seq1 = pF1KE2064.tfa, 2136 bp
seq2 = pF1KE2064/gi568815579r_18110932.tfa (gi568815579r:18110932_18333191), 222260 bp

>pF1KE2064 2136
>gi568815579r:18110932_18333191 (Chr19)

(complement)

1-242  (100001-100242)   100% ->
243-434  (110869-111060)   100% ->
435-471  (111895-111931)   100% ->
472-545  (112014-112087)   100% ->
546-595  (112269-112318)   100% ->
596-708  (112677-112789)   100% ->
709-802  (112873-112966)   100% ->
803-966  (113795-113958)   100% ->
967-1065  (114154-114252)   100% ->
1066-1230  (114694-114858)   100% ->
1231-1330  (114944-115043)   100% ->
1331-1485  (116297-116451)   100% ->
1486-1608  (119702-119824)   100% ->
1609-1791  (121251-121433)   100% ->
1792-2136  (121916-122260)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAACCTGGGGGTCGGCGAAGGGGCAGAGGCTTGCAGCAGGTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAACCTGGGGGTCGGCGAAGGGGCAGAGGCTTGCAGCAGGTTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGCTCTCGCGGCCGCCACAGCATGACCAGAGCCCCGAAGCACCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGCTCTCGCGGCCGCCACAGCATGACCAGAGCCCCGAAGCACCTGTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCAACCCCGGCGCCCCATCCGCATCCAACAGCGCTTCTATTCGGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCAACCCCGGCGCCCCATCCGCATCCAACAGCGCTTCTATTCGGATCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACAAGTCCGCGGGCTGCCGCGAGAGGGACCTGAGCCCGCGGCCGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACAAGTCCGCGGGCTGCCGCGAGAGGGACCTGAGCCCGCGGCCGGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGAAGTCGCGGCTCTCCTGGCCCGTTTCCTCCTGCAGGCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100201 CAGGAAGTCGCGGCTCTCCTGGCCCGTTTCCTCCTGCAGGCGGTA...CA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    243  CTTTGACCTGGAAAATGGGCTCTCGTGTGGGAGGAGGGCCCTGGACCCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110868 GCTTTGACCTGGAAAATGGGCTCTCGTGTGGGAGGAGGGCCCTGGACCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGTCCAGCCCTGGCCTGGGCCGGATTATGCAGGCTCCAGTCCCGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110918 CAGTCCAGCCCTGGCCTGGGCCGGATTATGCAGGCTCCAGTCCCGCACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAGCGGCGCGAGTCCTTCCTGTACCGCTCAGATAGCGACTATGAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110968 CCAGCGGCGCGAGTCCTTCCTGTACCGCTCAGATAGCGACTATGAACTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGCCCAAGGCCATGTCTCGGAACTCCTCTGTGGCCAGCGACCT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111018 CGCCCAAGGCCATGTCTCGGAACTCCTCTGTGGCCAGCGACCTGTG...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    435   ACATGGAGAGGACATGATTGTGACGCCCTTTGCCCAG         GT
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111893 AGACATGGAGAGGACATGATTGTGACGCCCTTTGCCCAGGTG...CAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGCCAGTCTGCGGACCGTTCGGAGCAACGTGGCGGCCCTTGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112016 CCTGGCCAGTCTGCGGACCGTTCGGAGCAACGTGGCGGCCCTTGCCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGCAATGCCTAGGAGCAGCCAA         GCAGGGACCCGTCGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112066 AGCAATGCCTAGGAGCAGCCAAGTA...CAGGCAGGGACCCGTCGGAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTTCATCCAGCAATCAGCTCCCTCCTGCAG         AGGACACGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112288 CCTTCATCCAGCAATCAGCTCCCTCCTGCAGGTA...CAGAGGACACGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCAGAAGCTGGCATTGGAGACGCTAGACGAGCTGGACTGGTGCCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112687 GCAGAAGCTGGCATTGGAGACGCTAGACGAGCTGGACTGGTGCCTGGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGTTGGAGACGCTGCAGACCCGGCACTCGGTGGGGGAGATGGCCTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112737 AGTTGGAGACGCTGCAGACCCGGCACTCGGTGGGGGAGATGGCCTCCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAG         TTCAAGCGGATCCTGAACCGGGAGTTGACCCACCTGTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112787 AAGGTG...CAGTTCAAGCGGATCCTGAACCGGGAGTTGACCCACCTGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CGAAACCAGCCGCTCCGGGAACCAGGTGTCCGAGTACATCTCCCGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112911 CGAAACCAGCCGCTCCGGGAACCAGGTGTCCGAGTACATCTCCCGGACCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCCTGG         ACCAGCAGACCGAGGTGGAGCTGCCCAAGGTGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112961 TCCTGGGTG...CAGACCAGCAGACCGAGGTGGAGCTGCCCAAGGTGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCTGAGGAGGCCCCACAGCCCATGTCCCGGATCAGTGGCCTACATGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113830 GCTGAGGAGGCCCCACAGCCCATGTCCCGGATCAGTGGCCTACATGGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTGCCACAGTGCCAGCCTCTCCTCAGCCACTGTCCCACGCTTTGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113880 CTGCCACAGTGCCAGCCTCTCCTCAGCCACTGTCCCACGCTTTGGGGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGACTGACCAGGAGGAGCAACTGGCCAAG         GAGCTAGAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 113930 AGACTGACCAGGAGGAGCAACTGGCCAAGGTG...TAGGAGCTAGAAGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ACCAACAAGTGGGGACTTGATGTGTTCAAGGTGGCGGAGCTAAGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114166 ACCAACAAGTGGGGACTTGATGTGTTCAAGGTGGCGGAGCTAAGTGGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCGGCCCCTCACAGCTATCATATTCAGCATTTTTCAG         GAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114216 CCGGCCCCTCACAGCTATCATATTCAGCATTTTTCAGGTA...CAGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GGGACCTGCTGAAGACATTCCAGATCCCAGCAGACACACTGGCCACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114698 GGGACCTGCTGAAGACATTCCAGATCCCAGCAGACACACTGGCCACCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTGCTGATGCTGGAAGGTCACTACCACGCCAATGTGGCCTACCACAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114748 CTGCTGATGCTGGAAGGTCACTACCACGCCAATGTGGCCTACCACAACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTACATGCCGCCGACGTGGCCCAGTCCACGCATGTGCTGCTGGCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114798 CCTACATGCCGCCGACGTGGCCCAGTCCACGCATGTGCTGCTGGCTACGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCGCCCTCGAG         GCTGTGTTCACAGACTTGGAAATCCTGGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 114848 CCGCCCTCGAGGTA...CAGGCTGTGTTCACAGACTTGGAAATCCTGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCCCTCTTTGCAAGCGCCATCCACGACGTGGACCATCCTGGGGTCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114974 GCCCTCTTTGCAAGCGCCATCCACGACGTGGACCATCCTGGGGTCTCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CCAGTTTCTGATTAACACCA         ACTCAGAGCTGGCGCTTATGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115024 CCAGTTTCTGATTAACACCAGTA...CAGACTCAGAGCTGGCGCTTATGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACAACGACGCCTCGGTGCTGGAGAACCATCACCTGGCTGTGGGCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116318 ACAACGACGCCTCGGTGCTGGAGAACCATCACCTGGCTGTGGGCTTCAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CTGCTGCAGGCAGAGAACTGCGATATCTTCCAGAACCTCAGCGCCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116368 CTGCTGCAGGCAGAGAACTGCGATATCTTCCAGAACCTCAGCGCCAAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCGACTGAGTCTGCGCAGGATGGTCATTGACATG         GTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 116418 GCGACTGAGTCTGCGCAGGATGGTCATTGACATGGTG...CAGGTGCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCACAGACATGTCCAAACACATGAACCTCCTGGCCGACCTCAAGACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119709 CCACAGACATGTCCAAACACATGAACCTCCTGGCCGACCTCAAGACCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTGGAGACCAAGAAGGTGACAAGCCTCGGTGTCCTCCTCCTGGACAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119759 GTGGAGACCAAGAAGGTGACAAGCCTCGGTGTCCTCCTCCTGGACAACTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TTCCGACCGAATCCAG         GTCTTGCAGAACCTGGTGCACTGTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 119809 TTCCGACCGAATCCAGGTG...TAGGTCTTGCAGAACCTGGTGCACTGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CTGATCTGAGCAACCCCACCAAGCCGCTGCCCCTGTACCGCCAGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121276 CTGATCTGAGCAACCCCACCAAGCCGCTGCCCCTGTACCGCCAGTGGACG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GACCGCATCATGGCCGAGTTCTTCCAGCAGGGAGACCGCGAGCGTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121326 GACCGCATCATGGCCGAGTTCTTCCAGCAGGGAGACCGCGAGCGTGAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGGCCTGGACATCAGTCCCATGTGTGACAAGCATACGGCCTCAGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121376 GGGCCTGGACATCAGTCCCATGTGTGACAAGCATACGGCCTCAGTGGAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AGTCCCAG         GTGGGTTTCATTGACTACATTGCTCACCCACTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121426 AGTCCCAGGTT...CAGGTGGGTTTCATTGACTACATTGCTCACCCACTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TGGGAGACTTGGGCTGACCTGGTCCACCCAGATGCACAGGACCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121949 TGGGAGACTTGGGCTGACCTGGTCCACCCAGATGCACAGGACCTGCTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CACGCTGGAGGACAATCGAGAGTGGTACCAGAGCAAGATCCCCCGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121999 CACGCTGGAGGACAATCGAGAGTGGTACCAGAGCAAGATCCCCCGAAGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCTCAGACCTCACCAACCCCGAGCGGGACGGGCCTGACAGATTCCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122049 CCTCAGACCTCACCAACCCCGAGCGGGACGGGCCTGACAGATTCCAGTTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GAACTGACTCTGGAGGAGGCAGAGGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122099 GAACTGACTCTGGAGGAGGCAGAGGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GGGGGAAGAGACAGCTTTAGCCAAAGAGGCCTTGGAGTTGCCTGACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122149 GGGGGAAGAGACAGCTTTAGCCAAAGAGGCCTTGGAGTTGCCTGACACTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 AACTCCTGTCCCCTGAAGCCGGCCCAGACCCTGGGGACTTACCCCTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122199 AACTCCTGTCCCCTGAAGCCGGCCCAGACCCTGGGGACTTACCCCTCGAC

   2250     .    :
   2125 AACCAGAGGACT
        ||||||||||||
 122249 AACCAGAGGACT