seq1 = pF1KE2061.tfa, 2115 bp
seq2 = pF1KE2061/gi568815575r_47472867.tfa (gi568815575r:47472867_47719728), 246862 bp

>pF1KE2061 2115
>gi568815575r:47472867_47719728 (ChrX)

(complement)

1-377  (100001-100377)   100% ->
378-435  (112531-112588)   100% ->
436-527  (112693-112784)   98% ->
528-684  (114350-114506)   100% ->
685-774  (114662-114751)   100% ->
775-837  (142228-142290)   100% ->
838-980  (143089-143231)   100% ->
981-1055  (143323-143397)   100% ->
1056-1158  (143496-143598)   100% ->
1159-1305  (144455-144601)   100% ->
1306-1393  (144954-145041)   100% ->
1394-1982  (145139-145727)   100% ->
1983-2115  (146730-146862)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTACCTGCGGCGCCGCCTGTCGGACAGCAACTTTATGGCCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTACCTGCGGCGCCGCCTGTCGGACAGCAACTTTATGGCCAATCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCAAATGGGTACATGACAGACCTGCAGCGTCCGCAGCCGCCCCCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCAAATGGGTACATGACAGACCTGCAGCGTCCGCAGCCGCCCCCACCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCCGGTGCCCACAGCCCCGGAGCCACGCCCGGTCCCGGGACCGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCCGGTGCCCACAGCCCCGGAGCCACGCCCGGTCCCGGGACCGCCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGAGAGGTCCTCCGGGGTCGCCCCAGCGGCCTCTCCGGCCGCCCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGAGAGGTCCTCCGGGGTCGCCCCAGCGGCCTCTCCGGCCGCCCCTAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCGGGTCCTCGGGGGGCGGTGGCTTCTTCTCGTCGCTGTCCAACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCGGGTCCTCGGGGGGCGGTGGCTTCTTCTCGTCGCTGTCCAACGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAGCAGACCACGGCGGCGGCAGCTGCCACCTTCAGCGAGCAGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAGCAGACCACGGCGGCGGCAGCTGCCACCTTCAGCGAGCAGGTGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGGCTCTGGGGGCGCAGGCCGCGGGGGAGCCGCCTCCAGGGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGGCTCTGGGGGCGCAGGCCGCGGGGGAGCCGCCTCCAGGGTGCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCATCGACGAGCCGCACACCGACTG         GGCAAAATACTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100351 GGTCATCGACGAGCCGCACACCGACTGGTA...CAGGGCAAAATACTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGGGAAAAAGATCCATGGAGAAATTGACATTAAAGTAGAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112545 AAGGGAAAAAGATCCATGGAGAAATTGACATTAAAGTAGAACAGGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    436    GCCGAATTCTCTGATCTCAACCTTGTGGCCCATGCCAATGGTGGATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112690 CAGGCCGAATTCTCTGATCTCAACCTTGTGGCCCATGCCAATGGTGGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCTGTGGATATGGAAGTTCTTCGGAACGGGGTGAAGGTCGTGCG     
        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||>>>..
 112740 CTCTGTGGATATGGAAGTTCTTCGGAATGGGGTGAAGGTCGTGCGGTG..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    528     GTCTCTGAAGCCGGATTTTGTGCTGATCCGCCAGCACGCCTTCAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112790 .TAGGTCTCTGAAGCCGGATTTTGTGCTGATCCGCCAGCACGCCTTCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATGGCACGCAACGGAGACTACCGCAGTTTGGTCATTGGGCTGCAGTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114396 ATGGCACGCAACGGAGACTACCGCAGTTTGGTCATTGGGCTGCAGTATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGAATCCCCAGTGTTAACTCCTTGCATTCTGTCTACAACTTCTGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114446 TGGAATCCCCAGTGTTAACTCCTTGCATTCTGTCTACAACTTCTGTGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCCCTGGGTG         TTTGCCCAGATGGTTCGACTGCATAAGAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 114496 AGCCCTGGGTGGTA...TAGTTTGCCCAGATGGTTCGACTGCATAAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGGGGACAGAAGAATTCCCTCTAATTGATCAGACCTTCTACCCCAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114692 CTGGGGACAGAAGAATTCCCTCTAATTGATCAGACCTTCTACCCCAATCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAAAGAAATG         CTCAGCAGTACAACGTACCCCGTGGTTGTGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 114742 CAAAGAAATGGTG...CAGCTCAGCAGTACAACGTACCCCGTGGTTGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGATGGGGCACGCACACTCTGGGATGGGCAAG         GTCAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 142259 AGATGGGGCACGCACACTCTGGGATGGGCAAGGTG...CAGGTCAAGGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GACAACCAGCATGACTTCCAGGACATCGCAAGTGTCGTGGCACTGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143098 GACAACCAGCATGACTTCCAGGACATCGCAAGTGTCGTGGCACTGACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GACGTATGCCACTGCCGAGCCCTTCATCGATGCCAAATATGACGTGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143148 GACGTATGCCACTGCCGAGCCCTTCATCGATGCCAAATATGACGTGCGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCCAGAAGATTGGGCAGAACTACAAGGCCTACAT         GAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 143198 TCCAGAAGATTGGGCAGAACTACAAGGCCTACATGTG...CAGGAGGACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCAGTGTCAGGGAACTGGAAGACCAATACTGGCTCTGCGATGCTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143330 TCAGTGTCAGGGAACTGGAAGACCAATACTGGCTCTGCGATGCTGGAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AATTGCCATGTCTGACAG         ATACAAGCTGTGGGTGGACACGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 143380 AATTGCCATGTCTGACAGGTG...CAGATACAAGCTGTGGGTGGACACGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCTCAGAGATTTTTGGGGGACTGGACATCTGCGCAGTGGAAGCGCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143519 GCTCAGAGATTTTTGGGGGACTGGACATCTGCGCAGTGGAAGCGCTACAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGCAAGGACGGAAGGGATCACATCATTGAG         GTGGTGGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 143569 GGCAAGGACGGAAGGGATCACATCATTGAGGTA...CAGGTGGTGGGTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTCCATGCCGCTCATTGGTGACCACCAGGATGAAGACAAACAGCTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144466 CTCCATGCCGCTCATTGGTGACCACCAGGATGAAGACAAACAGCTCATCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TAGAGCTCGTGGTCAACAAGATGGCTCAGGCCCTGCCCCGGCAGCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144516 TAGAGCTCGTGGTCAACAAGATGGCTCAGGCCCTGCCCCGGCAGCGACAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CGGGATGCCTCCCCTGGCAGGGGCTCCCATGGCCAG         ACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 144566 CGGGATGCCTCCCCTGGCAGGGGCTCCCATGGCCAGGTC...CAGACTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GTCCCCAGGGGCCCTGCCCTTGGGCCGCCAGACCTCCCAGCAGCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144959 GTCCCCAGGGGCCCTGCCCTTGGGCCGCCAGACCTCCCAGCAGCCCGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGCCCCCGGCTCAGCAGCGACCCCCACCACAGG         GCGGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 145009 GGCCCCCGGCTCAGCAGCGACCCCCACCACAGGGTA...CAGGCGGCCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCACAGCCGGGTCCAGGCCCCCAGCGCCAGGGACCCCCATTGCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145147 CCACAGCCGGGTCCAGGCCCCCAGCGCCAGGGACCCCCATTGCAGCAGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCCGCCCCCGCAGGGCCAGCAGCACCTTTCAGGCCTTGGACCCCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145197 CCCGCCCCCGCAGGGCCAGCAGCACCTTTCAGGCCTTGGACCCCCAGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCAGCCCCCTGCCCCAGCGCCTTCCAAGTCCCACCTCAGCGCCCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145247 GCAGCCCCCTGCCCCAGCGCCTTCCAAGTCCCACCTCAGCGCCCCAGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CCCGCGTCCCAGGCCGCGCCGCCGACCCAGGGTCAAGGCCGCCAATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145297 CCCGCGTCCCAGGCCGCGCCGCCGACCCAGGGTCAAGGCCGCCAATCCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GCCAGTGGCGGGAGGCCCCGGGGCGCCTCCAGCAGCCCGCCCGCCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145347 GCCAGTGGCGGGAGGCCCCGGGGCGCCTCCAGCAGCCCGCCCGCCCGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CTCCGTCTCCCCAGCGCCAGGCGGGCCCCCCACAGGCTACCCGTCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145397 CTCCGTCTCCCCAGCGCCAGGCGGGCCCCCCACAGGCTACCCGTCAGACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TCCGTCTCTGGCCCGGCTCCGCCAAAGGCCTCTGGGGCCCCACCGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145447 TCCGTCTCTGGCCCGGCTCCGCCAAAGGCCTCTGGGGCCCCACCGGGCGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GCAGCAGCGCCAGGGCCCGCCCCAGAAACCCCCAGGCCCAGCCGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145497 GCAGCAGCGCCAGGGCCCGCCCCAGAAACCCCCAGGCCCAGCCGGCCCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CACGCCAGGCCAGCCAGGCGGGTCCCGTGCCCCGCACTGGGCCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145547 CACGCCAGGCCAGCCAGGCGGGTCCCGTGCCCCGCACTGGGCCACCCACC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 ACGCAGCAGCCTCGGCCCAGCGGCCCGGGCCCCGCTGGACGTCCCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145597 ACGCAGCAGCCTCGGCCCAGCGGCCCGGGCCCCGCTGGACGTCCCAAACC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 ACAGCTGGCCCAGAAACCCAGCCAGGACGTGCCGCCACCCGCCACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145647 ACAGCTGGCCCAGAAACCCAGCCAGGACGTGCCGCCACCCGCCACCGCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CTGCAGGGGGACCTCCGCACCCCCAGCTCAA         CAAATCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 145697 CTGCAGGGGGACCTCCGCACCCCCAGCTCAAGTA...TAGCAAATCCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TCTCTGACCAATGCCTTCAACCTTCCAGAGCCAGCCCCGCCCAGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146740 TCTCTGACCAATGCCTTCAACCTTCCAGAGCCAGCCCCGCCCAGGCCCAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CCTTAGCCAGGACGAGGTGAAAGCTGAGACCATCCGCAGCCTGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146790 CCTTAGCCAGGACGAGGTGAAAGCTGAGACCATCCGCAGCCTGAGGAAGT

   2200     .    :    .    :
   2093 CTTTCGCCAGCCTCTTCTCCGAC
        |||||||||||||||||||||||
 146840 CTTTCGCCAGCCTCTTCTCCGAC