seq1 = pF1KE2056.tfa, 2076 bp
seq2 = pF1KE2056/gi568815579r_15254918.tfa (gi568815579r:15254918_15477016), 222099 bp

>pF1KE2056 2076
>gi568815579r:15254918_15477016 (Chr19)

(complement)

1-19  (97286-97304)   100% ->
20-58  (100003-100041)   100% ->
59-91  (102382-102414)   100% ->
92-371  (102952-103231)   100% ->
372-861  (103677-104166)   100% ->
862-991  (104670-104799)   100% ->
992-1038  (105019-105065)   100% ->
1039-1072  (106838-106871)   100% ->
1073-1160  (108695-108782)   100% ->
1161-1302  (114766-114907)   100% ->
1303-1396  (115195-115288)   100% ->
1397-1527  (116039-116169)   100% ->
1528-1623  (117955-118050)   100% ->
1624-2076  (121647-122099)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCAGGGCTACGGAG         GCTACGGGGCGTGGAGTGCTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  97286 ATGGACCAGGGCTACGGAGGTT...CAGGCTACGGGGCGTGGAGTGCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACCTGCCAACACCCAGG         GTGCATATGGAACTGGTGTGGCCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100025 ACCTGCCAACACCCAGGGTA...AAGGTGCATATGGAACTGGTGTGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GCTGGCAAG         GTTATGAAAACTACAATTACTATGGCGCCCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102406 GCTGGCAAGGTA...CAGGTTATGAAAACTACAATTACTATGGCGCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    124 AACACCAGTGTCACCACAGGCGCAACCTACAGCTACGGCCCAGCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102984 AACACCAGTGTCACCACAGGCGCAACCTACAGCTACGGCCCAGCCTCGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 GGAGGCCGCCAAGGCCAATGATGGCGGCCTGGCGGCCGGGGCCCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103034 GGAGGCCGCCAAGGCCAATGATGGCGGCCTGGCGGCCGGGGCCCCTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGCACATGGCCTCTTACGGCCCAGAGCCATGCACCGACAATTCCGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103084 TGCACATGGCCTCTTACGGCCCAGAGCCATGCACCGACAATTCCGACTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTCATTGCCAAGATCAACCAGCGTTTGGACATGATGTCCAAGGAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103134 CTCATTGCCAAGATCAACCAGCGTTTGGACATGATGTCCAAGGAAGGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAGGGGCGGGAGCGGCGGCGGTGGGGAGGGCATACAGGACCGGGAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103184 CAGGGGCGGGAGCGGCGGCGGTGGGGAGGGCATACAGGACCGGGAGAGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372        CTCCTTCCGCTTCCAGCCGTTCGAGTCCTATGACTCCAGGCCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103234 G...CAGCTCCTTCCGCTTCCAGCCGTTCGAGTCCTATGACTCCAGGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGCCTGCCGGAGCACAACCCCTACCGCCCCAGCTACAGCTACGACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103720 TGCCTGCCGGAGCACAACCCCTACCGCCCCAGCTACAGCTACGACTATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTTCGACCTGGGGTCCGACCGCAATGGCAGCTTTGGGGGGCAGTACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103770 GTTCGACCTGGGGTCCGACCGCAATGGCAGCTTTGGGGGGCAGTACAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AATGCCGAGACCCAGCCCGGGAGCGGGGCTCCCTTGATGGCTTCATGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103820 AATGCCGAGACCCAGCCCGGGAGCGGGGCTCCCTTGATGGCTTCATGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGCCGGGGCCAGGGCCGCTTCCAGGACCGGAGCAACCCTGGCACCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103870 GGCCGGGGCCAGGGCCGCTTCCAGGACCGGAGCAACCCTGGCACCTTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCGCAGCGACCCCTTCGTGCCCCCCGCTGCGTCCTCTGAGCCCCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103920 GCGCAGCGACCCCTTCGTGCCCCCCGCTGCGTCCTCTGAGCCCCTGTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGCCCTGGAACGAGCTGAACTACGTGGGTGGACGGGGCCTGGGAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103970 CGCCCTGGAACGAGCTGAACTACGTGGGTGGACGGGGCCTGGGAGGGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCCCCCAGCCGGCCACCTCCGTCCCTCTTCTCCCAGTCCATGGCTCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104020 TCCCCCAGCCGGCCACCTCCGTCCCTCTTCTCCCAGTCCATGGCTCCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTACGGCGTGATGGGCATGCAGGGGGCGGGCGGCTATGACAGCACCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104070 CTACGGCGTGATGGGCATGCAGGGGGCGGGCGGCTATGACAGCACCATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCTACGGATGTGGCCGCTCGCAGCCTCGGATGCGGGATCGGGATCGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 104120 CCTACGGATGTGGCCGCTCGCAGCCTCGGATGCGGGATCGGGATCGGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862       CCCAAGAGGAGAGGGTTTGACCGCTTCGGACCAGATGGCACGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104170 ...TAGCCCAAGAGGAGAGGGTTTGACCGCTTCGGACCAGATGGCACGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGGAAACGGAAGCAGTTCCAACTTTACGAGGAGCCAGACACCAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104714 CAGGAAACGGAAGCAGTTCCAACTTTACGAGGAGCCAGACACCAAACTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCGGGTTGACAGTGAAGGAGATTTCTCCGAAAATG         ATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104764 CCCGGGTTGACAGTGAAGGAGATTTCTCCGAAAATGGTA...CAGATGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCAGCTGGTGACTTCCGCTCAGGAGATGAAGAATTCAAGGGT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105024 GCAGCTGGTGACTTCCGCTCAGGAGATGAAGAATTCAAGGGTGTA...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1039  GAGGATGAACTCTGCGACTCTGGGAGGCAAAGAG         GAGAGA
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106837 GGAGGATGAACTCTGCGACTCTGGGAGGCAAAGAGGTA...CAGGAGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGGAGGACGAGGACGAGGATGTGAAGAAGAGAAGGGAAAAGCAAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108701 AGGAGGACGAGGACGAGGATGTGAAGAAGAGAAGGGAAAAGCAAAGGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGAGACAGGACGCGGGACCGTGCAGCCGACAG         AATTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 108751 AGAGACAGGACGCGGGACCGTGCAGCCGACAGGTG...CAGAATTCAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGCCTGTTCTGTATGCAAGTTCCGTAGCTTTGATGACGAAGAGATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114775 TGCCTGTTCTGTATGCAAGTTCCGTAGCTTTGATGACGAAGAGATCCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGCATCTGCAAAGCAAATTTCACAAAGAGACCCTGCGGTTCATAAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114825 AGCATCTGCAAAGCAAATTTCACAAAGAGACCCTGCGGTTCATAAGCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAGCTGCCCGACAAGACCGTGGAGTTCCTCCAG         GAATACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 114875 AAGCTGCCCGACAAGACCGTGGAGTTCCTCCAGGTA...TAGGAATACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGTAAACAGAAATAAGAAAATTGAGAAGCGGCGTCAGGAATTGATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115203 TGTAAACAGAAATAAGAAAATTGAGAAGCGGCGTCAGGAATTGATGGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AAGAAACCGCAAAACCAAAACCAGATCCTTTCAAAG         GGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115253 AAGAAACCGCAAAACCAAAACCAGATCCTTTCAAAGGTG...CAGGGATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGCCAGGAGCACTTCTTCAAGAAGATCGAGGCTGCTCACTGCCTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116044 GGCCAGGAGCACTTCTTCAAGAAGATCGAGGCTGCTCACTGCCTGGCCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CGACATGCTAATTCCTGCACAGCCGCAGCTCCTCCAGCGGCACCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116094 CGACATGCTAATTCCTGCACAGCCGCAGCTCCTCCAGCGGCACCTGCACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCGTGGACCACAATCACAACCGCAGG         TTGGCTGCTGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 116144 CCGTGGACCACAATCACAACCGCAGGGTG...CAGTTGGCTGCTGAACAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TTCAAGAAAACCAGTCTCCATGTGGCTAAGAGTGTTTTGAACAACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117970 TTCAAGAAAACCAGTCTCCATGTGGCTAAGAGTGTTTTGAACAACAGACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TATAGTGAAGATGCTGGAAAAATACCTCAAG         GGTGAGGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 118020 TATAGTGAAGATGCTGGAAAAATACCTCAAGGTT...CAGGGTGAGGACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CTTTCACCAGTGAAACTGTTGATCCAGAAATGGAAGGAGATGACAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121657 CTTTCACCAGTGAAACTGTTGATCCAGAAATGGAAGGAGATGACAATTTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GGAGGTGAGGATAAGAAAGAGACACCTGAGGAGGTGGCCGCGGACGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121707 GGAGGTGAGGATAAGAAAGAGACACCTGAGGAGGTGGCCGCGGACGTCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AGCAGAGGTGATTACAGCAGCAGTGAGGGCCGTAGATGGGGAAGGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121757 AGCAGAGGTGATTACAGCAGCAGTGAGGGCCGTAGATGGGGAAGGAGCGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CCGCTCCAGAGAGCAGCGGGGAGCCGGCTGAGGACGAAGGCCCCACGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121807 CCGCTCCAGAGAGCAGCGGGGAGCCGGCTGAGGACGAAGGCCCCACGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 ACAGCGGAGGCCGGTAGTGATCCTCAAGCCGAACAGCTGCTGGAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121857 ACAGCGGAGGCCGGTAGTGATCCTCAAGCCGAACAGCTGCTGGAAGAGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GGTGCCCTGTGGAACGGCACATGAGAAGGGCGTCCCCAAGGCCAGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121907 GGTGCCCTGTGGAACGGCACATGAGAAGGGCGTCCCCAAGGCCAGAAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AGGCTGCAGAGGCTGGAAATGGCGCCGAGACAATGGCAGCAGAGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121957 AGGCTGCAGAGGCTGGAAATGGCGCCGAGACAATGGCAGCAGAGGCAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AGTGCCCAAACCAGAGTTGCTCCTGCCCCAGCTGCCGCGGATGCTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122007 AGTGCCCAAACCAGAGTTGCTCCTGCCCCAGCTGCCGCGGATGCTGAAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GGAACAAACTGATGCAGAGTCTAAAGACGCTGTTCCCACAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122057 GGAACAAACTGATGCAGAGTCTAAAGACGCTGTTCCCACAGAA