seq1 = pF1KE2059.tfa, 2103 bp
seq2 = pF1KE2059/gi568815581r_7972774.tfa (gi568815581r:7972774_8187442), 214669 bp

>pF1KE2059 2103
>gi568815581r:7972774_8187442 (Chr17)

(complement)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-352  (101223-101427)   100% ->
353-434  (106256-106337)   100% ->
435-527  (106467-106559)   100% ->
528-650  (106663-106785)   100% ->
651-754  (107105-107208)   100% ->
755-927  (107502-107674)   100% ->
928-1071  (107904-108047)   100% ->
1072-1275  (110250-110453)   99% ->
1276-1362  (110700-110786)   100% ->
1363-1532  (111099-111268)   100% ->
1533-1654  (111727-111848)   100% ->
1655-1755  (113686-113786)   100% ->
1756-1926  (114125-114295)   100% ->
1927-2103  (114493-114669)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCTACAAAGTCAGGGTGGCCACAGGCACCGACCTCTTGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCTACAAAGTCAGGGTGGCCACAGGCACCGACCTCTTGTCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACACGGGACTCCATCTCACTGACCATTGTGGGGACACAAGGAGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACACGGGACTCCATCTCACTGACCATTGTGGGGACACAAGGAGAGAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAAGCAGCTGCTGAACCACTTTGGGAGAGACTTTGCAACTGGGGCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 ATAAGCAGCTGCTGAACCACTTTGGGAGAGACTTTGCAACTGGGGCGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       GTGGGCCAGTACACCGTGCAGTGCCCTCAGGACCTGGGTGAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...TAGGTGGGCCAGTACACCGTGCAGTGCCCTCAGGACCTGGGTGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCATCATCCGCCTGCACAAAGAGCGGTACGCCTTCTTCCCCAAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 CATCATCATCCGCCTGCACAAAGAGCGGTACGCCTTCTTCCCCAAGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTGGTACTGCAACTATGTGCAGATCTGTGCCCCCAACGGCCGTATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101317 CTTGGTACTGCAACTATGTGCAGATCTGTGCCCCCAACGGCCGTATCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACTTCCCCGCCTACCAGTGGATGGATGGCTACGAGACCCTGGCACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101367 CACTTCCCCGCCTACCAGTGGATGGATGGCTACGAGACCCTGGCACTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAGGCCACAG         GAAAGACAACAGCAGATGACTCGCTCCCCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101417 GGAGGCCACAGGTA...CAGGAAAGACAACAGCAGATGACTCGCTCCCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCTCCTGGAGCACAGAAAAGAGGAGATCAGAGCCAAGCAGGACTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106286 TCCTCCTGGAGCACAGAAAAGAGGAGATCAGAGCCAAGCAGGACTTCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CA         CTGGCGAGTCTTTCTTCCTGGCCTGCCCAGCTATGTGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106336 CAGTG...CAGCTGGCGAGTCTTTCTTCCTGGCCTGCCCAGCTATGTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATTCCCAGTTACCGCCCTCCGGTGCGGAGGCATCGCAACCCCAACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106506 CATTCCCAGTTACCGCCCTCCGGTGCGGAGGCATCGCAACCCCAACCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGA         GTGGAATGGCTATATTCCGGGATTCCCAATTCTCATC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106556 CTGAGTA...CAGGTGGAATGGCTATATTCCGGGATTCCCAATTCTCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACTTTAAGGCCACCAAGTTCCTGAACTTAAATCTCCGCTACTCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106700 AACTTTAAGGCCACCAAGTTCCTGAACTTAAATCTCCGCTACTCCTTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAGACGGCCTCCTTCTTCGTCCGCCTGGGGCCCAT         GGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106750 CAAGACGGCCTCCTTCTTCGTCCGCCTGGGGCCCATGTG...TAGGGCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGCTTTCAAAGTCCGCGGCCTGTTGGACTGCAAACATTCGTGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107110 TGGCTTTCAAAGTCCGCGGCCTGTTGGACTGCAAACATTCGTGGAAGAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGAAGGACATTAGGAAAATTTTCCCTGGCAAGAAATCTGTCGTCTCCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 107160 CTGAAGGACATTAGGAAAATTTTCCCTGGCAAGAAATCTGTCGTCTCCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    755         AGTACGTGGCCGAGCACTGGGCAGAGGACACCTTCTTTGGGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107210 TA...CAGAGTACGTGGCCGAGCACTGGGCAGAGGACACCTTCTTTGGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCAGTACCTCAACGGCGTCAACCCCGGCCTGATCCGCCGCTGCACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107544 ACCAGTACCTCAACGGCGTCAACCCCGGCCTGATCCGCCGCTGCACGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATCCCAGACAAGTTCCCCGTCACAGACGACATGGTGGCTCCGTTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107594 ATCCCAGACAAGTTCCCCGTCACAGACGACATGGTGGCTCCGTTCCTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGAGGGAACGTGCTTGCAAGCGGAGCTGGAG         AAGGGGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107644 CGAGGGAACGTGCTTGCAAGCGGAGCTGGAGGTG...CAGAAGGGGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTTACCTGGCCGACTACCGCATCATGGAGGGCATCCCCACCGTGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107914 TTTACCTGGCCGACTACCGCATCATGGAGGGCATCCCCACCGTGGAGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGCGGCCGGAAGCAGCACCACTGCGCCCCCCTCTGCCTGCTGCACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107964 AGCGGCCGGAAGCAGCACCACTGCGCCCCCCTCTGCCTGCTGCACTTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACCCGAGGGCAAGATGATGCCCATCGCCATCCAG         CTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108014 ACCCGAGGGCAAGATGATGCCCATCGCCATCCAGGTG...TAGCTCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGACCCCTGGGCCAGATTGCCCCATCTTCCTGCCCAGTGATTCTGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110257 AGACCCCTGGGCCAGATTGCCCCATCTTCCTGCCCAGTGATTCTGAGTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GACTGGCTGCTAGCCAAGACGTGGGTACGCTATGCGGAGTTCTACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110307 GACTGGCTGCTAGCCAAGACGTGGGTACGCTATGCGGAGTTCTACAGCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CGAGGCCATTGCCCACCTGCTGGAGACACACCTCATTGCTGAGGCCTTCT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110357 CGAGGCCATCGCCCACCTGCTGGAGACACACCTCATTGCTGAGGCCTTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCCTGGCCTTGCTGAGGAACCTGCCCATGTGCCACCCCCTCTACAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110407 GCCTGGCCTTGCTGAGGAACCTGCCCATGTGCCACCCCCTCTACAAGGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1276       CTCCTCATCCCCCATACCCGATACACCGTCCAGATCAACAGCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110457 ...CAGCTCCTCATCCCCCATACCCGATACACCGTCCAGATCAACAGCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGGCCGGGCCGTTCTCCTCAATGAGGGGGGGCTCTCTGCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110744 TGGCCGGGCCGTTCTCCTCAATGAGGGGGGGCTCTCTGCCAAGGTA...C

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1363   GGCATGTCCCTGGGCGTGGAAGGCTTTGCTGGGGTGATGGTACGGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111097 AGGGCATGTCCCTGGGCGTGGAAGGCTTTGCTGGGGTGATGGTACGGGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTGTCGGAGCTCACCTATGACAGCCTCTACCTCCCCAATGACTTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111147 CTGTCGGAGCTCACCTATGACAGCCTCTACCTCCCCAATGACTTTGTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GCGTGGGGTCCAGGACCTGCCTGGATATTACTACCGCGATGACAGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111197 GCGTGGGGTCCAGGACCTGCCTGGATATTACTACCGCGATGACAGCTTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CGGTGTGGAATGCACTGGAGAA         GTATGTGACGGAGATCATC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 111247 CGGTGTGGAATGCACTGGAGAAGTG...CAGGTATGTGACGGAGATCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ACCTATTATTACCCGAGTGACGCAGCCGTGGAGGGTGATCCGGAATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111746 ACCTATTATTACCCGAGTGACGCAGCCGTGGAGGGTGATCCGGAATTGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GTCTTGGGTGCAGGAAATATTTAAAGAGTGCCTCCTGGGGCGGGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111796 GTCTTGGGTGCAGGAAATATTTAAAGAGTGCCTCCTGGGGCGGGAGAGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CAG         GCTTCCCTAGGTGCTTGCGAACCGTGCCTGAGCTGATC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111846 CAGGTA...CAGGCTTCCCTAGGTGCTTGCGAACCGTGCCTGAGCTGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CGATATGTCACTATAGTCATCTACACCTGCTCTGCCAAGCACGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113724 CGATATGTCACTATAGTCATCTACACCTGCTCTGCCAAGCACGCTGCTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CAACACAGGCCAG         ATGGAGTTCACCGCCTGGATGCCCAACT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113774 CAACACAGGCCAGGTA...CAGATGGAGTTCACCGCCTGGATGCCCAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TCCCAGCGTCCATGCGGAATCCACCGATTCAGACTAAGGGGCTGACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114153 TCCCAGCGTCCATGCGGAATCCACCGATTCAGACTAAGGGGCTGACCACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTGGAGACCTTCATGGACACGTTGCCGGATGTGAAGACCACGTGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114203 CTGGAGACCTTCATGGACACGTTGCCGGATGTGAAGACCACGTGCATCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCTGCTGGTGCTCTGGACCCTCAGCCGAGAGCCTGACGACAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 114253 GCTGCTGGTGCTCTGGACCCTCAGCCGAGAGCCTGACGACAGGGTG...C

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1927   CGGCCCCTGGGACACTTCCCGGACATTCACTTCGTGGAGGAGGCCCCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114491 AGCGGCCCCTGGGACACTTCCCGGACATTCACTTCGTGGAGGAGGCCCCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CGGAGGAGCATAGAGGCGTTCCGCCAGCGCCTGAACCAGATCTCACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114541 CGGAGGAGCATAGAGGCGTTCCGCCAGCGCCTGAACCAGATCTCACACGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CATCCGCCAGCGCAACAAGTGCCTTCCCATCCCCTACTACTACCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114591 CATCCGCCAGCGCAACAAGTGCCTTCCCATCCCCTACTACTACCTGGACC

   2200     .    :    .    :    .
   2075 CGGTGCTGATTGAGAACAGCATTTCTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 114641 CGGTGCTGATTGAGAACAGCATTTCTATT