seq1 = pF1KE2062.tfa, 2463 bp
seq2 = pF1KE2062/gi568815588r_121379860.tfa (gi568815588r:121379860_121693817), 313958 bp

>pF1KE2062 2463
>gi568815588r:121379860_121693817 (Chr10)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-376  (128114-128380)   100% ->
377-454  (129239-129316)   100% ->
455-624  (142359-142528)   100% ->
625-748  (155103-155226)   99% ->
749-939  (173649-173839)   99% ->
940-1084  (176355-176499)   100% ->
1085-1287  (178499-178705)   98% ->
1288-1439  (189877-190028)   100% ->
1440-1561  (192871-192992)   100% ->
1562-1672  (195213-195323)   100% ->
1673-1863  (197096-197286)   100% ->
1864-1986  (205705-205827)   100% ->
1987-2057  (206394-206464)   100% ->
2058-2195  (208286-208423)   100% ->
2196-2301  (210015-210120)   100% ->
2302-2463  (213797-213958)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCAGCTGGGGTCGTTTCATCTGCCTGGTCGTGGTCACCATGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCAGCTGGGGTCGTTTCATCTGCCTGGTCGTGGTCACCATGGCAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGTCCCTGGCCCGGCCCTCCTTCAGTTTAGTTGAGGATACCACATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGTCCCTGGCCCGGCCCTCCTTCAGTTTAGTTGAGGATACCACATTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCAGAAG         AGCCACCAACCAAATACCAAATCTCTCAACCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCAGAAGGTA...CAGAGCCACCAACCAAATACCAAATCTCTCAACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGTGTACGTGGCTGCGCCAGGGGAGTCGCTAGAGGTGCGCTGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128146 GAAGTGTACGTGGCTGCGCCAGGGGAGTCGCTAGAGGTGCGCTGCCTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGATGCCGCCGTGATCAGTTGGACTAAGGATGGGGTGCACTTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128196 GAAAGATGCCGCCGTGATCAGTTGGACTAAGGATGGGGTGCACTTGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAACAATAGGACAGTGCTTATTGGGGAGTACTTGCAGATAAAGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128246 CCAACAATAGGACAGTGCTTATTGGGGAGTACTTGCAGATAAAGGGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACGCCTAGAGACTCCGGCCTCTATGCTTGTACTGCCAGTAGGACTGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128296 ACGCCTAGAGACTCCGGCCTCTATGCTTGTACTGCCAGTAGGACTGTAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGTGAAACTTGGTACTTCATGGTGAATGTCACAG         ATGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 128346 CAGTGAAACTTGGTACTTCATGGTGAATGTCACAGGTG...CAGATGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTCATCCGGAGATGATGAGGATGACACCGATGGTGCGGAAGATTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129245 TCTCATCCGGAGATGATGAGGATGACACCGATGGTGCGGAAGATTTTGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGTGAGAACAGTAACAACAAGA         GAGCACCATACTGGACCAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 129295 AGTGAGAACAGTAACAACAAGAGTA...CAGGAGCACCATACTGGACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACAGAAAAGATGGAAAAGCGGCTCCATGCTGTGCCTGCGGCCAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142378 CACAGAAAAGATGGAAAAGCGGCTCCATGCTGTGCCTGCGGCCAACACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCAAGTTTCGCTGCCCAGCCGGGGGGAACCCAATGCCAACCATGCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142428 TCAAGTTTCGCTGCCCAGCCGGGGGGAACCCAATGCCAACCATGCGGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGAAAAACGGGAAGGAGTTTAAGCAGGAGCATCGCATTGGAGGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142478 CTGAAAAACGGGAAGGAGTTTAAGCAGGAGCATCGCATTGGAGGCTACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 G         GTACGAAACCAGCACTGGAGCCTCATTATGGAAAGTGTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142528 GGTA...CAGGTACGAAACCAGCACTGGAGCCTCATTATGGAAAGTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCCATCTGACAAGGGAAATTATACCTGTGTGGTGGAGAATGAATACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 155143 TCCCATCTGACAAGGGAAATTATACCTGTGTAGTGGAGAATGAATACGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCCATCAATCACACGTACCACCTGGATGTTGTGG         AACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| |||||
 155193 TCCATCAATCACACGTACCACCTGGATGTTGTGGGTG...CAGAGCGATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCCTCACCGGCCCATCCTCCAAGCCGGACTGCCGGCAAATGCCTCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173656 GCCTCACCGGCCCATCCTCCAAGCCGGACTGCCGGCAAATGCCTCCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGTCGGAGGAGACGTAGAGTTTGTCTGCAAGGTTTACAGTGATGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173706 TGGTCGGAGGAGACGTAGAGTTTGTCTGCAAGGTTTACAGTGATGCCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCCCACATCCAGTGGATCAAGCACGTGGAAAAGAACGGCAGTAAATACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173756 CCCCACATCCAGTGGATCAAGCACGTGGAAAAGAACGGCAGTAAATACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCCCGACGGGCTGCCCTACCTCAAGGTTCTCAAG         GCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 173806 GCCCGACGGGCTGCCCTACCTCAAGGTTCTCAAGGTG...TAGGCCGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTGTTAACACCACGGACAAAGAGATTGAGGTTCTCTATATTCGGAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176362 GTGTTAACACCACGGACAAAGAGATTGAGGTTCTCTATATTCGGAATGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACTTTTGAGGACGCTGGGGAATATACGTGCTTGGCGGGTAATTCTATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176412 ACTTTTGAGGACGCTGGGGAATATACGTGCTTGGCGGGTAATTCTATTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GATATCCTTTCACTCTGCATGGTTGACAGTTCTGCCAG         CGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 176462 GATATCCTTTCACTCTGCATGGTTGACAGTTCTGCCAGGTA...TAGCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTGGAAGAGAAAAGGAGATTACAGCTTCCCCAGACTACCTGGAGATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178502 CTGGAAGAGAAAAGGAGATTACAGCTTCCCCAGACTACCTGGAGATAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATTTACTGCATAGGGGTCTTCTTAATCGCCTGTATGGTGGTAACAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178552 ATTTACTGCATAGGGGTCTTCTTAATCGCCTGTATGGTGGTAACAGTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCTGTGCCGAATGAAGAACACGACCAAGAAGCCAGACTTCAGCAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178602 CCTGTGCCGAATGAAGAACACGACCAAGAAGCCAGACTTCAGCAGCCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CGGCTGTGCACAAGCTGACCAAACGTATCCCCCTGCGGAGACAGGTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178652 CGGCTGTGCACAAGCTGACCAAACGTATCCCCCTGCGGAGACAGGTAACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288              GTTTCGGCTGAGTCCAGCTCCTCCATGAACTCCAACA
        ---->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178702 GAAAGTA...CAGGTTTCGGCTGAGTCCAGCTCCTCCATGAACTCCAACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 CCCCGCTGGTGAGGATAACAACACGCCTCTCTTCAACGGCAGACACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189914 CCCCGCTGGTGAGGATAACAACACGCCTCTCTTCAACGGCAGACACCCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 ATGCTGGCAGGGGTCTCCGAGTATGAACTTCCAGAGGACCCAAAATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189964 ATGCTGGCAGGGGTCTCCGAGTATGAACTTCCAGAGGACCCAAAATGGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 GTTTCCAAGAGATAA         GCTGACACTGGGCAAGCCCCTGGGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 190014 GTTTCCAAGAGATAAGTG...TAGGCTGACACTGGGCAAGCCCCTGGGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 AAGGTTGCTTTGGGCAAGTGGTCATGGCGGAAGCAGTGGGAATTGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192897 AAGGTTGCTTTGGGCAAGTGGTCATGGCGGAAGCAGTGGGAATTGACAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 GACAAGCCCAAGGAGGCGGTCACCGTGGCCGTGAAGATGTTGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 192947 GACAAGCCCAAGGAGGCGGTCACCGTGGCCGTGAAGATGTTGAAAGGTG.

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1562      ATGATGCCACAGAGAAAGACCTTTCTGATCTGGTGTCAGAGATGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192997 ..TAGATGATGCCACAGAGAAAGACCTTTCTGATCTGGTGTCAGAGATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 AGATGATGAAGATGATTGGGAAACACAAGAATATCATAAATCTTCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195258 AGATGATGAAGATGATTGGGAAACACAAGAATATCATAAATCTTCTTGGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCCTGCACACAGGATG         GGCCTCTCTATGTCATAGTTGAGTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 195308 GCCTGCACACAGGATGGTG...CAGGGCCTCTCTATGTCATAGTTGAGTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 TGCCTCTAAAGGCAACCTCCGAGAATACCTCCGAGCCCGGAGGCCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197121 TGCCTCTAAAGGCAACCTCCGAGAATACCTCCGAGCCCGGAGGCCACCCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 GGATGGAGTACTCCTATGACATTAACCGTGTTCCTGAGGAGCAGATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197171 GGATGGAGTACTCCTATGACATTAACCGTGTTCCTGAGGAGCAGATGACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 TTCAAGGACTTGGTGTCATGCACCTACCAGCTGGCCAGAGGCATGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197221 TTCAAGGACTTGGTGTCATGCACCTACCAGCTGGCCAGAGGCATGGAGTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 CTTGGCTTCCCAAAAA         TGTATTCATCGAGATTTAGCAGCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 197271 CTTGGCTTCCCAAAAAGTG...CAGTGTATTCATCGAGATTTAGCAGCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 GAAATGTTTTGGTAACAGAAAACAATGTGATGAAAATAGCAGACTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205730 GAAATGTTTTGGTAACAGAAAACAATGTGATGAAAATAGCAGACTTTGGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 CTCGCCAGAGATATCAACAATATAGACTATTACAAAAAGACCACCAAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 205780 CTCGCCAGAGATATCAACAATATAGACTATTACAAAAAGACCACCAATGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1987        GGGCGGCTTCCAGTCAAGTGGATGGCTCCAGAAGCCCTGTTTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205830 A...CAGGGGCGGCTTCCAGTCAAGTGGATGGCTCCAGAAGCCCTGTTTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 ATAGAGTATACACTCATCAGAGTGATGT         CTGGTCCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 206437 ATAGAGTATACACTCATCAGAGTGATGTGTG...CAGCTGGTCCTTCGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 GTGTTAATGTGGGAGATCTTCACTTTAGGGGGCTCGCCCTACCCAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208299 GTGTTAATGTGGGAGATCTTCACTTTAGGGGGCTCGCCCTACCCAGGGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 TCCCGTGGAGGAACTTTTTAAGCTGCTGAAGGAAGGACACAGAATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208349 TCCCGTGGAGGAACTTTTTAAGCTGCTGAAGGAAGGACACAGAATGGATA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 AGCCAGCCAACTGCACCAACGAACT         GTACATGATGATGAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 208399 AGCCAGCCAACTGCACCAACGAACTGTA...CAGGTACATGATGATGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 GACTGTTGGCATGCAGTGCCCTCCCAGAGACCAACGTTCAAGCAGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210031 GACTGTTGGCATGCAGTGCCCTCCCAGAGACCAACGTTCAAGCAGTTGGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 AGAAGACTTGGATCGAATTCTCACTCTCACAACCAATGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 210081 AGAAGACTTGGATCGAATTCTCACTCTCACAACCAATGAGGTA...CAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 AATACTTGGACCTCAGCCAACCTCTCGAACAGTATTCACCTAGTTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213798 AATACTTGGACCTCAGCCAACCTCTCGAACAGTATTCACCTAGTTACCCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 GACACAAGAAGTTCTTGTTCTTCAGGAGATGATTCTGTTTTTTCTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213848 GACACAAGAAGTTCTTGTTCTTCAGGAGATGATTCTGTTTTTTCTCCAGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 CCCCATGCCTTACGAACCATGCCTTCCTCAGTATCCACACATAAACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213898 CCCCATGCCTTACGAACCATGCCTTCCTCAGTATCCACACATAAACGGCA

   2600     .    :
   2453 GTGTTAAAACA
        |||||||||||
 213948 GTGTTAAAACA