCGGCTGGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122731 GTGGGCCGGGAGCACCTTTGGGCCTATGCAGAAGAGTCGGCTGGGGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGAGTTTGAGGCCCTCATGAGGATGCTGGACAACCTG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 122781 ATGAGTTTGAGGCCCTCATGAGGATGCTGGACAACCTGGTG...TAGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TACAGAACAGGTTACACGTATCGCCACCCCTTTGTTCAAGAGAAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127451 TACAGAACAGGTTACACGTATCGCCACCCCTTTGTTCAAGAGAAAACCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACACAAAAGTGAGGTGGAGATTCCAGCCACGGTCACAGCCTTCGTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127501 ACACAAAAGTGAGGTGGAGATTCCAGCCACGGTCACAGCCTTCGTGTTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGGAGGACGGTGCCCCGGTGCCCGCCCTGCGACAGCATGCCCAGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127551 AGGAGGACGGTGCCCCGGTGCCCGCCCTGCGACAGCATGCCCAGAAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CAGAAGGAGAAGACCCGCTGGCTCAATACGCCCAACACCTACCTGCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127601 CAGAAGGAGAAGACCCGCTGGCTCAATACGCCCAACACCTACCTGCGGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CAATGTGGCCGATGAGGTCCAGAGGAGCATGGGCAGCCCCCGACCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127651 CAATGTGGCCGATGAGGTCCAGAGGAGCATGGGCAGCCCCCGACCCAAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCACG         TGGATGAAGGCTGACGAGGTGGAGAAATCCAGCAGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127701 CCACGGTA...CAGTGGATGAAGGCTGACGAGGTGGAGAAATCCAGCAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGCATGCCGATTCGCATCGAAAACCCAAACCAATTTGTGCCTCTCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128568 GGCATGCCGATTCGCATCGAAAACCCAAACCAATTTGTGCCTCTCTATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGACCCCCAGGAAGTACTGGAGATGAGGAACAAG         ATTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 128618 TGACCCCCAGGAAGTACTGGAGATGAGGAACAAGGTA...CAGATTCGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AACAAAACCGACAAGATGTGAAGTCAGCGGGGCCTCAGTCCCAGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129531 AACAAAACCGACAAGATGTGAAGTCAGCGGGGCCTCAGTCCCAGCTCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCGAGCGTCATTGCCGAGAAGAGCCGAAGCCCG         TCTACAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129581 GCGAGCGTCATTGCCGAGAAGAGCCGAAGCCCGGTA...CAGTCTACAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAGCCAGCTGATGTCCAAGGGAGACGAGGATACCAAAGACGATTCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131592 GAGCCAGCTGATGTCCAAGGGAGACGAGGATACCAAAGACGATTCAGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGACGGTGCCCAACCCCTTCAGCCAACTCACTGACCAGGAGTTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131642 AGACGGTGCCCAACCCCTTCAGCCAACTCACTGACCAGGAGTTGGAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TACAAGAAAGAGGTGGAGAGGAAGAAACTAGAACTTGATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 131692 TACAAGAAAGAGGTGGAGAGGAAGAAACTAGAACTTGATGGTA...CAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AGAGAAAGAAACTGCCCCAGAAGAGCCTGGCTCACCTGCAAAGTCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133404 AGAGAAAGAAACTGCCCCAGAAGAGCCTGGCTCACCTGCAAAGTCTGCAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTGCTTCTCCAGTGCAGAGCCCAGCGAAGGAGGCAGAGACAAAGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133454 CTGCTTCTCCAGTGCAGAGCCCAGCGAAGGAGGCAGAGACAAAGAGCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TTAGTCTCTCCTTCCAAGTCTTTAGAGG         AAGGTACTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 133504 TTAGTCTCTCCTTCCAAGTCTTTAGAGGGTG...TAGAAGGTACTAAGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GACAGAAACAAGCAAAGCCGCCACCACAGAGCCCGAAACAACCCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142687 GACAGAAACAAGCAAAGCCGCCACCACAGAGCCCGAAACAACCCAGCCGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AAGGGGTGGTGGTCAACGGGAGGGAGGAGGAGCAGACGGCAGAGGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142737 AAGGGGTGGTGGTCAACGGGAGGGAGGAGGAGCAGACGGCAGAGGAAATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CTCAGCAAAGGCCTGAGCCAGATGACCACCAGTGCTGACACGGATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142787 CTCAGCAAAGGCCTGAGCCAGATGACCACCAGTGCTGACACGGATGTTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TACCTCTAAGGACAAAACCGAGTCGGTCACCAGCGGCCCCATGTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142837 TACCTCTAAGGACAAAACCGAGTCGGTCACCAGCGGCCCCATGTCCCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AGGGCTCACCTTCCAAGTCTCCCTCAAAGAAGAAAAAGAAATTCCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142887 AGGGCTCACCTTCCAAGTCTCCCTCAAAGAAGAAAAAGAAATTCCGAACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2134 CCCTCCTTCCTGAAAAAGAGCAAAAAGAAGGAGAAAGTGGAGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142937 CCCTCCTTCCTGAAAAAGAGCAAAAAGAAGGAGAAAGTGGAGTCC